疾病特异调控网络的构建和分析
摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
符号对照表 | 第10-11页 |
缩略语对照表 | 第11-14页 |
第一章 绪论 | 第14-20页 |
1.1 研究背景与意义 | 第14-16页 |
1.2 国内外研究现状 | 第16-18页 |
1.3 论文主要工作 | 第18页 |
1.4 论文章节安排 | 第18-20页 |
第二章 相关理论基础 | 第20-30页 |
2.1 算法相关理论 | 第20-24页 |
2.1.1 图论 | 第20-21页 |
2.1.2 复杂网络 | 第21-23页 |
2.1.3 K最近邻算法 | 第23-24页 |
2.2 生物数据相关理论 | 第24-29页 |
2.2.1 调控关系 | 第24-25页 |
2.2.2 蛋白质相互作用 | 第25-26页 |
2.2.3 基因表达 | 第26-27页 |
2.2.4 生物通路 | 第27-29页 |
2.3 本章小结 | 第29-30页 |
第三章 疾病特异调控网络构建和分析方法 | 第30-40页 |
3.1 调控网络构建方法 | 第30-33页 |
3.1.1 数据预处理 | 第30-31页 |
3.1.2 调控网络构建 | 第31-33页 |
3.2 核心节点识别方法 | 第33-35页 |
3.3 疾病特异调控网络分析方法 | 第35-36页 |
3.3.1 基因富集分析 | 第35页 |
3.3.2 生物通路富集分析 | 第35-36页 |
3.3.3 富集分析工具 | 第36页 |
3.4 基于最近邻的疾病候选分子预测方法 | 第36-37页 |
3.5 本章小结 | 第37-40页 |
第四章 实验结果分析 | 第40-58页 |
4.1 数据处理结果分析 | 第40-41页 |
4.2 调控网络构建结果分析 | 第41-43页 |
4.2.1 调控网络数据分布 | 第41-43页 |
4.2.2 调控网络度分布 | 第43页 |
4.3 核心节点识别结果分析 | 第43-46页 |
4.3.1 核心节点分布 | 第44-45页 |
4.3.2 核心节点准确率 | 第45-46页 |
4.4 疾病特异调控网络结果分析 | 第46-51页 |
4.4.1 生物通路富集分析 | 第46-49页 |
4.4.2 miRNA富集分析 | 第49-51页 |
4.5 疾病候选生物分子预测结果分析 | 第51-57页 |
4.5.1 疾病候选生物分子分布 | 第51-52页 |
4.5.2 疾病候选生物分子准确率 | 第52-53页 |
4.5.3 疾病候选生物分子富集分析 | 第53-57页 |
4.6 本章小结 | 第57-58页 |
第五章 总结与展望 | 第58-60页 |
5.1 工作总结 | 第58-59页 |
5.2 工作展望 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-64页 |
致谢 | 第64-66页 |
作者简介 | 第66-67页 |