| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 前言 | 第7-18页 |
| 1 SNPs | 第7-14页 |
| ·SNPs的频率、分布与特征 | 第7-8页 |
| ·SNPs—群体遗传学研究的理想分子标记 | 第8-9页 |
| ·水稻(Oryza sativa L.)SNPs的研究进展 | 第9-14页 |
| ·水稻SNPs的挖掘现状和挖掘手段 | 第9-11页 |
| ·水稻SNPs的频率、分布与特征 | 第11-13页 |
| ·水稻SNPs与基因功能 | 第13-14页 |
| 2 单倍型 | 第14-16页 |
| ·单倍型的定义 | 第15页 |
| ·单倍型块状区与重组热点 | 第15-16页 |
| 3 本研究的主要内容、目的及意义 | 第16-18页 |
| 材料与方法 | 第18-23页 |
| 1 实验材料 | 第18页 |
| 2 DNA提取 | 第18-19页 |
| 3 引物设计与PCR扩增 | 第19-21页 |
| 4 DNA序列测定与分析 | 第21页 |
| 5 统计分析 | 第21-23页 |
| 结果与分析 | 第23-35页 |
| 1 SNPs | 第23-27页 |
| ·SNPs频率与分布 | 第23-25页 |
| ·不同基因位点的SNPs频率与分布 | 第23-24页 |
| ·不同基因功能区的SNPs频率与分布 | 第24-25页 |
| ·SNPs的碱基置换 | 第25页 |
| ·SNPs的等位基因频率 | 第25-27页 |
| 2 单倍型 | 第27-29页 |
| ·单倍型的数量与分布 | 第27页 |
| ·单倍型的基因多样性、分化系数、基因流 | 第27-29页 |
| ·单倍型的基因多样性 | 第27-28页 |
| ·单倍型的分化系数与基因流 | 第28-29页 |
| 3 水稻品种的聚类分析 | 第29-35页 |
| ·利用SNPs和单倍型的UPGMA聚类 | 第29-31页 |
| ·利用SNPs的Bayesian聚类 | 第31-35页 |
| 讨论 | 第35-41页 |
| 1 籼稻与粳稻在遗传结构上的差异 | 第35-37页 |
| ·SNPs频率和SNPs的等位基因频率的差异 | 第35-36页 |
| ·单倍型的基因多样性的差异与单倍型的分化 | 第36-37页 |
| 2 利用SNPs对水稻种质资源鉴定 | 第37-38页 |
| ·利用“核心”SNPs鉴定籼稻与粳稻 | 第37页 |
| ·利用SNPs和Bayesian聚类选择育种品种 | 第37-38页 |
| 3 利用SNPs和Bayesian聚类解析水稻的群体结构 | 第38-41页 |
| 致谢 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |