| 摘要 | 第1-5页 |
| SUMMARY | 第5-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-29页 |
| 1 抗病毒感染机制 | 第13-14页 |
| ·抗病毒感染的干扰素系统 | 第13-14页 |
| ·体液免疫 | 第14页 |
| ·细胞免疫 | 第14页 |
| 2 抗病育种 | 第14-17页 |
| ·畜禽抗病性的遗传基础 | 第15页 |
| ·抗性基因的来源 | 第15页 |
| ·抗病性的遗传机制 | 第15页 |
| ·抗病育种的途径 | 第15-17页 |
| ·比较基因组学研究方法 | 第16页 |
| ·寻找与抗性有关的侯选基因标记法 | 第16页 |
| ·数量性状的QTL 定位研究 | 第16-17页 |
| 3 鸡的抗病性基因 | 第17-24页 |
| ·MHC | 第17-21页 |
| ·鸡的MHC | 第18-19页 |
| ·MHC-B 区的抗病作用机理 | 第19页 |
| ·MHC 和鸡的抗病性和易感性 | 第19-21页 |
| ·鸡的MHC 单倍型命名 | 第21页 |
| ·Mx 基因和由其编码的 Mx 蛋白 | 第21-24页 |
| ·Mx 的结构 | 第21-22页 |
| ·Mx 基因的表达调控 | 第22-23页 |
| ·Mx 蛋白的抗病毒机理 | 第23页 |
| ·禽类Mx 基因与禽流感 | 第23-24页 |
| 4 分子遗传标记与动物育种 | 第24-29页 |
| ·分子遗传标记的类型 | 第25-27页 |
| ·RFLP 分析技术 | 第25页 |
| ·RAPD 分析技术 | 第25-26页 |
| ·AFLP 分析技术 | 第26页 |
| ·SSR 分析技术 | 第26页 |
| ·SNP 分析技术 | 第26-27页 |
| ·遗传标记在家畜育种中的应用 | 第27-29页 |
| ·基因定位 | 第27页 |
| ·构建遗传图谱 | 第27页 |
| ·标记辅助选择 | 第27-28页 |
| ·鉴定个体及其亲缘关系 | 第28-29页 |
| 第二章 基本实验材料和方法 | 第29-35页 |
| 1 实验材料 | 第29-33页 |
| ·样品的采集 | 第29-30页 |
| ·主要仪器设备 | 第30页 |
| ·主要试剂 | 第30-31页 |
| ·主要试剂配制 | 第31-33页 |
| ·DNA 提取相关试剂的配制 | 第31页 |
| ·琼脂糖及聚丙烯酰胺凝胶电泳所用相关试剂配制 | 第31-32页 |
| ·克隆所用的相关试剂 | 第32页 |
| ·测序PCR 产物纯化所用试剂 | 第32-33页 |
| 2 方法 | 第33-35页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第33页 |
| ·基因组DNA 纯度和浓度的检测 | 第33页 |
| ·PCR 扩增 | 第33-35页 |
| ·引物溶液的配制 | 第33-34页 |
| ·PCR 体系 | 第34-35页 |
| 第三章 鸡 Mx 基因编码序列 1892 位单核苷酸的多态性 | 第35-41页 |
| 1 前言 | 第35页 |
| 2 引物设计 | 第35页 |
| 3 实验方法 | 第35-37页 |
| ·含编码序列 1892 位 Mx 基因 DNA 片断的 PCR | 第35-36页 |
| ·PCR 反应体系及条件 | 第35-36页 |
| ·PCR 产物检测 | 第36页 |
| ·RFLP 分型 | 第36-37页 |
| ·内切酶Hpa I 消化PCR 产物 | 第36页 |
| ·PAGE | 第36页 |
| ·银染 | 第36-37页 |
| 4 结果与分析 | 第37-38页 |
| 5 讨论 | 第38-41页 |
| ·Mx 与禽流感抗病育种 | 第38-39页 |
| ·A/G 基因分型技术 | 第39-41页 |
| 第四章 鸡MHC 区域内微卫星DNA 的遗传多态性 | 第41-65页 |
| 1 前言 | 第41-42页 |
| 2 微卫星基因座 | 第42页 |
| 3 实验方法 | 第42-45页 |
| ·微卫星基因座PCR | 第42-43页 |
| ·PCR 反应体系及条件 | 第42-43页 |
| ·PCR 产物检测 | 第43页 |
| ·微卫星基因型判定 | 第43页 |
| ·毛细管电泳 | 第43页 |
| ·基因型判定 | 第43页 |
| ·微卫星测序 | 第43-45页 |
| ·PCR 产物测序 | 第43-44页 |
| ·克隆测序 | 第44-45页 |
| 4 数据分析 | 第45-46页 |
| ·遗传多样性分析 | 第45-46页 |
| ·核苷酸序列多态性分析 | 第46页 |
| ·聚类分析 | 第46页 |
| ·单倍型间的网络分析 | 第46页 |
| 5 结果与分析 | 第46-59页 |
| ·MCW0371 | 第46-51页 |
| ·片段分析结果 | 第46-47页 |
| ·序列特征 | 第47-51页 |
| ·LEI0258 和MCW0312 片段分析结果 | 第51-56页 |
| ·电泳结果 | 第51-52页 |
| ·等位基因 | 第52-56页 |
| ·群体内遗传变异 | 第56页 |
| ·LEI0258 等位基因核苷酸多态性 | 第56-58页 |
| ·LEI0258 等位基因序列特征 | 第56-58页 |
| ·LEI0258 等位基因与MHC 单倍型 | 第58页 |
| ·LEI0258 等位基因核苷酸序列的聚类分析 | 第58页 |
| ·MCW0312 等位基因核苷酸序列多态性 | 第58-59页 |
| 6 讨论 | 第59-65页 |
| ·微卫星的遗传变异与起源进化 | 第59-61页 |
| ·微卫星分型技术 | 第61页 |
| ·12 个群体的遗传多样性 | 第61-62页 |
| ·LEI0258、MCW0371 和MCW0312 在MHC-B 区的位置 | 第62-63页 |
| ·微卫星 PCR 产物中的影子产物(shadow product/band, DNA polymerase slippage product or stutter product/band) | 第63-64页 |
| ·LEI0258 的多态性 | 第64-65页 |
| 第五章 结论 | 第65-66页 |
| 1. 地方群体中MX 抗病纯合基因型（AA）和抗病基因（A）频率明显高于商品培育品种；地方群体中，西、南亚群体中MX抗病基因(A)的频率明显高于中国西北和韩国（东亚）群体 | 第65页 |
| 2. 根据LE10258 和MCW0312 片段分析结果，地方群体的遗传多样性大于商业培育品种；地方群体中西、南亚群体的遗传变异程度高于中国西北和韩国群体（东亚) | 第65页 |
| 3. MCW0371 的序列重复区呈FR1（A_N）和FR2（(AAC)_MA_N）两种模式 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-75页 |
| 个人简介 | 第75-76页 |
| 导师简介 | 第76-78页 |
