| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 插图索引 | 第12-13页 |
| 附表索引 | 第13-14页 |
| 第1章 绪论 | 第14-36页 |
| 1.1 纤维素的化学组成及结构 | 第14页 |
| 1.2 纤维素的生物降解 | 第14-17页 |
| 1.2.1 纤维素生物降解的重要意义 | 第14-15页 |
| 1.2.2 纤维素降解机制及研究进展 | 第15-17页 |
| 1.3 纤维二糖的降解 | 第17-18页 |
| 1.3.1 纤维二糖在纤维素降解中的抑制作用 | 第17页 |
| 1.3.2 β-葡糖苷酶的研究进展 | 第17-18页 |
| 1.4 生物信息学 | 第18-24页 |
| 1.4.1 生物信息学概况 | 第18-20页 |
| 1.4.2 生物信息学的研究内容 | 第20-23页 |
| 1.4.3 生物信息学与环境科学 | 第23-24页 |
| 1.5 分子对接 | 第24-34页 |
| 1.5.1 计算机辅助药物设计 | 第24页 |
| 1.5.2 分子对接概述 | 第24-25页 |
| 1.5.3 分子对接的原理 | 第25-26页 |
| 1.5.4 分子对接方法的分类 | 第26-27页 |
| 1.5.5 反向对接 | 第27页 |
| 1.5.6 分子对接与环境工程 | 第27-28页 |
| 1.5.7 分子对接软件 | 第28-34页 |
| 1.6 本研究课题的意义及内容 | 第34-36页 |
| 第2章 纤维二糖与糖苷水解酶家族1的β-葡糖苷酶的分子对接 | 第36-58页 |
| 2.1 研究目的 | 第36页 |
| 2.2 纤维二糖结构文件的准备 | 第36-37页 |
| 2.2.1 结构文件的获取 | 第36-37页 |
| 2.2.2 配体结构能量最小化 | 第37页 |
| 2.3 糖苷水解酶家族1的β-葡糖苷酶结构文件的准备 | 第37-42页 |
| 2.3.1 β-葡糖苷酶的结构信息检索 | 第37-38页 |
| 2.3.2 β-葡糖苷酶（家族 1）受体结构筛选 | 第38-42页 |
| 2.4 运行分子对接程序 | 第42-43页 |
| 2.5 分子对接结果分析 | 第43-56页 |
| 2.5.1 最优复合物的结合亲和力 | 第43-44页 |
| 2.5.2 β-葡糖苷酶结合口袋 | 第44-48页 |
| 2.5.3 纤维二糖和β-葡糖苷酶的相互作用 | 第48-56页 |
| 2.6 本章小结 | 第56-58页 |
| 第3章 纤维二糖与β-葡糖苷酶（家族3）的分子对接 | 第58-64页 |
| 3.1 研究目的 | 第58页 |
| 3.2 纤维二糖配体文件的准备 | 第58页 |
| 3.3 家族 3 的β-葡糖苷酶的结构筛选 | 第58-59页 |
| 3.4 分子对接实验 | 第59页 |
| 3.5 对接结果分析 | 第59-63页 |
| 3.5.1 最优复合物的结合亲和力 | 第59-60页 |
| 3.5.2 纤维二糖和糖苷水解酶家族 3 的β-葡糖苷酶的结合口袋 | 第60页 |
| 3.5.3 纤维二糖和β-葡糖苷酶的相互作用分析 | 第60-63页 |
| 3.6 本章小结 | 第63-64页 |
| 第4章 β-葡糖苷酶的氨基酸序列比对 | 第64-72页 |
| 4.1 研究目的 | 第65页 |
| 4.2 糖苷水解酶家族 1 的β-葡糖苷酶氨基酸序列比对 | 第65-70页 |
| 4.2.1 β-葡糖苷酶氨基酸序列的获取 | 第65页 |
| 4.2.2 氨基酸序列比对结果与分析 | 第65-70页 |
| 4.3 糖苷水解酶家族3的β-葡糖苷酶的氨基酸序列比对 | 第70-71页 |
| 4.4 本章小结 | 第71-72页 |
| 第5章 分子对接在环境工程中的应用展望 | 第72-75页 |
| 5.1 虚拟筛选 | 第72页 |
| 5.2 蛋白质同源建模和分子对接 | 第72-73页 |
| 5.3 突变育种 | 第73-75页 |
| 结论 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-84页 |
| 附录 A 攻读硕士学位期间所发表的学术论文目录 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
