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单链寡核苷酸介导基因定点修复的作用机制研究

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-12页
前言第12-24页
 1.基因治疗策略概述第12-17页
  a 病毒载体介导的基因添加策略的研究现状第12-14页
  b 基于同源重组技术的基因修复策略的研究现状第14-16页
  c 寡核苷酸基因疗法进展第16-17页
 2.寡核苷酸介导的基因定点修复第17-20页
  a 杂合寡核苷酸介导的基因定点修复第17-19页
  b 单链DNA寡核苷酸介导的基因定点修复第19-20页
 3.定点修复机制研究的进展第20-22页
 4.本课题的设计概述第22-24页
材料与方法第24-43页
 一、材料第24-26页
  1.菌株与质粒第24页
  2.细胞系第24页
  3.限制性内切酶及其它修饰酶类第24页
  4.转染试剂第24页
  5.寡核苷酸第24页
  6.抗体第24-25页
  7.其它主要试剂及试剂盒第25页
  8.主要仪器设备第25页
  9.放射性核素第25-26页
 二、实验方法第26-43页
  基本技术路线流程图第26页
  1.质粒的构建第26-29页
   1.1.酶切反应第26页
   1.2.DNA片段回收第26-27页
   1.3.DNA片段3’凹端的补平第27页
   1.4.DNA片段3’凸端的削平第27页
   1.5.载体的脱磷酸化第27页
   1.6.连接反应第27-28页
   1.7.感受态大肠杆菌细胞制备第28页
   1.8.转化第28页
   1.9.质粒DNA的小量制备第28页
   1.10.质粒DNA的大量制备第28-29页
  2.细胞培养第29页
   2.1 G418溶液的配制第29页
   2.2 细胞生长条件第29页
   2.3 细胞传代第29页
   2.4 细胞复苏及冻存第29页
  3.电穿孔法转染DNA第29-30页
  4.Southern Blot分析第30-32页
   4.1 基因组DNA的提取第30页
   4.2 Southern Blot分析第30-32页
    4.2.1 酶解第31页
    4.2.2 电泳第31页
    4.2.3.转膜第31页
    4.2.4.预杂交第31页
    4.2.5 DNA探针标记第31页
    4.2.6 杂交第31页
    4.2.7 洗膜及放射自显影第31-32页
  5.寡核苷酸的基因转移第32-33页
   5.1.Lipofectamine 2000法转染DNA第32页
   5.2.Oligofectamine法转染DNA第32页
   5.3.Effectene法转染DNA第32-33页
  6.荧光显微镜下观察定点修复的发光细胞第33页
  7.FACS定量分析发光细胞比例第33页
  8.寡核苷酸介导基因定点修复的细胞周期定位第33-34页
   8.1.细胞周期同步化试剂的配置第33页
   8.2.细胞周期同步化第33-34页
    8.2.1.去血清培养使细胞同步于G0期第33页
    8.2.2.Mimosine使细胞同步于G1晚期第33-34页
    8.2.3.Thymidine使细胞同步于S期及G1/S交界处第34页
    8.2.4.Nocodazole使细胞同步于分裂期第34页
  9.流式细胞仪测定细胞DNA含量第34-35页
   9.1.收集细胞第34页
   9.2.PI染色法测定细胞周期第34-35页
  10.PCR扩增待检测片段第35页
   10.1.从哺乳动物细胞中分离基因组DNA第35页
   10.2.PCR反应引物的设计及序列第35页
  11.等位基因特异PCR法检测寡核苷酸的基因定点突变第35-37页
  12.限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)分析定点突变作用第37页
  13.流式细胞仪分选富集纠正后的发光细胞第37页
  14.免疫组织化学检测细胞GFP蛋白的表达状况第37-38页
  15.菌落杂交鉴定修复基因第38-39页
   15.1.巢式PCR扩增待测片段插入T载体第38页
   15.2.细菌转化第38页
   15.3.将菌落影印至NC膜上第38页
   15.4.菌落的裂解与DNA的固定第38页
   15.5.寡核苷酸探针的设计与合成第38-39页
   15.6.杂交第39页
  16.Western blotting检测GFP蛋白的表达水平第39-42页
   16.1.裂解细胞第39-40页
   16.2.SDS-PAGE电泳第40-41页
   16.3.电转移第41页
   16.4.杂交第41-42页
  17.半定量RT-PCR检测基因的mRNA表达水平第42-43页
   17.1 从细胞中提取细胞总RNA第42页
   17.2 反转录成cDNA第一链第42页
   17.3 半定量RT-PCR第42-43页
实验结果第43-73页
 一、哺乳动物细胞EGFP荧光报告系统的建立第43-47页
  1.突变EGFP基因,构建真核表达质粒第43-45页
  2.HeLa-mEGFP细胞株的建立第45-47页
 二、寡核苷酸进行基因定点修复第47-52页
  1.针对mEGFP突变位点合成打靶分子第47-50页
  2. 针对mEGFP基因点突变的基因定点修复第50-52页
 三、单链寡核苷酸介导的基因定点修复的机制研究第52-65页
  1.细胞周期同步化第52-53页
  2.基因定点修复反应在细胞周期中的定位第53-54页
  3.复制抑制与S期修复效率的相关性分析第54-55页
  4.Thymidine介导的复制停滞时间与修复效率的相关性分析第55-58页
  5.转染前Thymidine抑制时间与修复效率的关系第58-60页
  6.RT-PCR检测Rad51和P53在thymidine作用下的表达变化第60-61页
  7.Thymidine作用下DNA合成的渗漏现象第61-62页
  8.复制叉渗漏与提高修复效率的相关性分析第62-64页
  9.S期基因定点修复的链偏向性分析第64-65页
 四、多水平检测寡核苷酸介导的靶向基因定点修复第65-73页
  1.等位基因特异PCR法检测寡核苷酸的基因定点突变第65-67页
  2.流式分选的荧光细胞DNA水平的分析第67-69页
  3.细菌克隆杂交筛选纠正基因第69-70页
  4.DNA测序第70页
  5.免疫组化与蛋白印迹检测EGFP蛋白的表达第70-73页
讨论第73-80页
 一、利用荧光报告系统研究基因定点修复的优越性第73-74页
 二、揭示寡核苷酸的作用机制是提高修复效率的根本条件第74-75页
 三、S期中的寡核苷酸第75-77页
 四、复制叉配对寡核苷酸掺入假说第77-78页
 五、寡核苷酸作用中链的偏向性分析第78-79页
 六、基因定点修复策略的应用前景第79-80页
小结第80-81页
参考文献第81-85页
文献综述第85-101页
英文名词及缩写第101-102页
个人简历第102-103页
致谢第103页

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