| 中文摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-13页 |
| 缩写词 | 第13-22页 |
| 上篇 | 第22-126页 |
| 第一章 绪论 | 第23-53页 |
| 1 植物基因组图谱的发展 | 第23-25页 |
| 1．1 遗传图谱 | 第23-24页 |
| 1．1．1 遗传标记与遗传图谱 | 第23页 |
| 1．1．2 经典遗传图谱 | 第23页 |
| 1．1．3 分子连锁图谱 | 第23-24页 |
| 1．2 物理图谱 | 第24-25页 |
| 1．2．1 限制酶切图谱 | 第24页 |
| 1．2．2 跨叠片段图谱 | 第24-25页 |
| 1．2．3 DNA序列图谱 | 第25页 |
| 2 用于分子遗传图谱构建的主要分子标记 | 第25-32页 |
| 2．1 RFLP与PCR-RFLP标记 | 第25-26页 |
| 2．1．1 RFLP技术 | 第25-26页 |
| 2．1．2 PCR-RFLP技术 | 第26页 |
| 2．2 RAPD与SCAR标记 | 第26-27页 |
| 2．3 SSR与ISSR标记 | 第27-28页 |
| 2．3．1 SSR技术 | 第27页 |
| 2．3．2 ISSR技术 | 第27-28页 |
| 2．4 AFLP标记 | 第28-29页 |
| 2．4．1 AFLP技术的原理 | 第28-29页 |
| 2．4．2 AFLP的技术关键 | 第29页 |
| 2．4．3 AFLP的技术特点 | 第29页 |
| 2．5 SNP标记 | 第29-32页 |
| 2．5．1 SNP的基本概念与特点 | 第30页 |
| 2．5．2 SNP的检测技术 | 第30-32页 |
| 3 分子遗传图谱的构建 | 第32-39页 |
| 3．1 作图群体的建立与选择 | 第32-37页 |
| 3．1．1 遗传作图对作图群体的基本要求 | 第32-33页 |
| 3．1．2 遗传作图常用的分离群体类型 | 第33-37页 |
| 3．2 分子连锁图谱绘制的方法与原理 | 第37-39页 |
| 3．2．1 连锁基因的交换与重组 | 第37页 |
| 3．2．2 连锁作图的数据分析方法 | 第37-39页 |
| 4 分子标记连锁图谱在植物遗传研究中的应用 | 第39-42页 |
| 4．1 应用于基因定位 | 第39-40页 |
| 4．1．1 质量性状基因的定位 | 第39-40页 |
| 4．1．2 数量性状基因的定位 | 第40页 |
| 4．2 应用于图位克隆 | 第40-41页 |
| 4．3 应用于辅助育种 | 第41页 |
| 4．4 应用于比较基因组学研究 | 第41-42页 |
| 5 茶树分子连锁图谱及遗传亲缘关系的研究概况 | 第42-44页 |
| 5．1 茶树分子连锁图谱的研究概况 | 第42-43页 |
| 5．2 茶树种质资源遗传亲源关系的研究概况 | 第43-44页 |
| 6 本研究的目的与意义 | 第44-45页 |
| 7 本研究的技术路线 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-53页 |
| 第二章 茶树基因组DNA的高效提取与鲜叶保存方法研究 | 第53-60页 |
| 1 材料与方法 | 第53-54页 |
| 1．1 试验材料及鲜叶保存方法 | 第53-54页 |
| 1．2 试验方法 | 第54页 |
| 1．2．1 DNA提取方法 | 第54页 |
| 1．2．2 DNA质量检测 | 第54页 |
| 2 结果与分析 | 第54-55页 |
| 2．1 4种方法提取茶树基因组DNA的效果比较 | 第54-55页 |
| 2．2 鲜叶保存方法对茶树基因组DNA提取质量的影响 | 第55页 |
| 3 讨论 | 第55-58页 |
| 3．1 对4种DNA提取方法的改进 | 第55-56页 |
| 3．2 不同方法提取DNA的效果分析 | 第56-57页 |
| 3．3 不同嫩度材料对DNA提取效果的影响 | 第57页 |
