| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-21页 |
| 1.1 马铃薯及马铃薯疮痂病介绍 | 第12-15页 |
| 1.1.1 马铃薯介绍 | 第12页 |
| 1.1.2 马铃薯疮痂病介绍 | 第12-13页 |
| 1.1.3 中国马铃薯疮痂病的微生物防治方法 | 第13-15页 |
| 1.2 微生物多样性的研究方法 | 第15-18页 |
| 1.2.1 传统的培养方法 | 第15-16页 |
| 1.2.2 基于分子生物学技术的非培养方法 | 第16页 |
| 1.2.3 末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP) | 第16-17页 |
| 1.2.4 变性/温度梯度凝胶电泳(DGGE/TGGE) | 第17页 |
| 1.2.5 荧光原位杂交技术(FISH) | 第17-18页 |
| 1.2.6 高通量测序技术(High-thought put sequencing) | 第18页 |
| 1.3 致病性链霉菌的检测 | 第18-19页 |
| 1.4 菌株相互关系 | 第19页 |
| 1.5 研究目的 | 第19-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-31页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第21页 |
| 2.1.2 培养基 | 第21页 |
| 2.1.3 主要试剂及酶 | 第21-22页 |
| 2.1.4 引物序列 | 第22-23页 |
| 2.1.5 主要仪器设备 | 第23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-31页 |
| 2.2.1 样品的采集及处理 | 第23页 |
| 2.2.2 高通量测序方法 | 第23-27页 |
| 2.2.2.1 提取细菌总DNA | 第23-24页 |
| 2.2.2.2 DNA质量检测 | 第24页 |
| 2.2.2.3 16S rDNA文库制备和库检 | 第24-25页 |
| 2.2.2.4 库检 | 第25页 |
| 2.2.2.5 测序 | 第25-26页 |
| 2.2.2.6 信息分析流程 | 第26页 |
| 2.2.2.7 数据过滤统计 | 第26页 |
| 2.2.2.8 序列拼接 | 第26页 |
| 2.2.2.9 OTU统计分析 | 第26-27页 |
| 2.2.2.10 数据计算方法 | 第27页 |
| 2.2.3 传统可培养方法 | 第27-30页 |
| 2.2.3.1 可培养微生物的分离程序 | 第27-28页 |
| 2.2.3.2 可培养微生物DNA的提取 | 第28-29页 |
| 2.2.3.3 内转录间隔区PCR扩增 | 第29页 |
| 2.2.3.4 同源性比对与系统发育树的建立 | 第29-30页 |
| 2.2.3.5 致病基因扩增 | 第30页 |
| 2.2.4 相互作用关系(十字划线法) | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-48页 |
| 3.1 高通量测序结果 | 第31-38页 |
| 3.1.1 数据过滤统计 | 第31-32页 |
| 3.1.2 稀释曲线分析 | 第32-33页 |
| 3.1.3 细菌多样性分析 | 第33-37页 |
| 3.1.4 物种相关性分析 | 第37-38页 |
| 3.1.5 真菌多样性分析 | 第38页 |
| 3.2 可培养方法结果 | 第38-47页 |
| 3.2.1 可培养细菌多样性 | 第39-46页 |
| 3.2.1.1 可培养细菌的分离情况 | 第41-43页 |
| 3.2.1.2 可培养放线菌的分离情况 | 第43-46页 |
| 3.2.2 可培养真菌多样性 | 第46-47页 |
| 3.3 菌株间抑制作用关系 | 第47-48页 |
| 4 讨论 | 第48-50页 |
| 5 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
