| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 缩略词表 | 第8-9页 |
| 1. 前言 | 第9-17页 |
| 1.1 背景知识 | 第9-12页 |
| 1.1.1 木霉菌介绍 | 第9-10页 |
| 1.1.2 木霉菌种类 | 第10-11页 |
| 1.1.3 木霉菌的特点 | 第11-12页 |
| 1.2 木霉菌的研究进展和展望 | 第12-13页 |
| 1.2.1 木霉菌研究进展 | 第12页 |
| 1.2.2 木霉菌研究展望 | 第12-13页 |
| 1.3 YYH13和YYH16在纤维素降解和抗菌性上的差异 | 第13-15页 |
| 1.3.1 纤维素降解差异 | 第13-14页 |
| 1.3.2 抗菌能力差异 | 第14-15页 |
| 1.4 选择压力分析 | 第15-16页 |
| 1.4.1 正选择分析的含义 | 第15页 |
| 1.4.2 选择压力分析的相关研究进展 | 第15-16页 |
| 1.5 课题目的和可行性分析 | 第16-17页 |
| 2. 材料与方法 | 第17-21页 |
| 2.1 研究对象 | 第17页 |
| 2.2 技术路线 | 第17页 |
| 2.3 研究方法 | 第17-21页 |
| 2.3.1 组装注释 | 第17-18页 |
| 2.3.2 亲缘关系确认 | 第18页 |
| 2.3.3 共线性分析 | 第18页 |
| 2.3.4 独有基因分析 | 第18页 |
| 2.3.5 进化选择压力分析 | 第18-21页 |
| 3. 结果与分析 | 第21-47页 |
| 3.1 测序及质控组装 | 第21页 |
| 3.2 物种进化关系确认 | 第21-22页 |
| 3.3 基因注释 | 第22-24页 |
| 3.3.1 注释结果比较 | 第22-23页 |
| 3.3.2 非编码基因注释 | 第23-24页 |
| 3.3.3 重复序列注释 | 第24页 |
| 3.4 独有基因分析 | 第24-26页 |
| 3.4.1 独有基因筛选 | 第24-25页 |
| 3.4.2 独有基因功能注释 | 第25-26页 |
| 3.5 共线性分析 | 第26-27页 |
| 3.6 选择压力分析 | 第27-47页 |
| 3.6.1 基因选择压力的计算 | 第27-32页 |
| 3.6.2 正选择基因家族的单样本t检验分析 | 第32-36页 |
| 3.6.3 基因家族的正选择位点分析 | 第36-47页 |
| 4. 讨论 | 第47-50页 |
| 4.1 结果讨论 | 第47-49页 |
| 4.2 分析的不足之处 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 附表 | 第55-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |