| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 术语及缩略语表 | 第11-13页 |
| 第一章 异形胞发育进化 | 第13-99页 |
| 1 前言及背景介绍 | 第13-33页 |
| ·蓝细菌简介 | 第13-15页 |
| ·蓝细菌基因组 | 第15-21页 |
| ·异形胞发育调控 | 第21-32页 |
| ·蓝细菌细胞分化形式 | 第21-22页 |
| ·异形胞的生理和结构特点 | 第22-23页 |
| ·异形胞发育过程 | 第23-31页 |
| ·异形胞调控网络 | 第31-32页 |
| ·异形胞进化 | 第32-33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-40页 |
| ·菌株及其一般培养条件 | 第33页 |
| ·生物学实验操作 | 第33-36页 |
| ·质粒构建 | 第33-35页 |
| ·Anabaena的转化 | 第35页 |
| ·Anabaena异形胞的诱导 | 第35页 |
| ·Arthrospira platensis的缺氮培养 | 第35-36页 |
| ·蓝细菌蛋白质抽提 | 第36页 |
| ·HetR蛋白的Western Blotting检测 | 第36页 |
| ·蓝细菌显微镜观察 | 第36页 |
| ·序列和基因组分析 | 第36-40页 |
| ·序列获取 | 第36-37页 |
| ·Arthrospira platensis基因预测 | 第37-38页 |
| ·Ortholog分析 | 第38-39页 |
| ·聚类分析 | 第39页 |
| ·结构域分析 | 第39-40页 |
| ·蛋白结合位点分析 | 第40页 |
| ·分析程序 | 第40页 |
| 3 结果与分析 | 第40-89页 |
| ·Anabaena PCC7120中已知的het基因 | 第40-41页 |
| ·het基因的分布 | 第41-53页 |
| ·早期调控及模式形成基因 | 第42页 |
| ·胞被形成相关基因 | 第42-46页 |
| ·固氮相关基因 | 第46-49页 |
| ·其他het基因 | 第49页 |
| ·小结:het基因的分布 | 第49-53页 |
| ·het基因的进化 | 第53-81页 |
| ·蓝细菌系统发育 | 第53-54页 |
| ·异形胞形成全局调控基因的进化 | 第54-59页 |
| ·固氮基因簇的进化 | 第59-61页 |
| ·胞被合成的进化 | 第61-77页 |
| ·其他基因的进化 | 第77-81页 |
| ·小结:het基因的进化特点 | 第81页 |
| ·hetR与patS基因的进化分析 | 第81-85页 |
| ·hetR在丝状蓝细菌普遍存在 | 第81-82页 |
| ·HetR序列的聚类分析 | 第82-83页 |
| ·丝状蓝细菌的patS基因 | 第83-85页 |
| ·arhetR和arpatS基因 | 第85-89页 |
| ·ArhetR在Arthrospira platensis中的表达 | 第85页 |
| ·arhetR和arpatS基因对异形胞分化的影响 | 第85-87页 |
| ·arhetR与arpatS在Anabaena PCC7120中的转录 | 第87-89页 |
| 4 讨论 | 第89-99页 |
| ·异形胞发育的早期调控网络 | 第89-92页 |
| ·异形胞发育调控网络的形成 | 第92-94页 |
| ·水平基因转移与异形胞进化 | 第94页 |
| ·基因组分析与未知的het基因 | 第94-98页 |
| ·展望 | 第98-99页 |
| 第二章 螺旋蓝细菌3′,5′-二磷酸核苷酸酶HalA的功能研究 | 第99-116页 |
| 1 前言 | 第99-102页 |
| ·生物的耐盐机制 | 第99-100页 |
| ·硫的同化过程 | 第100-101页 |
| ·PAPase及其生理功能 | 第101-102页 |
| ·硫代谢与生物耐盐的关系 | 第102页 |
| 2 材料与方法 | 第102-105页 |
| ·菌株和质粒 | 第102-103页 |
| ·蛋白的提取和纯化 | 第103-104页 |
| ·HalA的酶活测定 | 第104页 |
| ·序列及结构分析 | 第104页 |
| ·E.coli生长曲线测定 | 第104-105页 |
| 3 结果与分析 | 第105-113页 |
| ·halA基因的生物信息学分析 | 第105-107页 |
| ·halA基因在E.coli中的表达及产物纯化 | 第107-110页 |
| ·HalA表达载体构建 | 第107-108页 |
| ·HalA蛋白的表达 | 第108-109页 |
| ·HalA蛋白的纯化 | 第109-110页 |
| ·HalA的基本酶学性质 | 第110-112页 |
| ·各种因素对HalA的酶活性的影响 | 第110-111页 |
| ·HalA的酶学参数 | 第111-112页 |
| ·盐离子对HalA酶活性的影响 | 第112页 |
| ·halA基因对E.coli耐盐能力的影响 | 第112-113页 |
| 4 总结与讨论 | 第113-116页 |
| ·HalA与其它PAPase的比较 | 第113-114页 |
| ·HalA蛋白的结构与盐离子耐受性 | 第114-115页 |
| ·HalA与生物的耐盐能力 | 第115-116页 |
| ·展望 | 第116页 |
| 参考文献 | 第116-129页 |
| 附录 | 第129-156页 |
| 学术成果 | 第156-157页 |
| 致谢 | 第157页 |
