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胃肠道间质瘤全外显子组测序分析及其伊马替尼耐药细胞株的构建

摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 绪论第8-14页
    1.1 研究背景第8-12页
        1.1.1 胃肠道间质瘤概况第8页
        1.1.2 GIST中的基因突变第8-10页
        1.1.3 GIST的临床治疗第10-12页
        1.1.4 二代测序在GIST中的应用第12页
    1.2 研究意义第12-13页
    1.3 研究内容第13-14页
第二章 GIST细胞系及其Imatinib耐药株的构建与鉴定第14-31页
    2.1 实验材料第14-16页
        2.1.1 临床组织样本第14页
        2.1.2 引物与质粒第14页
        2.1.3 试剂第14-15页
        2.1.4 仪器第15-16页
    2.2 实验方法第16-25页
        2.2.1 质粒构建第16-19页
        2.2.2 病毒包装第19页
        2.2.3 原代细胞分离及其永生化培养第19-20页
        2.2.4 RNA提取第20-21页
        2.2.5 逆转录第21页
        2.2.6 qPCR第21-22页
        2.2.7 免疫组织化学检测第22页
        2.2.8 细胞蛋白提取第22-23页
        2.2.9 Western blot第23-24页
        2.2.10 Imatinib耐药细胞株的构建与培养第24页
        2.2.11 细胞周期检测第24页
        2.2.12 CCK-8测细胞增殖第24页
        2.2.13 CCK-8测IC_(50)第24-25页
        2.2.14 统计分析第25页
    2.3 实验结果与讨论第25-29页
        2.3.1 GIST细胞系的构建第25-26页
        2.3.2 免疫组织化学检测KIT蛋白表达第26-27页
        2.3.3 Western blot检测KIT蛋白表达第27页
        2.3.4 Imatinib耐药细胞株GIST-FR的构建第27-28页
        2.3.5 Imatinib敏感性及细胞增殖检测第28-29页
        2.3.6 GIST-FR细胞周期检测第29页
    2.4 本章小结第29-31页
第三章 GIST临床样本及Imatinib耐药株全外显子组测序第31-50页
    3.1 实验材料第31-32页
        3.1.1 GIST临床样本第31页
        3.1.2 细胞株第31页
        3.1.3 引物第31页
        3.1.4 试剂第31-32页
        3.1.5 仪器第32页
    3.2 实验方法第32-35页
        3.2.1 组织及细胞DNA提取第32-33页
        3.2.2 外显子组测序第33-34页
        3.2.3 PCR第34页
        3.2.4 琼脂糖凝胶电泳第34-35页
        3.2.5 统计分析第35页
    3.3 实验结果与讨论第35-48页
        3.3.1 50例GIST病例临床病理特征第35-37页
        3.3.2 GIST临床样本及Imatinib耐药细胞的全外显子组测序第37-39页
        3.3.3 GIST相关基因突变分析及其验证第39-43页
        3.3.4 Imatinib耐药相关基因突变的分析第43-47页
        3.3.5 GIST中Imatinib耐药相关基因突变的GO分析第47-48页
    3.4 本章小结第48-50页
第四章 结论与展望第50-51页
    4.1 结论第50页
    4.2 展望第50-51页
致谢第51-52页
参考文献第52-58页
附录一:基因参考序列转录组第58-62页
附录二:作者在攻读硕士学位期间发表的论文第62页

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