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通过构建蛋白质结构域功能模版库做基于序列的蛋白质功能位点预测

摘要第4-5页
Abstract第5页
第一章 绪论第6-12页
    1.1 引言第6页
    1.2 蛋白质的功能位点第6-7页
    1.3 蛋白质功能位点预测方法第7-10页
    1.4 本方案简介第10-12页
第二章 方法与过程第12-22页
    2.1 建立SCOP的“子结构域”(sub-domain)序列群第12-14页
    2.2 建立子结构域的搜索字典第14-15页
    2.3 计算序列功能位点,建立模版序列功能位点第15-16页
    2.4 用SCOP子结构域搜索字典与功能数据库预测蛋白质功能位点第16-17页
    2.5 筛选功能位点,给出最终预测结果第17-20页
    2.6 衡量预测结果第20-22页
第三章 结果第22-40页
    3.1 大肠杆菌天冬酰胺聚合酶(Escherichia coli Asparagine Synthetase)功能位点预测(PDBid:12as,E.C.number:6.3.1.1)第22-28页
    3.2 甲酰四氢叶酸脱甲酰酶(Formyltetrahydrofolate Deformylase)功能位点预测(PDBID:3OBI)第28-31页
    3.3 CASP9标靶蛋白配体结合位点预测第31-35页
    3.4 酶催化位点预测第35-37页
    3.5 Ca~(2+)离子结合位点预测第37-38页
    3.6 其他蛋白质的预测结果第38-40页
第四章 总结第40-42页
参考文献第42-44页
致谢第44-45页

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