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基于转录组学方法研究微囊藻毒素致白鲢肝损伤的作用机制

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
缩略语第9-14页
第一章 绪论第14-28页
    1.1 蓝藻水华及蓝藻毒素第14-15页
    1.2 微囊藻毒素第15-17页
        1.2.1 MCs的结构第16-17页
        1.2.2 MCs的理化性质第17页
    1.3 MCs的肝毒性及其机理第17-22页
        1.3.1 MCs的肝毒性第17-19页
        1.3.2 MCs肝毒性作用机制第19-22页
    1.4 MCs对鱼类肝脏毒性的研究第22-23页
    1.5 转录组学第23-26页
        1.5.1 转录组学的概述第23-24页
        1.5.2 转录组学方法在鱼类毒性试验研究中的应用第24-26页
    1.6 本研究的目的和意义第26-28页
第二章 材料与方法第28-40页
    2.1 实验材料第28-30页
        2.1.1 实验鱼第28页
        2.1.2 微囊藻毒素-LR第28页
        2.1.3 实验主要仪器设备第28-29页
        2.1.4 实验主要试剂第29页
        2.1.5 常用试剂的配制第29-30页
    2.2 实验方法第30-40页
        2.2.1 MC-LR急性毒性试验和LD_(50)计算第30-31页
        2.2.2 总RNA提取及质量检测第31-32页
        2.2.3 De novo测序准备第32-33页
        2.2.4 原始数据的过滤第33-34页
        2.2.5 Unigene的质量评估第34页
        2.2.6 Unigene表达量以及基因覆盖度的计算统计第34-35页
        2.2.7 差异表达基因的筛选第35页
        2.2.8 差异表达基因的Gene Ontology功能分析第35-36页
        2.2.9 差异表达基因的KEGG Pathway分析第36页
        2.2.10 荧光定量PCR验证差异表达基因第36-39页
        2.2.11 数据处理及统计学分析第39-40页
第三章 实验结果与分析第40-59页
    3.1 急性毒性实验结果第40页
    3.2 RNA提取结果与质量检测第40-41页
    3.3 白鲢肝脏转录组测序质量指标与组装结果第41-43页
    3.4 白鲢肝脏转录组中差异基因表达量的计算和筛选第43-45页
    3.5 差异表达基因GO功能分析结果第45-52页
    3.6 差异基因Pathway功能分析结果第52-56页
    3.7 表达差异基因的验证第56-59页
第四章 讨论第59-63页
    4.1 MC-LR对白鲢的急性毒性第59页
    4.2 转录组解析MC-LR致白鲢肝毒性的作用机制第59-63页
第五章 结论与展望第63-65页
本研究创新点第65-67页
参考文献第67-78页
致谢第78-80页
攻读硕士学位期间学术成果第80-81页

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