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嗜热毛壳菌热稳定纤维素酶(EGⅡ)的纯化及基因(cbh1、cbh2)的克隆和表达

摘要第1-13页
英文摘要第13-15页
前言第15-48页
 1 纤维素酶的研究进展第15-46页
   ·纤维素概述第15-16页
     ·纤维素的结构及构成第15页
     ·纤维素的降解第15-16页
   ·纤维素酶的研究进展第16-39页
     ·纤维素酶的组成第16-17页
     ·纤维素酶的分子结构第17-19页
     ·纤维素酶(系)的主要性质第19页
     ·纤维素酶立体化学催化机制第19-20页
     ·产纤维素酶微生物第20-21页
     ·纤维素酶的生产第21页
     ·纤维素酶的应用第21-23页
     ·纤维素酶的纯化研究第23-25页
     ·纤维素酶的基因克隆第25-35页
     ·纤维素酶基因的表达调控第35-39页
   ·巴斯德毕赤酵母Pichia pastoris表达系统第39-46页
     ·巴斯德毕赤酵母的特性第40-41页
     ·毕赤酵母宿主菌和表达载体的类型第41-43页
     ·表达载体在毕赤酵母中的整合第43-45页
     ·巴斯德毕赤酵母中信号肽的剪切过程第45-46页
 2 本研究的立论依据研究内容及意义第46-48页
第一章 Chaetomium thermophilum CT2内切β-葡聚糖酶(EGⅡ)的分离纯化第48-67页
 1.材料和方法第48-55页
   ·菌株与培养基第49页
     ·菌株第49页
     ·培养基第49页
     ·主要试剂第49页
   ·实验方法第49-55页
     ·培养条件及粗酶液的提取第49-50页
     ·酶活性测定第50页
     ·内切β-葡聚糖酶EGⅡ的分离纯化第50-51页
     ·蛋白质含量测定第51-52页
         ·0-100μg/mL标准曲线的制作第51-52页
       ·样品蛋白质浓度的测定第52页
       ·考马斯亮蓝G-250试剂的配制第52页
     ·纯度鉴定第52-53页
       ·电泳操作步骤第53页
     ·分子量的测定第53页
         ·凝胶电泳方法参照生物化学实验技术手册进行。第53页
         ·电泳迁移率的计算和标准曲线的制作第53页
         ·分子量测定第53页
     ·内切β-葡聚糖酶EGⅡ性质的研究第53-55页
 2.结果与分析第55-61页
   ·不同培养时间对产生内切β-葡聚糖EGⅡ酶的影响第55页
   ·C.thermophilum CT2内切β-葡聚糖酶EGⅡ的分离纯化及鉴定第55-58页
     ·Phenyl-Sepharose疏水柱层析第55-56页
     ·DEAE-Sepharose阴离子交换柱层析第56-57页
     ·内切β-葡聚糖酶EGⅡ纯化过程总表第57-58页
   ·内切β-葡聚糖酶EGⅡ的一般性质第58-61页
     ·内切β-葡聚糖酶EGⅡ的分子量第58页
     ·内切β-葡聚糖酶EGⅡ的最适反应温度第58-59页
     ·内切β-葡聚糖酶EGⅡ的最适反应pH值第59页
     ·内切β-葡聚糖酶EGⅡ的热稳定性第59-60页
     ·不同金属离子对内切β-葡聚糖酶EGⅡ活性的影响第60-61页
     ·N-端氨基酸序列分析第61页
 3.讨论第61-67页
   ·研究结果第62-63页
   ·研究方法第63-65页
   ·今后还应开展的工作第65-67页
第二章 嗜热毛壳菌CT2热稳定纤维二糖水解酶基因的克隆及在毕赤酵母中的高效表达第67-141页
 第一节:嗜热毛壳菌CT2热稳定纤维二糖水解酶Ⅱ基因的克隆及在毕赤酵母中的高效表达第67-115页
  1.材料和方法第68-88页
   ·材料第68-69页
     ·供试菌株第68页
