| 缩略语表 | 第7-9页 |
| 中文摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 前言 | 第14-17页 |
| 文献回顾 | 第17-45页 |
| 实验一 HEPG2 细胞中过表达 NDRG2 的表达谱分析 | 第45-72页 |
| 1 材料 | 第46-47页 |
| 1.1 细胞、抗体和试剂 | 第46页 |
| 1.2 主要仪器 | 第46页 |
| 1.3 芯片数据及分析软件 | 第46-47页 |
| 2 方法 | 第47-51页 |
| 2.1 NDRG2 腺病毒的扩增和滴度测定 | 第47页 |
| 2.2 用 NDRG2 腺病毒感染 HepG2 细胞，观察生物学效应 | 第47-48页 |
| 2.3 用基因芯片检测 NDRG2 过表达后 HepG2 细胞的表达谱 | 第48页 |
| 2.4 用 Western blot 检测细胞内蛋白表达水平 | 第48-49页 |
| 2.5 用 qRT-PCR 检测基因的 mRNA 的表达 | 第49-50页 |
| 2.6 肿瘤组织与正常肝组织表达谱分析 | 第50-51页 |
| 3 结果 | 第51-69页 |
| 3.1 NDRG2 在肝癌组织及 HepG2 细胞中低表达 | 第51页 |
| 3.2 NDRG2 过表达后 HepG2 表达谱的分析 | 第51-66页 |
| 3.3 肝癌样本 GPCR 信号通路分子降低，G2/M 期信号通路分子增加 | 第66-69页 |
| 4 讨论 | 第69-72页 |
| 实验二 数据挖掘与 NDRG2 的转录调控 | 第72-85页 |
| 1 材料 | 第73-74页 |
| 1.1 芯片数据 | 第73页 |
| 1.2 在线分析工具 | 第73页 |
| 1.3 本地软件 | 第73-74页 |
| 2 方法 | 第74-75页 |
| 2.1 用 MatInspector 扫描出可能调控 NDRG2 的转录因子结合模体 | 第74-75页 |
| 2.2 芯片数据标准化与注释 | 第75页 |
| 2.3 ARACNE 算法的实施与功能注释 | 第75页 |
| 3 结果 | 第75-81页 |
| 3.1 转录因子结合模体扫描结果 | 第75-76页 |
| 3.2 ARACNE 算法结果 | 第76-77页 |
| 3.3 候选转录因子的信号通路分析和聚类分析 | 第77-81页 |
| 4 讨论 | 第81-85页 |
| 实验三 数据挖掘与蛋白质相互作用 | 第85-100页 |
| 1 材料 | 第86-87页 |
| 1.1 细胞、抗体和试剂 | 第86页 |
| 1.2 主要仪器设备 | 第86-87页 |
| 1.3 芯片数据与软件 | 第87页 |
| 2 方法 | 第87-89页 |
| 2.1 用同源方法预测 NDRG2 的相互作用分子 | 第87页 |
| 2.2 用 MINDy 算法和 Pred_PPI 预测 Dusp6 的相互作用分子 | 第87-88页 |
| 2.3 病毒感染 | 第88页 |
| 2.4 细胞转染 | 第88页 |
| 2.5 免疫共沉淀（Co-IP） | 第88-89页 |
| 2.6 His-pulldown 实验 | 第89页 |
| 3 结果 | 第89-95页 |
| 3.1 NDRG2 的同源蛋白分布 | 第89-90页 |
| 3.2 NDRG2 的相互作用分子的鉴定 | 第90-93页 |
| 3.3 NDRG2 可以和 RGS5 直接相互作用 | 第93页 |
| 3.4 Dusp6 与 Mapk8 相互作用 | 第93-95页 |
| 4 讨论 | 第95-100页 |
| 小结 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-108页 |
| 附录 | 第108-109页 |
| 个人简历和研究成果 | 第109-110页 |
| 致谢 | 第110页 |
