| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 引言 | 第11-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-25页 |
| ·树麻雀的研究概况 | 第13-17页 |
| ·树麻雀的生物学及生态学研究概况 | 第13-15页 |
| ·树麻雀的亚种分类 | 第15页 |
| ·树麻雀的历史回顾和保护现状 | 第15-17页 |
| ·研究方法概述 | 第17-25页 |
| ·遗传多样性及种群结构概述 | 第17-18页 |
| ·种群遗传结构分析的方法 | 第18-20页 |
| ·鸟类系统进化研究概述 | 第20-21页 |
| ·分子标记技术概述 | 第21-23页 |
| ·动物线粒体DNA分子标记技术的概述 | 第23-24页 |
| ·本文选用的分子标记 | 第24-25页 |
| 2 河北省树麻雀遗传多样性分析 | 第25-45页 |
| ·材料与方法 | 第25-26页 |
| ·样品的来源 | 第25页 |
| ·样品的保存方法 | 第25页 |
| ·实验方法 | 第25-26页 |
| ·实验仪器与试剂 | 第26页 |
| ·实验仪器 | 第26页 |
| ·实验试剂 | 第26页 |
| ·引物设计、PCR扩增及扩增产物检测 | 第26-28页 |
| ·引物设计 | 第26-27页 |
| ·PCR扩增 | 第27页 |
| ·PCR产物检测、回收及测序 | 第27-28页 |
| ·数据分析 | 第28-30页 |
| ·DNA序列的校正与比对 | 第28-29页 |
| ·遗传多样性分析 | 第29-30页 |
| ·结果与分析 | 第30-42页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第30页 |
| ·D-loop基因部分序列扩增及回收结果 | 第30-31页 |
| ·测序及比对结果 | 第31-33页 |
| ·碱基组成 | 第33页 |
| ·遗传多样性分析 | 第33-35页 |
| ·单倍型类型及其分布 | 第35-38页 |
| ·种群的遗传分化 | 第38-41页 |
| ·种群的历史分析 | 第41-42页 |
| ·讨论 | 第42-45页 |
| ·基因组DNA的提取方法 | 第42页 |
| ·PCR产物电泳图 | 第42页 |
| ·基因序列组成 | 第42-43页 |
| ·遗传多样性 | 第43页 |
| ·种群的遗传分化及历史分析 | 第43-45页 |
| 3 基于细胞色素6基因的树麻雀亚种分化的初步研究 | 第45-64页 |
| ·材料与方法 | 第45-46页 |
| ·样品的来源及保存方法 | 第45页 |
| ·基因组DNA的提取方法 | 第45-46页 |
| ·基因组纯度的检测及其含量计算 | 第46页 |
| ·实验仪器与试剂 | 第46-47页 |
| ·实验仪器 | 第46页 |
| ·实验试剂 | 第46页 |
| ·载体与宿主菌 | 第46页 |
| ·培养基 | 第46-47页 |
| ·引物设计、PCR扩增及扩增产物检测、回收、克隆和测序 | 第47-50页 |
| ·引物设计 | 第47页 |
| ·PCR扩增 | 第47页 |
| ·PCR产物检测及回收 | 第47页 |
| ·PCR产物的克隆及测序 | 第47-50页 |
| ·数据处理 | 第50页 |
| ·结果与分析 | 第50-62页 |
| ·Cyt b基因PCR产物及纯化产物结果 | 第50-51页 |
| ·碱基组成 | 第51页 |
| ·密码子使用偏倚 | 第51-52页 |
| ·碱基替换 | 第52-53页 |
| ·同义替代与非同义替代 | 第53页 |
| ·遗传距离 | 第53-58页 |
| ·核苷酸碱基差异百分比 | 第58页 |
| ·系统树的构建与检验 | 第58-61页 |
| ·分子钟与相对速率检验 | 第61-62页 |
| ·讨论 | 第62-64页 |
| ·分子标记的选择 | 第62页 |
| ·Cyt b基因序列分析 | 第62页 |
| ·系统发生关系 | 第62-63页 |
| ·关于可信度的讨论 | 第63-64页 |
| 结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-75页 |
| 致谢 | 第75-77页 |
| 攻读学位期间取得的科研成果清单 | 第77页 |