     ·菌株与质粒第68页
     ·酶和生化试剂第68页
     ·仪器第68-69页
     ·溶液及培养基配制第69页
   ·嗜热毛壳菌纤维二糖水解酶Ⅱ基因的cDNA克隆第69-78页
     ·PCR引物第69-70页
     ·总RNA的提取(Trizol法)第70页
     ·反转录cDNA第一链的合成第70-71页
     ·目的基因cDNA中间片段的分离第71-75页
     ·目的基因3’末端的分离第75页
     ·目的基因5’末端的分离第75-77页
     ·目的基因全长cDNA的克隆第77页
     ·全长序列的生物信息学分析第77-78页
   ·嗜热毛壳菌纤维二糖水解酶Ⅱ Genomic DNA的克隆及序列分析第78-79页
     ·菌丝体DNA的抽提第78-79页
     ·嗜热毛壳菌genomic DNA PCR扩增第79页
     ·CBHⅡ的DNA序列分析第79页
   ·嗜热毛壳菌热稳定纤维二糖水解酶Ⅱ在毕赤酵母中的高效表达第79-88页
     ·纤维二糖水解酶CBHⅡ成熟肽基因序列的分离第79-80页
     ·酵母表达载体的构建第80页
     ·线性化质粒DNA制备第80-81页
     ·酵母转化第81-82页
     ·酵母转化子的筛选与鉴定第82-85页
     ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第85-86页
     ·酵母工程菌的培养和纤维二糖水解酶Ⅱ的诱导分泌表达第86页
     ·表达产物的生物学活性检测及表达产物的SDS-PAGE分析第86-87页
     ·纤维二糖水解酶Ⅱ工程菌表达产物的纯化及酶学性质第87-88页
  2 结果与分析第88-115页
   ·C.thermophilum CT2总RNA的提取第88-89页
   ·纤维二糖水解酶cbh2基因中间片段的分离第89-91页
     ·C.thermophilum CT2纤维二糖水解酶cbh2基因中间片段的分离第89-91页
   ·C.thermophilum CT2纤维二糖水解酶cbh2基因3’-末端cDNA的分离第91-92页
   ·C.thermophilum CT2纤维二糖水解酶Ⅱ基因cDNA5’-末端的分离第92-93页
   ·C.thermophilum CT2纤维二糖水解酶cbh2基因全长cDNA的分离及扩增片段的序列拼接第93-94页
   ·C.thermophilum CT2纤维二糖水解酶Ⅱgenomic DNA的扩增第94-98页
   ·纤维二糖水解酶Ⅱ基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第98-102页
     ·纤维二糖水解酶Ⅱ基因cbh2的核苷酸序列分析第98-99页
     ·纤维二糖水解酶Ⅱ基因cbh2的氨基酸序列分析第99-102页
   ·纤维二糖水解酶Ⅱ成熟肽基因序列的分离第102-103页
   ·纤维二糖水解酶Ⅱ基因cbh2在毕赤酵母中的表达第103-109页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第103-106页
     ·重组酵母表达质粒pPIC9K/cbh2转化Pichia pastoris GS115及酵母转化子的筛选第106-109页
   ·嗜热毛壳菌热稳定纤维二糖水解酶cbh2基因在Pichia pastoris中的高效表达及表达产物的检测第109-115页
     ·纤维二糖水解酶cbh2基因在Pichia pastoris中的诱导表达和高表达酵母菌株的筛选第109页
     ·纤维二糖水解酶Ⅱ酵母工程菌产酶SDS-PAG电泳分析第109页
     ·纤维二糖水解酶Ⅱ基因cbh2表达产物的分析第109-111页
     ·纤维二糖水解酶酵母工程菌的遗传稳定性分析第111页
     ·表达纤维二糖水解酶Ⅱ的纯化及酶学性质研究第111-115页
