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Dsn1对Rad16-Swi10和Dna2-Cdc24的活性调控在维持基因稳定性中的作用机理研究

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
第一章 引言第10-37页
   ·DNA损伤与修复第10-11页
   ·DNA双链断裂的修复机制第11-13页
   ·单链退火修复第13-15页
   ·核酸酶负责加工复制和修复过程中产生的DNA中间产物第15-32页
     ·Dna2在冈崎片段成熟过程中的作用第16-20页
     ·Exo1和STR-Dna2-RPA在DNA扩展剪切过程中的作用第20-25页
     ·Rad1-Rad10在核苷酸切除修复和单链退火修复等过程中的作用.第25-27页
     ·Slx1-Slx4在维持基因组稳定性中的作用第27-30页
     ·Mus81-Mms4/EME1在停滞复制叉的修复中的作用第30-32页
   ·核酸酶的调控在维持基因组稳定性中的作用第32-34页
     ·磷酸化/去磷酸化对MUS81-EME1和YEN1活性的调控第32页
     ·RPA以及Dna2的磷酸化对Dna活性和招募的调控第32-34页
     ·蛋白降解途径对Exo1的调控第34页
   ·研究的目的与意义第34-37页
第二章 研究材料与方法第37-54页
   ·仪器与试剂第37-38页
   ·培养基与溶液第38-39页
   ·菌株第39-40页
   ·常规操作与方法第40-54页
     ·随机孢子分析和四分子分析第40-41页
     ·裂殖酵母转化第41-42页
     ·菌落PCR第42页
     ·细胞同步化第42页
     ·显微镜观察蛋白在双链断裂损伤(DSB)位点定位第42-43页
     ·DNA损伤处理敏感性实验第43-44页
     ·3’非同源单链的检测第44-45页
     ·碘蒸气染色第45页
     ·染色质免疫沉淀第45-46页
     ·蛋白质印迹杂交第46-47页
     ·细胞内免疫共沉淀第47-48页
     ·裂殖酵母中过表达蛋白的纯化第48页
     ·大肠杆菌中蛋白的重组表达第48-49页
     ·酶活底物DNA的制备第49-50页
     ·细胞内源Rad16-Swi10的酶活检测第50-51页
     ·过表达纯化的Rad16-Swi10的酶活检测第51-52页
     ·过表达纯化的Dna2-Cdc24的酶活检测第52页
     ·凝胶阻滞实验第52-54页
第三章 研究结果第54-95页
   ·Dsn1介导Rad16-Swi10-Saw1和Dna2-Cdc24形成DSN复合体第54-59页
     ·Dsn1和Saw1是Rad16-Swi10和Dna2-Cdc24的结合因子第54-55页
     ·Dsn1介导Rad16-Swi10-Saw1和Dna2-Cdc24之间的相互作用第55-57页
     ·Dsn1通过不同的结构域与Rad16-Swi10和Dna2-Cdc24相结合第57-59页
   ·DSN复合体的不同亚基可以在DNA损伤位点定位第59-67页
     ·DSN复合体中各亚基均能够定位在DSB位点第60-62页
     ·Dsn1在DSB位点的募集依赖于Dna2-Cdc24第62-63页
     ·Rad16-Swi10在DSB位点的募集依赖于Dsn1第63-65页
     ·Rad16-Swi10能够稳定Dsn1在DSB位点的定位第65-67页
   ·Dsn1通过与Rad16-Swi10结合来促进单链退火修复的完成第67-76页
     ·Dsn1突变体对高剂量IR处理敏感第67-69页
     ·Dsn1而不是Saw1的缺失影响单链退火修复第69-72页
     ·Dsn1的缺失影响单链退火修复过程中3’非同源单链的切除第72-74页
     ·Dsn1与Rad16-Swi10复合体的结合促进单链退火修复中3’非同源单链的切除第74-76页
   ·Dsn1在交配型转换和Top1-ccDNA损伤修复中起作用第76-80页
     ·Dsn1通过与Rad16-Swi10的相互作用参与交配型转换第76-78页
     ·Rad16-Swi10-Dsn1和Tdpl在两个冗余的途径中促进top1-ccDNA的修复第78-80页
   ·Dsn1是Rad16-Swi10复合体的激活因子第80-83页
     ·Rad16-Swi10具有3’DNA内切酶活性第81-82页
     ·Dsn1是Rad16-Swi10的高效酶活所必须的因子第82页
     ·重组表达的Dsn1能够激活Rad16-Swi10的3’DNA内切酶活性第82-83页
   ·Dsn1抑制Dna2在DNA剪切过程中的作用第83-87页
     ·Dsn1的缺失能够抑制exo1△突变体中DNA剪切变慢的表型第83-84页
     ·Dsn1的缺失促进末端剪切的效应依赖于Rqh1第84-85页
     ·Dsn1对Dna2的抑制作用调控单链退火修复中同源模板的选择第85-87页
   ·Dsn1能够抑制RPA复合体对Dna2的激活第87-89页
     ·Dna2-Cdc24具有5'DNA内切酶第87-88页
     ·Dsn1(227-351)~r能够抑制RPA对Dna25’内切酶活性的激活第88页
     ·Dsn1(227-351)~r抑制Dna2-Cdc24复合体与RPA-DNA的结合第88-89页
   ·Dsn1的细胞周期调控有助于维持基因组的稳定性第89-95页
     ·Dsn1在细胞核内的信号受细胞周期调控第89-92页
     ·Dsn1的细胞周期失调会造成细胞对DNA损伤试剂敏感性提高第92页
     ·Dsn1的细胞周期失调抑制了Dna2在冈崎片段加工中的作用第92-95页
第四章 讨论第95-101页
   ·Dsn1作为支架蛋白与Rad16-Swi10-Saw1和Dna2-Cdc24相互作用第96-97页
   ·Dsn1而不是Saw1或Slx4与Rad16-Swi10一起促进单链退火修复的完成第97-98页
   ·Dsn1能够激活Rad16-Swi10的3’DNA内切酶活性第98-99页
   ·Dsn1抑制RPA对Dna25’DNA内切酶活性的激活第99-100页
   ·Dsn1的细胞周期调控在维持基因组稳定性中的作用第100-101页
参考文献第101-110页
致谢第110-112页

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