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向日葵苗期抗旱性评价及全基因组关联分析

摘要第3-4页
abstract第4-5页
1 前言第9-15页
    1.1 作物抗旱机制第9-10页
    1.2 向日葵抗旱性研究进展第10页
    1.3 单核苷酸多态性(SNP)位点的开发及研究现状第10-12页
        1.3.1 SNP标记开发第10-11页
        1.3.2 国内外研究现状第11-12页
    1.4 关联分析及其在作物育种中的研究进展第12-13页
        1.4.1 连锁不平衡第12页
        1.4.2 全基因组关联分析概述第12页
        1.4.3 关联分析研究进展第12-13页
    1.5 本研究的目的意义及技术路线第13-15页
        1.5.1 研究目的与意义第13-14页
        1.5.2 技术路线第14-15页
2 材料与方法第15-20页
    2.1 试验材料第15-16页
    2.2 试验方法第16-17页
        2.2.1 盆栽试验第16页
        2.2.2 基于SLAF-seq技术开发SNP标记第16-17页
    2.3 性状测定第17-18页
    2.4 数据统计分析第18-20页
        2.4.1 表型性状的统计分析第18-19页
        2.4.2 分子数据统计分析第19-20页
3 结果分析第20-42页
    3.1 向日葵苗期抗旱性鉴定第20-26页
        3.1.1 苗期各项指标抗旱系数对干旱胁迫响应分析第20页
        3.1.2 各性状抗旱系数相关分析第20-21页
        3.1.3 各性状抗旱系数与综合抗旱隶属函数值线性回归分析第21-22页
        3.1.4 抗旱性综合评价第22-26页
        3.1.5 苗期9项指标抗旱系数与综合抗旱评价D值相关分析第26页
    3.2 SLAF-sep开发SNP标记分析第26-30页
        3.2.1 酶切方案评估第26-27页
        3.2.2 实验建库评估第27-28页
        3.2.3 测序数据统计与评估第28页
        3.2.4 参考基因组比对结果统计第28-29页
        3.2.5 SLAF标签在向日葵染色体上的分布第29页
        3.2.6 SNP标记开发第29-30页
    3.3 全基因组关联分析第30-42页
        3.3.1 不同条件下性状表型分析第30-31页
        3.3.2 系统发育及亲缘关系评估第31-32页
        3.3.3 群体结构分析第32-33页
        3.3.4 连锁不平衡分析第33页
        3.3.5 苗期抗旱相关性状全基因组关联分析第33-40页
        3.3.6 候选基因预测分析第40-42页
4 讨论第42-46页
    4.1 抗旱性鉴定指标的筛选第42页
    4.2 抗旱性评价方法第42-43页
    4.3 传统分子标记局限性第43页
    4.4 SLAF-seq在分子育种中技术优势第43页
    4.5 遗传结构对全基因组关联分析的影响第43-44页
    4.6 连锁不平衡对全基因组关联分析影响第44页
    4.7 苗期抗旱性状全基因组关联分析检测第44页
    4.8 抗旱候选基因第44-46页
5 结论第46-47页
致谢第47-48页
参考文献第48-56页
作者简介第56页

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