| 3．4 检测DNA纯度的最佳方法选择 | 第57页 |
| 3．5 鲜叶保存方法对DNA提取效果的影响 | 第57-58页 |
| 4 本章小结 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-60页 |
| 第三章 茶树AFLP-银染技术体系与品种指纹图谱的建立 | 第60-76页 |
| 1 材料与方法 | 第60-65页 |
| 1．1 试验材料、仪器与试剂 | 第60页 |
| 1．2 试验方法 | 第60-65页 |
| 1．2．1 基因组DNA提取及质量检测 | 第60-61页 |
| 1．2．2 AFLP技术体系的优化 | 第61-65页 |
| 2 结果与分析 | 第65-72页 |
| 2．1 模板DNA的制备与纯度检测 | 第65页 |
| 2．2 AFLP反应体系的优化 | 第65-66页 |
| 2．3 AFLP反应程序的优化 | 第66-68页 |
| 2．4 茶树AFLP最优技术体系的建立 | 第68-71页 |
| 2．4．1 模板DNA双酶切与连接优化体系 | 第68页 |
| 2．4．2 DNA片段的预扩增优化体系 | 第68页 |
| 2．4．3 DNA片段的选择性扩增优化体系 | 第68-69页 |
| 2．4．4 茶树AFLP-银染技术体系的建立 | 第69-71页 |
| 2．5 茶树AFLP-银染技术在指纹图谱构建中的应用 | 第71-72页 |
| 3 讨论 | 第72-74页 |
| 3．1 茶树AFLP-银染显色技术成败的关键 | 第72-73页 |
| 3．2 茶树AFLP-银染显色技术的优越性 | 第73页 |
| 3．3 AFLP指纹技术适用于茶树种质鉴定 | 第73-74页 |
| 4 本章小结 | 第74页 |
| 参考文献 | 第74-76页 |
| 第四章 茶树AFLP分子连锁图谱的构建 | 第76-97页 |
| 1 材料与方法 | 第76-78页 |
| 1．1 试验材料、仪器与试剂 | 第76-77页 |
| 1．2 试验方法 | 第77-78页 |
| 1．2．1 基因组DNA提取及质量检测 | 第77页 |
| 1．2．2 AFLP技术与选扩引物筛选 | 第77页 |
| 1．2．3 数据收集、编码与方差分析 | 第77页 |
| 1．2．4 连锁分析与图谱构建 | 第77-78页 |
| 2 结果与分析 | 第78-91页 |
| 2．1 模板DNA的纯度检测 | 第78页 |
| 2．2 AFLP引物筛选 | 第78-80页 |
| 2．3 AFLP标记在F_1代群体的多态性 | 第80-81页 |
| 2．4 AFLP标记在F_1代群体中的分离方式 | 第81-86页 |
| 2．4．1 孟德尔分离标记 | 第81-82页 |
| 2．4．2 偏孟德尔分离标记 | 第82页 |
| 2．4．3 异常分离标记 | 第82-86页 |
| 2．5 茶树AFLP分子连锁图谱的构建 | 第86-91页 |
| 2．5．1 祁门4号AFLP分子标记图谱构建 | 第86-89页 |
| 2．5．2 潮安大乌叶AFLP分子标记图谱构建 | 第89-91页 |
| 2．5．3 父、母本AFLP分子标记图谱的同源连锁群分析 | 第91页 |
| 3 讨论 | 第91-93页 |
| 3．1 对本研究所用作图群体的评价 | 第91页 |
| 3．2 偏孟德尔分离与异常分离标记产生的原因 | 第91-92页 |
| 3．3 关于零重组率AFLP标记的检出 | 第92-93页 |
| 3．4 连锁群上标记分布的不均匀现象 | 第93页 |
| 3．5 关于连锁群与染色体的对应关系 | 第93页 |
| 4本章小结 | 第93-94页 |
| 参考文献 | 第94-97页 |
| 第五章 茶树RAPD与ISSR分子图谱构建及其与AFLP标记图谱的整合 | 第97-115页 |
| 1 材料与方法 | 第97-99页 |
| 1．1 试验材料、仪器与试剂 | 第97-98页 |
| 1．2 试验方法 | 第98-99页 |
| 1．2．1 基因组DNA提取及质量检测 | 第98页 |
