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中国东北典型湿地沉积物中噬菌体基因多样性研究

摘要第4-6页
abstract第6-8页
第1章 绪论第11-21页
    1.1 选题背景与意义第11-13页
        1.1.1 研究背景第11-12页
        1.1.2 研究意义第12-13页
    1.2 国内外研究进展第13-19页
        1.2.1 湿地病毒研究的重要性第13页
        1.2.2 自然环境中T4型噬菌体g23基因多样性第13-16页
        1.2.3 蓝藻病毒DNA聚合酶基因(pol基因)多样性研究第16-17页
        1.2.4 噬菌体辅助代谢基因phoH基因多样性研究第17-19页
    1.3 研究内容、技术路线和创新点第19-21页
        1.3.1 研究内容第19页
        1.3.2 技术路线第19-20页
        1.3.3 论文创新点第20-21页
第2章 东北典型湿地沉积物中T4型细菌病毒g23基因多样性研究第21-40页
    2.1 材料与方法第21-26页
        2.1.1 样品的采集与处理第21-22页
        2.1.2 样品DNA的提取第22-23页
        2.1.3 g23基因的PCR扩增与胶回收第23-24页
        2.1.4 g23基因的克隆与测序第24-25页
        2.1.5 g23基因系统发育分析第25-26页
    2.2 结果与分析第26-36页
        2.2.1 样品DNA的提取第26页
        2.2.2 g23基因的PCR扩增与阳性克隆检测第26-29页
        2.2.3 g23基因的同源序列分析第29-31页
        2.2.4 g23基因的系统发育分析第31-33页
        2.2.5 湿地与其他生态系统中T4型噬菌体群落比较第33-36页
    2.3 讨论第36-38页
    2.4 小结第38-40页
第3章 东北湿地沉积物中蓝藻病毒DNApol基因多样性研究第40-53页
    3.1 材料与方法第40-42页
        3.1.1 样品的采集与处理第40-41页
        3.1.2 病毒DNA的提取第41页
        3.1.3 DNApol基因的PCR扩增与胶回收第41页
        3.1.4 DNApol基因的克隆与测序第41-42页
        3.1.5 DNApol基因的系统发育分析第42页
        3.1.6 基于OTU水平的非度量多维尺度(NMDS)分析第42页
    3.2 结果与分析第42-50页
        3.2.1 DNA聚合酶 pol 基因的 PCR 扩增与阳性克隆检测第42-44页
        3.2.2 DNA 聚合酶pol基因的同源序列分析第44-45页
        3.2.3 湿地沉积物中DNA 聚合酶pol 基因的系统发育分析第45-46页
        3.2.4 滨海湿地与其他生态系统中短尾蓝藻病毒群落比较第46-49页
        3.2.5 不同环境蓝藻病毒DNApol基因集群的比较第49-50页
    3.3 讨论第50-52页
    3.4 小结第52-53页
第4章 东北典型湿地沉积物中蓝藻病毒phoH基因多样性研究第53-70页
    4.1 材料与方法第53-54页
        4.1.1 样品的采集与处理第53-54页
        4.1.2 病毒DNA的提取第54页
        4.1.3 phoH基因的PCR扩增与胶回收第54页
        4.1.4 phoH基因的克隆与测序第54页
        4.1.5 蓝藻病毒phoH基因的系统发育分析第54页
        4.1.6 非度量多维尺度(NMDS)分析第54页
    4.2 结果与分析第54-67页
        4.2.1 phoH基因的PCR扩增与阳性克隆检测第54-56页
        4.2.2 phoH基因的同源序列分析第56-62页
        4.2.3 phoH基因的系统发育分析第62-66页
        4.2.4 不同环境细菌病毒/蓝藻病毒phoH基因集群的比较第66-67页
    4.3 讨论第67-69页
    4.4 小结第69-70页
第5章 结论与展望第70-73页
    5.1 研究结论第70-71页
    5.2 本研究的不足与展望第71-73页
附录第73-78页
参考文献第78-85页
致谢第85-87页
作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果第87页

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