陆地棉花发育EST测序分析及其相关基因筛选与微卫星标记开发
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-29页 |
| 1 短季棉及其早熟性 | 第11页 |
| 2 植物开花机理研究进展 | 第11-19页 |
| ·植物花发育的机理概况 | 第12页 |
| ·植物开花时间控制的分子机理 | 第12-18页 |
| ·棉花花发育研究进展 | 第18-19页 |
| 3 EST及其应用 | 第19-25页 |
| ·表达序列标签 | 第19-22页 |
| ·EST的应用 | 第22-24页 |
| ·陆地棉EST研究进展 | 第24-25页 |
| 4 EST-SSR的研究进展 | 第25-27页 |
| ·EST-SSR标记的开发 | 第25-26页 |
| ·植物EST-SSR标记的应用 | 第26-27页 |
| 5 本文研究的目的及意义 | 第27-29页 |
| ·立体依据及意义 | 第27-28页 |
| ·主要技术路线 | 第28-29页 |
| 第二章 陆地棉花发育EST大规模测序及分析 | 第29-44页 |
| 1 材料和方法 | 第30-32页 |
| ·中36均一化全长cDNA文库及其特点 | 第30页 |
| ·实验试剂 | 第30页 |
| ·实验仪器 | 第30页 |
| ·cDNA文库检测 | 第30-31页 |
| ·cDNA文库的复制与测序 | 第31页 |
| ·序列分析 | 第31-32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-41页 |
| ·文库质量检测 | 第32-33页 |
| ·EST测序及拼接 | 第33页 |
| ·EST序列特征 | 第33-35页 |
| ·新EST的确定分析 | 第35-36页 |
| ·基于EST序列的棉花花发育基因GC含量分析 | 第36-37页 |
| ·基因注释和功能分类 | 第37-41页 |
| 3 讨论 | 第41-44页 |
| ·花发育EST的有效获得 | 第41-42页 |
| ·新EST的比较筛选 | 第42页 |
| ·EST分析的准确性 | 第42-44页 |
| 第三章 陆地棉花发育相关基因筛选及表达分析 | 第44-69页 |
| 1 材料与方法 | 第44-52页 |
| ·植物材料及文库 | 第44页 |
| ·实验试剂 | 第44页 |
| ·实验仪器 | 第44-45页 |
| ·陆地棉花发育基因的筛选 | 第45页 |
| ·棉花各组织总RNA提取 | 第45-48页 |
| ·RNA的反转录 | 第48页 |
| ·花发育相关基因的克隆 | 第48-51页 |
| ·基因序列分析 | 第51页 |
| ·荧光定量PCR | 第51-52页 |
| 2 结果与分析 | 第52-67页 |
| ·根据基因注释查找花发育相关基因 | 第52页 |
| ·陆地棉花发育相关基因表达模式分析 | 第52-56页 |
| ·陆地棉花发育相关基因比较分析 | 第56-67页 |
| 3 讨论 | 第67-69页 |
| ·棉花RNA的提取 | 第67页 |
| ·陆地棉花发育基因的筛选 | 第67-68页 |
| ·基因的表达模式分析 | 第68-69页 |
| 第四章 棉花EST-SSR标记开发与验证 | 第69-80页 |
| 1 材料与方法 | 第70-74页 |
| ·植物材料 | 第70页 |
| ·实验试剂 | 第70-71页 |
| ·实验仪器 | 第71页 |
| ·EST-SSR位点的查找 | 第71页 |
| ·EST-SSR引物设计 | 第71页 |
| ·新EST-SSR的筛选 | 第71-72页 |
| ·棉花DNA的抽提 | 第72-73页 |
| ·PCR扩增、电泳及读带 | 第73页 |
| ·聚类分析 | 第73-74页 |
| 2 结果与分析 | 第74-78页 |
| ·新EST-SSRs的查找 | 第74页 |
| ·EST-SSRs的分布特征 | 第74-75页 |
| ·EST-SSR引物的验证 | 第75-76页 |
| ·EST-SSR引物的可转移性 | 第76-77页 |
| ·系统聚类分析 | 第77-78页 |
| 3 讨论 | 第78-80页 |
| ·EST-SSR的优点 | 第78页 |
| ·EST-SSR的特征分析 | 第78-79页 |
| ·EST-SSR的可转移性 | 第79-80页 |
| 第五章 结论及展望 | 第80-82页 |
| 1 本文主要结论 | 第80-81页 |
| 2 展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-91页 |
| 附录 | 第91-115页 |
| 1 附表 | 第91-114页 |
| 2 作者简介及在读期间科研成果 | 第114-115页 |
| 致谢 | 第115页 |