| 1．2．2 ISSR技术与引物筛选 | 第98-99页 |
| 1．2．3 RAPD技术与引物筛选 | 第99页 |
| 1．2．4 数据收集、编码、方差分析及图谱构建 | 第99页 |
| 2 结果与分析 | 第99-112页 |
| 2．1 ISSR与RAPD引物筛选 | 第99-101页 |
| 2．1．1 ISSR引物筛选 | 第100页 |
| 2．1．2 RAPD引物筛选 | 第100-101页 |
| 2．2 ISSR、RAPD标记在F_1代群体的分离 | 第101-105页 |
| 2．2．1 ISSR标记在F_1代群体的分离 | 第102-103页 |
| 2．2．2 RAPD标记在F_1代群体的分离 | 第103-105页 |
| 2．3 茶树RAPD与ISSR分子图谱构建 | 第105-108页 |
| 2．3．1 祁门4号RAPD与ISSR分子标记图谱构建 | 第105-106页 |
| 2．3．2 潮安大乌叶RAPD与ISSR分子标记图谱构建 | 第106页 |
| 2．3．3 父、母本RAPD与ISSR分子图谱中的同源连锁群分析 | 第106-108页 |
| 2．4 茶树AFLP、RAPD与ISSR分子标记综合图谱构建 | 第108-112页 |
| 2．4．1 祁门4号AFLP、RAPD与ISSR标记综合图谱构建 | 第108页 |
| 2．4．2 潮安大乌叶AFLP、RAPD与ISSR标记综合图谱构建 | 第108页 |
| 2．4．3 父、母本分子图谱中的同源连锁群分析 | 第108-112页 |
| 3 讨论 | 第112-113页 |
| 3．1 不同分子标记方法对F_1群体多态性检出效率的比较 | 第112页 |
| 3．2 不同分子标记方法用于茶树遗传图谱构建的效率比较 | 第112页 |
| 3．3 本研究所建图谱与已发表的茶树分子图谱的比较 | 第112-113页 |
| 4 本章小结 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-115页 |
| 第六章 茶树种质资源遗传多样性与亲缘关系的AFLP分析 | 第115-126页 |
| 1 材料与方法 | 第115-117页 |
| 1．1 试验材料、仪器与试剂 | 第115页 |
| 1．2试验方法 | 第115-117页 |
| 1．2．1 基因组DNA提取及质量检测 | 第115页 |
| 1．2．2 AFLP分析 | 第115页 |
| 1．2．3 数据处理 | 第115-117页 |
| 2 结果与分析 | 第117-122页 |
| 2．1 AFLP扩增结果的多态性分析 | 第117-118页 |
| 2．2 茶树品种(株系)之间的遗传距离 | 第118-121页 |
| 2．3 40个茶树品种(株系)的聚类分析 | 第121-122页 |
| 3 讨论 | 第122-123页 |
| 3．1 银染-AFLP技术在茶树遗传亲缘关系研究中的高效性 | 第122页 |
| 3．2 统计分析结果与理论期望值的比较分析 | 第122-123页 |
| 4 本章小结 | 第123-124页 |
| 参考文献 | 第124-126页 |
| 下篇 | 第126-171页 |
| 第一章 绪论 | 第127-139页 |
| 1 植物PPO基因的克隆 | 第127-128页 |
| 2 植物PPO基因的结构特点 | 第128-132页 |
| 2．1 PPO基因的家族特性 | 第129页 |
| 2．2 PPO基因编码铜离子结合区序列的高度保守性 | 第129-132页 |
| 2．3 PPO基因编码质体转移多肽的序列 | 第132页 |
| 2．4 PPO基因基本没有内含子序列 | 第132页 |
| 3 植物PPO基因的表达 | 第132-134页 |
| 3．1 PPO基因的表达大多在翻译后有一加工过程 | 第132-133页 |
| 3．2 PPO基因表达的时空特异性 | 第133-134页 |
| 3．3 PPO基因的遗传转化与修饰表达 | 第134页 |
| 4 茶树多酚氧化酶基因的研究 | 第134-135页 |
