miRNA与基因调控网络的预测与分析
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 符号对照表 | 第11-12页 |
| 缩略语对照表 | 第12-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-19页 |
| 1.1 研究背景 | 第15-16页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第16-17页 |
| 1.3 研究内容及意义 | 第17-18页 |
| 1.4 章节安排 | 第18-19页 |
| 第二章 miRNA调控网络的构建方法 | 第19-29页 |
| 2.1 miRNA简介 | 第19-23页 |
| 2.1.1 miRNA命名规则 | 第19-20页 |
| 2.1.2 miRNA调控的多样性 | 第20-21页 |
| 2.1.3 miRNA的加工成熟过程 | 第21-22页 |
| 2.1.4 miRNA相关数据库及软件 | 第22-23页 |
| 2.2 泛癌计划 | 第23-24页 |
| 2.3 miRNA调控网络及其构建 | 第24-27页 |
| 2.3.1 miRNA调控网络 | 第24-25页 |
| 2.3.2 miRNA靶基因的预测 | 第25-26页 |
| 2.3.3 miRNA调控网络构建及其方法 | 第26-27页 |
| 2.4 本章小结 | 第27-29页 |
| 第三章 基于DCMM算法构建miRNA调控网络 | 第29-49页 |
| 3.1 DCMM算法 | 第29-36页 |
| 3.1.1 连通性 | 第29页 |
| 3.1.2 线性回归 | 第29-31页 |
| 3.1.3 Localfdr算法 | 第31-33页 |
| 3.1.4 ClusterONE算法 | 第33-34页 |
| 3.1.5 DCMM算法流程 | 第34-36页 |
| 3.2 实验数据集 | 第36-38页 |
| 3.3 DCMM算法构建miRNA调控网络 | 第38-48页 |
| 3.3.1 构建miRNA网络 | 第38-43页 |
| 3.3.2 PPI网络 | 第43-44页 |
| 3.3.3 miRNA-mRNA的调控模块 | 第44-48页 |
| 3.4 本章小结 | 第48-49页 |
| 第四章 实验结果分析 | 第49-63页 |
| 4.1 疾病实验结果分析 | 第49-56页 |
| 4.1.1 miRNA-mRNA对的分析 | 第49-53页 |
| 4.1.2 miRNA-mRNA调控模块分析 | 第53-56页 |
| 4.2 pathway富集分析 | 第56-61页 |
| 4.2.1 pathway富集结果 | 第56-57页 |
| 4.2.2 pathway富集分析 | 第57-61页 |
| 4.3 本章小结 | 第61-63页 |
| 第五章 结论和展望 | 第63-65页 |
| 5.1 研究结论 | 第63页 |
| 5.2 研究展望 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-69页 |
| 致谢 | 第69-71页 |
| 作者简介 | 第71-72页 |
