基于多层网络模块性的复杂疾病相关模式研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 符号对照表 | 第10-11页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-20页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第14-15页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第15-17页 |
| 1.2.1 基于统计的疾病相关性计算策略 | 第15-16页 |
| 1.2.2 基于语义的疾病相关性计算策略 | 第16-17页 |
| 1.2.3 基于网络的疾病相关性计算策略 | 第17页 |
| 1.3 论文的主要研究内容 | 第17-18页 |
| 1.4 论文的组织结构 | 第18-20页 |
| 第二章 相关理论基础 | 第20-34页 |
| 2.1 本体论相关概念 | 第20-25页 |
| 2.1.1 本体论概述 | 第20-21页 |
| 2.1.2 基因本体 | 第21-23页 |
| 2.1.3 疾病本体 | 第23-25页 |
| 2.2 复杂网络相关概念 | 第25-30页 |
| 2.2.1 复杂网络概述 | 第25-27页 |
| 2.2.2 多层网络理论 | 第27-30页 |
| 2.3 药物重定位概述 | 第30-31页 |
| 2.4 分子对接技术 | 第31-32页 |
| 2.5 本章小结 | 第32-34页 |
| 第三章 基于多层网络的复杂疾病相关模式挖掘 | 第34-52页 |
| 3.1 总体框架设计 | 第34-36页 |
| 3.2 数据集介绍 | 第36-40页 |
| 3.2.1 PPI网络数据 | 第36-37页 |
| 3.2.2 疾病症状数据 | 第37-38页 |
| 3.2.3 疾病的致病基因数据 | 第38-39页 |
| 3.2.4 药物数据 | 第39-40页 |
| 3.3 方法及步骤 | 第40-51页 |
| 3.3.1 基于PPI网络的疾病相似性网络构建 | 第40-42页 |
| 3.3.2 基于症状的疾病相似性网络构建 | 第42-44页 |
| 3.3.3 基于本体的疾病相似性网络构建 | 第44-49页 |
| 3.3.4 基于多层网络挖掘疾病相似性模块 | 第49-51页 |
| 3.4 本章小结 | 第51-52页 |
| 第四章 疾病相似性模块验证与分析 | 第52-70页 |
| 4.1 显著性分析 | 第52-58页 |
| 4.1.1 疾病相似性模块分类统计 | 第52-54页 |
| 4.1.2 疾病相似性模块统计显著性 | 第54-55页 |
| 4.1.3 与单层网络挖掘结果比较 | 第55-58页 |
| 4.2 致病机理研究 | 第58-63页 |
| 4.2.1 KEGG pathway富集性分析 | 第58-61页 |
| 4.2.2 疾病致病基因分析 | 第61-63页 |
| 4.3 药物验证及药物重定位研究 | 第63-69页 |
| 4.3.1 药物验证 | 第63-64页 |
| 4.3.2 药物重定位应用 | 第64-66页 |
| 4.3.3 分子对接验证及治疗机制分析 | 第66-69页 |
| 4.4 本章小结 | 第69-70页 |
| 第五章 总结与展望 | 第70-72页 |
| 5.1 本文总结 | 第70-71页 |
| 5.2 未来展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-78页 |
| 致谢 | 第78-80页 |
| 作者简介 | 第80-81页 |
