| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第12-15页 |
| 1.2 癌症数据(TCGA)概述 | 第15-17页 |
| 1.2.1 癌症数据的简介 | 第15-16页 |
| 1.2.2 TCGA数据的特点 | 第16页 |
| 1.2.3 TCGA数据的预处理 | 第16-17页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第17-20页 |
| 1.3.1 国外研究现状 | 第17-19页 |
| 1.3.2 国内研究现状 | 第19-20页 |
| 1.4 研究难点 | 第20页 |
| 1.5 主要研究目标和内容 | 第20-21页 |
| 1.6 论文结构安排 | 第21-22页 |
| 第2章 相关理论基础 | 第22-34页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 主要问题模型 | 第22-24页 |
| 2.3 主要方法介绍 | 第24-33页 |
| 2.3.1 贪婪算法 | 第24-25页 |
| 2.3.2 马尔可夫—蒙特卡洛方法 | 第25-28页 |
| 2.3.3 二元线性规划模型(BLP) | 第28-30页 |
| 2.3.4 遗传算法 | 第30-33页 |
| 2.4 本章小结 | 第33-34页 |
| 第3章 混沌-多种群遗传算法的通路识别研究 | 第34-48页 |
| 3.1 引言 | 第34-35页 |
| 3.2 混沌理论 | 第35-36页 |
| 3.3 多种群遗传算法理论 | 第36-37页 |
| 3.4 混沌-多种群遗传算法描述 | 第37-38页 |
| 3.5 数据集描述 | 第38-39页 |
| 3.6 实验设置 | 第39页 |
| 3.7 实验结果分析 | 第39-47页 |
| 3.7.1 模拟数据对比 | 第39-42页 |
| 3.7.2 恶性胶质瘤结果对比 | 第42-43页 |
| 3.7.3 肺癌结果对比 | 第43-44页 |
| 3.7.4 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)结果对比 | 第44-46页 |
| 3.7.5 卵巢癌(OC)结果对比 | 第46-47页 |
| 3.8 本章小结 | 第47-48页 |
| 第4章 多通路的驱动基因识别方法 | 第48-58页 |
| 4.1 引言 | 第48-49页 |
| 4.2 多通路识别方法的基本理论 | 第49-52页 |
| 4.2.1 Multi-Dendrix算法描述 | 第49-50页 |
| 4.2.2 CCMGA算法原理 | 第50-52页 |
| 4.3 协同混沌-遗传识别(CCMGA)算法 | 第52页 |
| 4.4 数据集描述 | 第52-53页 |
| 4.5 实验结果分析 | 第53-57页 |
| 4.5.1 模拟数据结果分析 | 第53页 |
| 4.5.2 临床数据结果分析 | 第53-57页 |
| 4.6 本章小结 | 第57-58页 |
| 结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文 | 第68-69页 |
| 附录B 攻读学位期间所参与的科研活动 | 第69页 |