| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第一章 引言 | 第8-12页 |
| 1.1.组蛋白去乙酰化酶的分类 | 第8-9页 |
| 1.2.组蛋白去乙酰化酶抑制剂的分类 | 第9-10页 |
| 1.3.组蛋白去乙酰化酶抑制剂研究现状 | 第10-11页 |
| 1.4.本文研究内容 | 第11-12页 |
| 第二章 药物设计基本概念和理论方法简介 | 第12-15页 |
| 2.1.计算机辅助药物设计 | 第12页 |
| 2.2.药效团 | 第12-13页 |
| 2.3.分子对接 | 第13页 |
| 2.4.定量构效关系 | 第13页 |
| 2.5.组蛋白乙酰转移酶 | 第13页 |
| 2.6.组蛋白去乙酰化酶 | 第13-14页 |
| 2.7.组蛋白去乙酰化酶抑制剂 | 第14-15页 |
| 第三章 实验材料和方法 | 第15-20页 |
| 3.1.小分子训练集和测试集的准备 | 第15页 |
| 3.2.计算机辅助药物设计的虚拟筛选方法 | 第15-19页 |
| 3.2.1.药效团模型——GALAHAD | 第15-18页 |
| 3.2.2.分子对接——GOLD | 第18页 |
| 3.2.3.3D-QSAR建模——CoMSIA | 第18-19页 |
| 3.3.酶活性抑制实验 | 第19-20页 |
| 第四章 实验结果分析与讨论 | 第20-34页 |
| 4.1.基于药效团模型的虚拟筛选研究 | 第20-22页 |
| 4.1.1. 药效团模型的建立和选择 | 第20-22页 |
| 4.1.2．药效团模型的验证 | 第22页 |
| 4.1.3. 基于药效团的虚拟筛选 | 第22页 |
| 4.2. 基于分子对接的虚拟筛选研究 | 第22-25页 |
| 4.3. 基于 3D-QSAR预测命中化合物活性的研究 | 第25-29页 |
| 4.3.1.训练集和测试集的分子叠合 | 第25-28页 |
| 4.3.2 命中化合物的生物活性预测 | 第28-29页 |
| 4.4. 酶活性抑制实验验证 | 第29页 |
| 4.5.3D-QSAR力场三维等值线图 | 第29-31页 |
| 4.6. 讨论 | 第31-34页 |
| 第五章 结论 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-40页 |
| 致谢 | 第40-41页 |
| 在学期间公开发表论文 | 第41页 |