基于KEGG的代谢通路最短路径问题的研究
摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-8页 |
第1章 绪论 | 第8-15页 |
·课题背景 | 第8-10页 |
·功能基因组学 | 第8-9页 |
·研究路径和网络的必要性 | 第9-10页 |
·基因芯片技术 | 第10-13页 |
·基因芯片的制备 | 第10-11页 |
·基因芯片的使用 | 第11-12页 |
·芯片数据的处理和分析 | 第12-13页 |
·课题的目的和意义 | 第13-14页 |
·本文的研究内容 | 第14-15页 |
第2章 代谢通路最短路径近似匹配算法 | 第15-26页 |
·几种常见的功能注释体系 | 第15-18页 |
·KEGG | 第15-17页 |
·GenBank | 第17-18页 |
·代谢通路最短路径算法 | 第18-25页 |
·数据的预处理 | 第18-19页 |
·两个酶的路径挖掘 | 第19-20页 |
·多个酶最短路径挖掘 | 第20-25页 |
·本章小结 | 第25-26页 |
第3章 特征基因挖掘技术 | 第26-39页 |
·基因表达谱 | 第26-29页 |
·常用的特征选择算法 | 第29-30页 |
·特征基因挖掘方法 | 第30-38页 |
·非参数检验方法 | 第30-34页 |
·参数检验方法 | 第34-35页 |
·嵌入法 | 第35页 |
·过滤法 | 第35-37页 |
·缠绕法 | 第37-38页 |
·本章小结 | 第38-39页 |
第4章 复杂疾病与代谢网络相关的基因簇挖掘 | 第39-48页 |
·引言 | 第39页 |
·特征选择方法 | 第39-40页 |
·方差分析 | 第39-40页 |
·t 检验 | 第40页 |
·基因簇的选取 | 第40-41页 |
·数据实验 | 第41-47页 |
·本章小结 | 第47-48页 |
结论 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-53页 |
致谢 | 第53页 |