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鱼腥蓝细菌PCC 7120中HetN蛋白质生化功能的鉴定以及FtsZ-HetN蛋白质相互作用的研究

摘要第8-9页
Abstract第9页
缩略语表第10-12页
1.前言第12-46页
    1.1 鱼腥蓝细菌PCC 7120中异形胞的发育特点第12-15页
        1.1.1 异形胞的形态特征第12-13页
        1.1.2 异形胞中特异性的基因表达与生化代谢第13-15页
    1.2 鱼腥蓝细菌PCC 7120中异形胞的发育进程第15-31页
        1.2.1 2-OG(α-ketoglutarate)-感受细胞内氮源水平改变、诱导异形胞分化的信号分子第15-17页
        1.2.2 NtcA-氮源利用的全局性调控因子/异形胞分化信号分子的可能受体第17-20页
        1.2.3 Ca~(2+)浓度的上升-异形胞发育的必需环节第20-21页
        1.2.4 NrrA-缺氮表达量明显上升的调控因子第21-22页
        1.2.5 HetL-过量表达促进异形胞发育第22页
        1.2.6 HetR-处理异形胞分化的主要蛋白第22-24页
        1.2.7 Asr1734-异形胞分化的负调控因子第24-25页
        1.2.8 hetZ-patU5-patU3基因簇-异形胞分化与模式形成的调控因子第25-26页
        1.2.9 鱼腥蓝细菌PCC 7120异形胞发育的模式形成第26-30页
        1.2.10 鱼腥蓝细菌PCC 7120前异形胞细胞分裂的终止第30-31页
    1.3 鱼腥蓝细菌PCC 7120菌丝上细胞之间的交流第31-32页
        1.3.1 鱼腥蓝细菌PCC 7120菌丝上细胞质之间的交流第31-32页
        1.3.2 鱼腥蓝细菌PCC 7120菌丝上细胞周质空间之间的交流第32页
    1.4 FtsZ在原核生物中细胞分裂与细胞分化发育的功能第32-45页
        1.4.1 FtsZ的结构、定位及功能第32-34页
        1.4.2 FtsZ与原核生物的细胞二元均等分裂第34-37页
        1.4.3 FtsZ与原核生物的细胞不对称分裂第37-41页
        1.4.4 FtsZ在鱼腥蓝细菌PCC 7120中的细胞以及亚细胞定位第41-43页
        1.4.5 FtsZ功能的正常执行与鱼腥蓝细菌PCC 7120的异形胞发育第43-44页
        1.4.6 FtsZ可能参与的其他功能第44-45页
    1.5 研究的目的和意义第45-46页
2.材料和方法第46-68页
    2.1 菌株第46页
    2.2 质粒第46-47页
    2.3 引物第47-49页
    2.4 培养基配方以及培养条件第49-51页
    2.5 常用储存溶液和缓冲溶液配方第51-54页
        2.5.1 常规贮存液配制第51-52页
        2.5.2 常规缓冲溶液第52-54页
    2.6 实验方法第54-68页
        2.6.1 大肠杆菌质粒DNA的提取(Sambrook et al.,1989)第54页
        2.6.2 Anabaena PCC7120总DNA的小量提取(Cai Y P et al.,1990)第54-55页
        2.6.3 PCR技术以及PCR介导的基因定点突变(Mullis et al.,1985;Dieffenbach andDvesler,1993)第55-56页
        2.6.4 DNA片段的回收、酶切及连接第56页
        2.6.5 大肠杆菌感受态的制备(CaCl_2法)及转化(Sambrook et al.,1989)第56-57页
        2.6.6 Anabaena PCC7120三亲本结合转移第57-59页
        2.6.7 酵母感受态的制备(LiAc法)及转化(ClonTeck Yeast Protocols Handbook)第59-60页
        2.6.8 酵母双杂交阳性克隆确证(β-半乳糖苷酶活性测定)第60-61页
        2.6.9 大肠杆菌中蛋白质的诱导表达及蛋白质样品的小量制备第61页
        2.6.10 大肠杆菌细胞的超声波破碎及蛋白质的纯化(HiTrap及Strep-tactin)第61-62页
        2.6.11 家兔中多克隆抗体的制备方法第62-63页
        2.6.12 家兔多克隆抗体的纯化与富集第63页
        2.6.13 Anabaena PCC7120总蛋白的提取第63页
        2.6.14 Anabaena PCC7120可溶性蛋白的提取(Golden,私人交流)第63-64页
