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基于微液滴数字PCR的遗传性耳聋无创检测方法的建立及应用研究

中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
引言第13-14页
第1章 数字PCR技术及其在遗传性耳聋检测中的应用研究第14-46页
    1.1 dPCR技术发展历程及技术优势第14-16页
    1.2 几种常见dPCR技术平台第16-18页
        1.2.1 基于微液滴分液技术的dPCR平台第16-17页
        1.2.2 基于微流控芯片分液技术的dPCR平台第17-18页
        1.2.3 基于微孔分液技术的dPCR平台第18页
        1.2.4 基于印刷分液技术的dPCR平台第18页
    1.3 dPCR技术应用现状第18-23页
        1.3.1 拷贝数变异检测的应用第19页
        1.3.2 肿瘤标记物早期检测的应用第19-20页
        1.3.3 常见遗传病产前诊断的应用第20-22页
        1.3.4 转基因食品检测的应用第22页
        1.3.5 病原微生物检测的应用第22-23页
        1.3.6 新一代测序技术的应用第23页
    1.4 遗传性耳聋及常见致病基因第23-26页
        1.4.1 GJB2基因第24页
        1.4.2 SLC26A4基因第24-25页
        1.4.3 I2SrRNA基因第25-26页
    1.5 常见耳聋检测样本第26-27页
        1.5.1 外周血第26页
        1.5.2 干血斑第26-27页
        1.5.3 口腔拭子第27页
        1.5.4 唾液第27页
    1.6 耳聋常规检测技术及应用现状第27-31页
        1.6.1 耳聋热点突变位点筛查方法及应用现状第28页
        1.6.2 药物性耳聋突变异质率定量检测方法及应用现状第28-30页
        1.6.3 无创产前诊断方法及应用现状第30-31页
    总结第31-33页
    参考文献第33-46页
第2章 基于微液滴数字PCR以口腔拭子为检材的耳聋无创检测方法的建立与验证第46-87页
    2.1 前言第46页
    2.2 材料第46-49页
        2.2.1 检测样本第46-47页
        2.2.2 主要试剂第47-48页
        2.2.3 主要仪器第48页
        2.2.4 生物信息数据库及辅助分析软件第48-49页
    2.3 方法第49-60页
        2.3.1 口腔拭子采集、基因组DNA提取、定量及保存第49-50页
        2.3.2 干血斑样本处理、基因组DNA提取、定量及保存第50-52页
        2.3.3 质粒制备、DNA提取、定量及保存第52-56页
        2.3.4 引物和探针设计第56-58页
        2.3.5 微液滴数字PCR (ddPCR)工作流程第58-59页
        2.3.6 特异性验证第59页
        2.3.7 动态检测限、最低检测限及重复性检测第59页
        2.3.8 干血斑样本检测第59-60页
        2.3.9 口腔拭子效期验证第60页
        2.3.10 口腔拭子样本检测第60页
    2.4 结果第60-82页
        2.4.1 实验流程设计第60-62页
        2.4.2 特异性检测结果第62-64页
        2.4.3 动态检测限、最低检测限及重复性结果第64-68页
        2.4.4 干血斑定量检测及分型结果第68-73页
        2.4.5 口腔拭子效期验证结果第73-75页
        2.4.6 临床口腔拭子样本定量检测及分型结果第75-82页
    2.5 小结第82-83页
    2.6 讨论第83-85页
    参考文献第85-87页
第3章 基于微液滴数字PCR的药物性耳聋基因突变异质率定量检测第87-107页
    3.1 前言第87页
    3.2 材料第87-89页
        3.2.1 检测样本第87-88页
        3.2.2 主要试剂第88-89页
        3.2.3 主要仪器第89页
        3.2.4 生物信息数据库及辅助分析软件第89页
    3.3 方法第89-93页
        3.3.1 口腔拭子采集、基因组DNA提取、定量及保存第89-90页
        3.3.2 干血斑样本处理、基因组DNA提取、定量及保存第90页
        3.3.3 质粒制备、DNA提取、定量及保存第90页
        3.3.4 引物和探针设计第90-91页
        3.3.5 微液滴数字PCR (ddPCR)工作流程第91页
        3.3.6 不同突变负荷标准品检测第91-92页
        3.3.7 散发干血样本检测第92页
        3.3.8 药物性耳聋家系口腔拭子样本检测第92-93页
    3.4 结果第93-103页
        3.4.1 不同突变负荷标准品定量检测结果第93-97页
        3.4.2 散发干血斑样本定量检测及分型结果第97-100页
        3.4.3 药物性耳聋家系口腔拭子样本定量检测及分型结果第100-103页
    3.5 小结第103-104页
    3.6 讨论第104-106页
    参考文献第106-107页
第4章 基于微液滴数字PCR进行耳聋无创产前诊断的初步研究第107-131页
    4.1 前言第107页
    4.2 材料第107-110页
        4.2.1 孕妇外周血样本第107-108页
        4.2.2 主要试剂第108-109页
        4.2.3 主要仪器第109-110页
        4.2.4 生物信息数据库及辅助分析软件第110页
    4.3 方法第110-118页
        4.3.1 孕妇外周血样本采集、cfDNA提取及浓缩第110-112页
        4.3.2 血浆游离DNA模拟样本的制备第112-113页
        4.3.3 引物和探针设计第113-115页
        4.3.4 微液滴数字PCR (ddPCR)工作流程第115页
        4.3.5 特异性验证第115-116页
        4.3.6 定量准确性验证第116页
        4.3.7 模拟样本检测第116-117页
        4.3.8 孕妇血浆游离DNA临床样本检测第117页
        4.3.9 数据分析及结果判读第117-118页
    4.4 结果第118-127页
        4.4.1 片段化DNA分析第118-119页
        4.4.2 特异性检测结果第119页
        4.4.3 不同浓度样本定量准确性结果第119-122页
        4.4.4 模拟样本定量检测结果第122-124页
        4.4.5 孕妇游离血浆DNA临床样本检测结果第124-127页
    4.5 小结第127-128页
    4.6 讨论第128-130页
    参考文献第130-131页
博士期间发表论文第131-132页
致谢第132-133页
个人简历第133页

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