一种基于拉伸力最小化的拉伸分子动力学方法
摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-8页 |
1 绪论 | 第8-16页 |
·分子模拟概况 | 第8-9页 |
·分子动力学原理及其现状 | 第9-13页 |
·分子动力学原理 | 第9-11页 |
·分子动力学现状 | 第11-12页 |
·分子动力学研究的意义 | 第12-13页 |
·蛋白质-小分子和蛋白质-蛋白质复合物解离 | 第13页 |
·本文主要工作 | 第13-16页 |
2 分子动力学模拟 | 第16-30页 |
·分子动力学简史 | 第16-18页 |
·分子动力学理论基础 | 第18-19页 |
·分子动力学的算法 | 第19-21页 |
·分子动力学计算流程 | 第21-22页 |
·分子动力学力场及其发展 | 第22-25页 |
·分子动力计算的应用 | 第25页 |
·分子动力学模拟技术 | 第25-30页 |
3 带有方向优化的拉伸分子动力学 | 第30-38页 |
·引言 | 第30-31页 |
·模拟体系与预处理 | 第31-32页 |
·优化模型 | 第32页 |
·基于信息熵的多种群遗传算法 | 第32-36页 |
·程序流程 | 第36-38页 |
4 结果与讨论 | 第38-46页 |
·蛋白质-小分子复合物 | 第38-42页 |
·蛋白质-蛋白质复合物 | 第42-46页 |
结论 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-53页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第53-54页 |
致谢 | 第54-55页 |