| 5 本研究的目的与意义 | 第135-136页 |
| 6 本研究的技术路线 | 第136-137页 |
| 参考文献 | 第137-139页 |
| 第二章 茶树多酚氧化酶基因的SNP搜寻 | 第139-157页 |
| 1 材料与方法 | 第139-143页 |
| 1．1 试验材料、仪器与试剂 | 第139页 |
| 1．2 试验方法 | 第139-143页 |
| 1．2．1 基因组DNA提取及质量检测 | 第139页 |
| 1．2．2 PCR-SSCP分析 | 第139-143页 |
| 1．2．3 DNA序列测定及同源性分析 | 第143页 |
| 2 结果与分析 | 第143-154页 |
| 2．1 PCR-SSCP方法的建立与优化 | 第143-146页 |
| 2．1．1 不同引物的最佳退火温度选择 | 第143-144页 |
| 2．1．2 不同引物的PCR扩增结果 | 第144页 |
| 2．1．3 SSCP检测SNP方法的优化 | 第144-146页 |
| 2．2 茶树多酚氧化酶基因的单链构象多态性 | 第146页 |
| 2．3 DNA序列分析检测SNP及酶切位点变异 | 第146-154页 |
| 2．3．1 引物L1／L2扩增片段中的SNP及酶切位点变异 | 第147页 |
| 2．3．2 引物L3／L4扩增片段中的SNP及酶切位点变异 | 第147-149页 |
| 2．3．3 引物L5/L6扩增片段中的SNP及酶切位点变异 | 第149-150页 |
| 2．3．4 引物L7／L8扩增片段中的SNP及酶切位点变异 | 第150-152页 |
| 2．3．5 引物L9／L10扩增片段中的SNP及酶切位点变异 | 第152页 |
| 2．3．6 新发现的氨基酸变异 | 第152-154页 |
| 3 讨论 | 第154-155页 |
| 3．1 关于PCR-SSCP检测方法 | 第154-155页 |
| 3．2 茶树多酚氧化酶基因的多态性与新等位基因 | 第155页 |
| 4 本章小结 | 第155-156页 |
| 参考文献 | 第156-157页 |
| 第三章 茶树多酚氧化酶基因的PCR-RFLP分析 | 第157-171页 |
| 1 材料与方法 | 第157-160页 |
| 1．1 试验材料、仪器与试剂 | 第157页 |
| 1．2 试验方法 | 第157-160页 |
| 1．2．1 引物设计 | 第157页 |
| 1．2．2 PCR扩增及产物检测 | 第157-160页 |
| 1．2．3 PCR产物的RFLP分析 | 第160页 |
| 2 结果与分析 | 第160-168页 |
| 2．1 不同引物的PCR扩增结果 | 第160页 |
| 2．2 多酚氧化酶基因的PCR-RFLP分析 | 第160-168页 |
| 2．2．1 BsuR Ⅰ酶切位点在不同品种中的多态性 | 第160-162页 |
| 2．2．2 HpaⅡ酶切位点在不同品种中的多态性 | 第162-164页 |
| 2．2．3 TaqⅠ酶切位点在不同品种中的多态性 | 第164-166页 |
| 2．2．4 HpaⅡ酶切位点在祁门4号×潮安大乌叶F_1代群体中的分离 | 第166-168页 |
| 3 讨论 | 第168-169页 |
| 3．1 PCR-RFLP技术在茶树基因分型研究中的应用 | 第168页 |
| 3．2 多酚氧化酶基因的PCR-RFLP特征与品种遗传背景的关系 | 第168-169页 |
| 3．3 多酚氧化酶基因在HpaⅡ酶切位点的多态性与品种适制性的关系 | 第169页 |
| 4 本章小结 | 第169-170页 |
| 参考文献 | 第170-171页 |
| 全文总结 | 第171-176页 |
| 1 主要研究结果 | 第171-173页 |
| 2 主要创新之处 | 第173-174页 |
| 3 展望 | 第174-176页 |
| 附录1 AFLP标记在F_1群体的偏分离分析统计表 | 第176-182页 |
| 附录2 部分测序报告 | 第182-192页 |
| 致谢 | 第192-193页 |
| 在读期间的主要成果 | 第193-194页 |
