摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第一章 绪论 | 第6-12页 |
1.1 引言 | 第6页 |
1.2 蛋白质的功能位点 | 第6-7页 |
1.3 蛋白质功能位点预测方法 | 第7-10页 |
1.4 本方案简介 | 第10-12页 |
第二章 方法与过程 | 第12-22页 |
2.1 建立SCOP的“子结构域”(sub-domain)序列群 | 第12-14页 |
2.2 建立子结构域的搜索字典 | 第14-15页 |
2.3 计算序列功能位点,建立模版序列功能位点 | 第15-16页 |
2.4 用SCOP子结构域搜索字典与功能数据库预测蛋白质功能位点 | 第16-17页 |
2.5 筛选功能位点,给出最终预测结果 | 第17-20页 |
2.6 衡量预测结果 | 第20-22页 |
第三章 结果 | 第22-40页 |
3.1 大肠杆菌天冬酰胺聚合酶(Escherichia coli Asparagine Synthetase)功能位点预测(PDBid:12as,E.C.number:6.3.1.1) | 第22-28页 |
3.2 甲酰四氢叶酸脱甲酰酶(Formyltetrahydrofolate Deformylase)功能位点预测(PDBID:3OBI) | 第28-31页 |
3.3 CASP9标靶蛋白配体结合位点预测 | 第31-35页 |
3.4 酶催化位点预测 | 第35-37页 |
3.5 Ca~(2+)离子结合位点预测 | 第37-38页 |
3.6 其他蛋白质的预测结果 | 第38-40页 |
第四章 总结 | 第40-42页 |
参考文献 | 第42-44页 |
致谢 | 第44-45页 |