        2.6.15 蛋白质样品的浓缩第64页
        2.6.16 蛋白质标准曲线的绘制及未知浓度蛋白质的定量(BioRad Kit)第64-65页
        2.6.17 Western Blot实验方法(Kyhse-Anderson,1984)第65-66页
        2.6.18 Anabaena PCC7120异形胞的染色与显微观察第66页
        2.6.19 Anabaena PCC7120异形胞诱导与分离(Golden et al.,1985)第66页
        2.6.20 HPLC检测HetN蛋白质对水解ATP和GTP的反应活性第66-68页
3.结果与分析第68-100页
    3.1 hetN、hetR、ftsZ、dnaA的克隆与表达第68-71页
        3.1.1 hetN、hetR、ftsZ、dnaA的克隆第68-69页
        3.1.2 hetN、hetR、ftsZ、dnaA在鱼腥蓝细菌PCC 7120细胞内的过量表达第69页
        3.1.3 ftsZoe菌株的特性研究第69-71页
    3.2 HetN、HetR、FtsZ、DnaA和PatA蛋白质的体外表达与纯化第71-74页
        3.2.1 HetN、HetR、FtsZ、DnaA以及PatA重组融合蛋白表达质粒的构建第71-72页
        3.2.2 HetN、FtsZ和PatA融合蛋白的体外纯化第72-74页
    3.3 HetN、HetR和PatA抗血清的制备与纯化第74-79页
        3.3.1 抗原的制备第74-76页
        3.3.2 家兔的免疫第76-77页
        3.3.3 抗血清的检测第77-78页
        3.3.4 抗血清的富集第78-79页
    3.4 ftsZoe和hetNoe菌株重组蛋白的亲和纯化及相互作用蛋白的鉴定第79-83页
        3.4.1 ftsZoe菌株重组蛋白的亲和纯化与相互作用蛋白的鉴定第79-81页
        3.4.2 hetNoe菌株重组蛋白的亲和纯化与相互作用蛋白的鉴定第81-83页
    3.5 ftsZ启动子结构的分析第83-85页
        3.5.1 ftsZ启动子结构特点第83-84页
        3.5.2 NtcA的纯化以及NtcA与ftsZ启动子区域的EMSA实验第84-85页
    3.6 酵母双杂交验证FtsZ与HetN的相互作用第85-87页
        3.6.1 X-Gal作为底物滤纸影印检测FtsZ与HetN的相互作用第85-86页
        3.6.2 ONPG作为底物定量测定FtsZ与HetN相互作用的强度第86-87页
    3.7 HetN的生物信息学预测以及生化功能的鉴定第87-90页
        3.7.1 HetN蛋白质序列的生物信息学分析第87-88页
        3.7.2 HetN蛋白质的生物化学功能的鉴定第88-89页
        3.7.3 HetN蛋白质ATP、GTP水解反应的酶学参数的鉴定第89-90页
    3.8 不同金属离子对HetN水解ATP活性的影响第90-92页
        3.8.1 Mg~(2+)对HetN水解ATP的活性的影响第90-91页
        3.8.2 K~+对HetN水解ATP的活性的影响第91页
        3.8.3 Zn~(2+)、Mn~(2+)、Ca~(2+)对HetN水解ATP的活性影响第91-92页
    3.9 FtsZ对HetN水解ATP的活性的影响第92-93页
        3.9.1 FtsZ蛋白质的纯化第92-93页
        3.9.2 FtsZ对HetN水解ATP的活性的影响第93页
    3.10 HetN点突变体性质的鉴定第93-98页
        3.10.1 HetN点突变体质粒的构建第93-94页
        3.10.2 点突变体HetN蛋白质水解ATP活性酶活参数的鉴定第94-95页
        3.10.3 FtsZ对HetN突变体水解ATP活性的影响第95-96页
        3.10.4 FtsZ与HetN点突变体相互作用的强度的鉴定第96-97页
        3.10.5 HetN突变体对异形胞发育的影响第97-98页
    3.11 kaiC及kaiABC突变体的构建第98-100页
        3.11.1 突变体质粒的构建第98-99页
        3.11.2 突变体的制备及表性观察第99-100页
4.总结与讨论第100-102页
参考文献第102-114页
致谢第114-115页
附录第115页

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