 第二节:嗜热毛壳菌热稳定纤维二糖水解酶Ⅰ在毕赤酵母中的高效表达第115-132页
  1 实验材料第115页
  2 实验方法第115-120页
   ·嗜热毛壳菌CT2纤维二糖水解酶cbh1基因的扩增、克隆及序列测定第115-117页
     ·嗜热毛壳菌总RNA的提取第115页
     ·引物设计第115-116页
     ·纤维二糖水解酶cbh1基因的PCR扩增第116页
     ·纤维二糖水解酶cbh1基因PCR产物的克隆及序列测定第116-117页
   ·纤维二糖水解酶基因cbh1重组酵母分泌型表达载体的构建和鉴定第117-119页
     ·cbh1重组酵母表达载体的构建第117页
     ·pPIC9K/cbh1阳性克隆的筛选和鉴定方法第117页
     ·重组表达质粒转化毕赤酵母及酵母转化子的筛选第117-118页
     ·酵母转化子的筛选与鉴定及多拷贝整合转化子筛选第118-119页
   ·嗜热毛壳菌CT2纤维二糖水解酶Ⅰ基因在毕赤酵母中的高效表达与表达产物的检测第119-120页
     ·酵母工程菌的培养和纤维二糖水解酶的诱导分泌表达第119页
     ·表达产物的生物学活性检测及表达产物的SDS-PAGE分析第119-120页
  3 实验结果与分析第120-132页
   ·嗜热毛壳菌纤维二糖水解酶Ⅰ基因的PCR扩增及序列测定第120-123页
     ·C.thermophilum CT2 RNA提取第120页
     ·纤维二糖水解酶cbh1基因的PCR扩增第120-121页
     ·纤维二糖水解酶Ⅰ基因扩增产物的克隆和重组质粒pGEM-T/cbh1 的酶切鉴定第121页
     ·嗜热毛壳菌纤维二糖水解酶cbh1基因序列测定与分析第121-123页
   ·嗜热毛壳菌纤维二糖水解酶cbh1基因分泌型重组酵母表达载体的构建和鉴定第123-127页
   ·重组酵母表达质粒pPIC9K/cbh1电击转化Pichia pastoris及酵母转化子的筛选第127-129页
     ·酵母转化子的甲醇利用表型筛选第127页
     ·酵母转化子的PCR鉴定第127-128页
     ·cbh1基因多拷贝整合子筛选第128-129页
   ·嗜热毛壳菌纤维二糖水解酶cbh1基因在Pichia pastoris中的高效表达与表达产物的检测第129-132页
     ·纤维二糖水解酶cbh1基因在Pichia pastoris中的诱导表达与高表达菌株的筛选第129页
     ·cbh1基因表达产物的SDS-PAGE分析和检测第129-130页
     ·纤维二糖水解酶Ⅰ基因cbh1表达产物的分析第130页
     ·表达纤维二糖水解酶Ⅰ最适合温度及温度稳定性第130-132页
 第三节 讨论与分析第132-141页
  1.嗜热毛壳菌C.thermophilum CT2总RNA提取第132页
  2 利用保守的氨基酸序列克隆纤维二糖水解酶等纤维素酶的策略第132-133页
  3 影响Pichia pastoris表达系统表达重组纤维二糖水解酶的因素第133-136页
  4.实现外源蛋白在毕赤酵母表达系统中高效表达的策略第136-141页
   ·目的基因的特性第136页
   ·启动子选择第136-137页
   ·mRNA的非翻译区(UTR)第137页
   ·起始密码子ATG的旁侧序列第137页
   ·表达菌株的甲醇利用表型与表达盒的染色体整合位点和方式第137-138页
   ·基因剂量第138页
   ·分泌表达第138-139页
   ·翻译后修饰第139页
   ·产物稳定性第139-140页
   ·发酵条件第140-141页
第三章 结论和建议第141-143页
 1 结论第141-142页
 2 建议第142-143页
参考文献第143-157页
致谢第157-158页
攻读硕士期间发表的论文和专利第158页

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