| 摘要 | 第10-12页 |
| 英文摘要 | 第12-14页 |
| 1 引言 | 第15-28页 |
| 1.1 网状内皮组织增生症病毒研究进展 | 第15-18页 |
| 1.1.1 网状内皮组织增生症病毒概述 | 第15页 |
| 1.1.2 REV的流行病学 | 第15-16页 |
| 1.1.3 REV的致病机制 | 第16-17页 |
| 1.1.4 REV与禽类其他病毒的混合感染 | 第17-18页 |
| 1.2 网状内皮组织增生症及其研究进展 | 第18-20页 |
| 1.2.1 网状内皮组织增生症概述 | 第18页 |
| 1.2.2 RE动物的临诊主要症状及其病理变化 | 第18页 |
| 1.2.3 RE的诊断及其防治 | 第18-20页 |
| 1.3 微小RNA研究进展 | 第20-24页 |
| 1.3.1 微小RNA概述 | 第20页 |
| 1.3.2 miRNA的功能 | 第20-23页 |
| 1.3.3 miRNA的检测方法 | 第23-24页 |
| 1.4 高通量测序技术研究进展 | 第24-25页 |
| 1.4.1 高通量测序技术的发展及现状 | 第24-25页 |
| 1.4.2 高通量测序技术的应用 | 第25页 |
| 1.5 细胞周期及其与肿瘤研究进展 | 第25-26页 |
| 1.5.1 细胞周期概述 | 第25-26页 |
| 1.5.2 细胞周期与肿瘤 | 第26页 |
| 1.6 本项目研究的目的及意义 | 第26-28页 |
| 2 材料与方法 | 第28-39页 |
| 2.1 实验材料 | 第28-30页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第28页 |
| 2.1.2 病毒 | 第28页 |
| 2.1.3 主要仪器与设备 | 第28页 |
| 2.1.4 主要化学试剂及生物制剂 | 第28-29页 |
| 2.1.5 主要溶液配制 | 第29-30页 |
| 2.2 实验方法 | 第30-38页 |
| 2.2.1 病毒增殖 | 第30-31页 |
| 2.2.2 实验动物分组及其处理 | 第31页 |
| 2.2.3 材料采取及其处理 | 第31页 |
| 2.2.4 检测指标与方法 | 第31-38页 |
| 2.3 数据处理 | 第38-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-86页 |
| 3.1 病毒增殖及其检测 | 第39页 |
| 3.1.1 REV增殖 | 第39页 |
| 3.1.2 TCID_(50)测定 | 第39页 |
| 3.2 REV感染SPF雏鸡主要临诊症状及眼观病理变化 | 第39-42页 |
| 3.2.1 REV感染SPF雏鸡主要临诊表现 | 第39页 |
| 3.2.2 REV感染SPF雏鸡法氏囊、胸腺和脾脏的主要眼观病理变化 | 第39-42页 |
| 3.3 REV感染SPF雏鸡疾病模型的分子生物学验证 | 第42-43页 |
| 3.3.1 总RNA提取 | 第42页 |
| 3.3.2 LTR基因的检测——PCR法 | 第42-43页 |
| 3.4 REV Real Time q-PCR检测方法建立及组织病毒载量检测 | 第43-47页 |
| 3.4.1 REV Real Time q-PCR检测方法建立 | 第43-44页 |
| 3.4.2 组织病毒载量检测 | 第44-47页 |
| 3.5 高通量测序结果分析 | 第47-80页 |
| 3.5.1 待检样品质量验证 | 第47-48页 |
| 3.5.2 测序数据质量评估 | 第48-49页 |
| 3.5.3 测序数据过滤 | 第49页 |
| 3.5.4 sRNA长度筛选及其种类分析 | 第49-50页 |
| 3.5.5 公共及特有序列分析 | 第50-53页 |
| 3.5.6 参考序列比对分析 | 第53页 |
| 3.5.7 已知miRNA分析 | 第53-65页 |
| 3.5.8 新miRNA预测 | 第65-67页 |
| 3.5.9 sRNA分类注释统计 | 第67-68页 |
| 3.5.10 miRNA表达及差异分析 | 第68-77页 |
| 3.5.11 差异miRNA靶基因富集分析 | 第77-80页 |
| 3.6 差异表达miRNA及其调控的靶基因验证 | 第80-86页 |
| 3.6.1 差异表达miRNA验证 | 第80-83页 |
| 3.6.2 差异表达miRNA靶基因mRNA验证 | 第83-86页 |
| 4 讨论 | 第86-92页 |
| 4.1 REV感染SPF雏鸡模型的制备及其验证 | 第86页 |
| 4.2 REV Real Time q-PCR检测方法建立及其应用 | 第86-88页 |
| 4.3 miRNA高通量检测的影响因素及其质量评估 | 第88页 |
| 4.3.1 样品质量检测 | 第88页 |
| 4.3.2 测序数据质量评估 | 第88页 |
| 4.4 REV感染对SPF雏鸡miRNA表达谱的影响 | 第88-90页 |
| 4.5 REV感染对SPF雏鸡细胞凋亡的影响 | 第90页 |
| 4.6 REV感染对SPF雏鸡细胞周期影响 | 第90-92页 |
| 5 结论 | 第92-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
| 参考文献 | 第94-103页 |
| 附录 | 第103-105页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第105页 |
