基于滑窗的lncRNA二级结构预测
| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第10-12页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第12-14页 |
| 1.3 论文结构安排 | 第14-16页 |
| 第2章 RNA二级结构相关知识 | 第16-25页 |
| 2.1 RNA二级结构含义 | 第16-19页 |
| 2.2 RNA二级结构表示方法 | 第19-21页 |
| 2.3 最小自由能 | 第21页 |
| 2.4 最近邻能量模型 | 第21-23页 |
| 2.5 常用软件比较 | 第23-24页 |
| 2.6 本章小结 | 第24-25页 |
| 第3章 RNA二级结构预测算法 | 第25-36页 |
| 3.1 动态规划算法 | 第25-32页 |
| 3.1.1 Nussinov算法 | 第26-28页 |
| 3.1.2 Zuker算法 | 第28-32页 |
| 3.2 序列比对算法 | 第32-33页 |
| 3.3 LNCRNA二级结构预测算法 | 第33-34页 |
| 3.4 本章小结 | 第34-36页 |
| 第4章 基于滑窗的LNCRNA二级结构预测 | 第36-54页 |
| 4.1 预测算法的整体描述 | 第36页 |
| 4.2 局部预测算法与平衡能量模型 | 第36-42页 |
| 4.2.1 局部预测算法ACRNA | 第36-41页 |
| 4.2.2 平衡能能量模型 | 第41-42页 |
| 4.3 算法构建 | 第42-46页 |
| 4.3.1 相关定义 | 第42-43页 |
| 4.3.2 算法的流程 | 第43-46页 |
| 4.4 预测结果与分析 | 第46-52页 |
| 4.4.1 数据来源 | 第46-49页 |
| 4.4.2 评测标准 | 第49-50页 |
| 4.4.3 计算结果比较分析 | 第50-52页 |
| 4.5 算法改进 | 第52页 |
| 4.6 本章小结 | 第52-54页 |
| 第5章 总结与展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 作者简介 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
