基于KEGG的代谢通路最短路径问题的研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-15页 |
| ·课题背景 | 第8-10页 |
| ·功能基因组学 | 第8-9页 |
| ·研究路径和网络的必要性 | 第9-10页 |
| ·基因芯片技术 | 第10-13页 |
| ·基因芯片的制备 | 第10-11页 |
| ·基因芯片的使用 | 第11-12页 |
| ·芯片数据的处理和分析 | 第12-13页 |
| ·课题的目的和意义 | 第13-14页 |
| ·本文的研究内容 | 第14-15页 |
| 第2章 代谢通路最短路径近似匹配算法 | 第15-26页 |
| ·几种常见的功能注释体系 | 第15-18页 |
| ·KEGG | 第15-17页 |
| ·GenBank | 第17-18页 |
| ·代谢通路最短路径算法 | 第18-25页 |
| ·数据的预处理 | 第18-19页 |
| ·两个酶的路径挖掘 | 第19-20页 |
| ·多个酶最短路径挖掘 | 第20-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 特征基因挖掘技术 | 第26-39页 |
| ·基因表达谱 | 第26-29页 |
| ·常用的特征选择算法 | 第29-30页 |
| ·特征基因挖掘方法 | 第30-38页 |
| ·非参数检验方法 | 第30-34页 |
| ·参数检验方法 | 第34-35页 |
| ·嵌入法 | 第35页 |
| ·过滤法 | 第35-37页 |
| ·缠绕法 | 第37-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第4章 复杂疾病与代谢网络相关的基因簇挖掘 | 第39-48页 |
| ·引言 | 第39页 |
| ·特征选择方法 | 第39-40页 |
| ·方差分析 | 第39-40页 |
| ·t 检验 | 第40页 |
| ·基因簇的选取 | 第40-41页 |
| ·数据实验 | 第41-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 致谢 | 第53页 |