| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·DNA序列数据压缩的意义和研究现状 | 第10-12页 |
| ·论文的研究内容 | 第12页 |
| ·论文的研究意义 | 第12-13页 |
| ·论文的组织安排 | 第13-14页 |
| ·论文中术语的约定 | 第14-15页 |
| ·本章小结 | 第15-16页 |
| 第二章 DNA序列数据的特点及其压缩算法 | 第16-24页 |
| ·DNA序列数据的特点及其冗余特性的分析 | 第16-17页 |
| ·传统压缩算法概述 | 第17-18页 |
| ·现有DNA序列数据的主要压缩算法 | 第18-23页 |
| ·BioCompress | 第19-20页 |
| ·Cfact | 第20-21页 |
| ·GenCompress | 第21-23页 |
| ·DNACompress | 第23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 变换编码及其在DNA序列压缩中的应用 | 第24-42页 |
| ·哈尔（Haar）小波及在DNA序列压缩中的应用 | 第24页 |
| ·哈尔小波函数 | 第24页 |
| ·DNA序列的哈尔小波变换 | 第24-27页 |
| ·Burrows Wheeler变换 | 第27-36页 |
| ·Burrows Wheeler变换算法的原理 | 第27-33页 |
| ·Burrows Wheeler变换算法的实现 | 第33-36页 |
| ·MTF（Move To Front） | 第36-39页 |
| ·BWT结合MTF在DNA序列压缩中的改进 | 第39-40页 |
| ·本章小结 | 第40-42页 |
| 第四章 熵编码及其在DNA序列压缩中的应用 | 第42-54页 |
| ·Huffman编码 | 第42-44页 |
| ·利用Huffman编码压缩DNA序列 | 第44-45页 |
| ·算术编码算法 | 第45-50页 |
| ·算术编码算法的原理 | 第45-47页 |
| ·算术编码算法的实现 | 第47-50页 |
| ·利用算术编码压缩DNA序列 | 第50-51页 |
| ·利用BWT压缩DNA序列 | 第51-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 第五章 算法实验与比较分析 | 第54-58页 |
| ·BWT+MTF+Huffman编码与DNACompress的横向比较 | 第54-55页 |
| ·BWT+MTF+算术编码与DNACompress的横向比较 | 第55-56页 |
| ·本章小结 | 第56-58页 |
| 第六章 总结与展望 | 第58-60页 |
| ·本文的主要工作 | 第58页 |
| ·进一步的研究工作 | 第58-60页 |
| 致谢 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-64页 |