| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 英文缩写表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| 1.苎麻种质资源起源和分布 | 第15-16页 |
| 2.苎麻种质资源的搜集概况 | 第16-17页 |
| 3.苎麻种质资源的保存 | 第17-18页 |
| 4.苎麻的分类研究历史及分类依据 | 第18-26页 |
| 4.1 经典分类 | 第18-20页 |
| 4.2 生物化学分类 | 第20-21页 |
| 4.3 细胞学分类 | 第21页 |
| 4.4 分子生物学分类 | 第21-26页 |
| 4.4.1 ITS标记 | 第22-23页 |
| 4.4.2 叶绿体基因组（cp DNA）标记 | 第23-24页 |
| 4.4.3 SSR标记 | 第24-26页 |
| 5.SSR位点开发策略 | 第26-28页 |
| 6.本课题研究意义和主要研究内容 | 第28-30页 |
| 6.1 研究意义 | 第28-29页 |
| 6.2 主要研究内容 | 第29-30页 |
| 第二章 苎麻种质资源的搜集与评价 | 第30-39页 |
| 1.苎麻种质资源考察内容 | 第30-31页 |
| 1.1 特征特性 | 第30-31页 |
| 1.1.1 植物学特性 | 第30页 |
| 1.1.2 农艺性状 | 第30-31页 |
| 1.1.3 品质特性 | 第31页 |
| 1.1.4 抗逆性能 | 第31页 |
| 1.2 原产地生态环境 | 第31页 |
| 1.2.1 大环境 | 第31页 |
| 1.2.2 小环境 | 第31页 |
| 2.苎麻种质资源考察方法 | 第31-32页 |
| 2.1 前期准备 | 第31-32页 |
| 2.2 调查的方法 | 第32页 |
| 2.2.1 访问调查 | 第32页 |
| 2.2.2 现场调查 | 第32页 |
| 3.苎麻种质资源的采集和保存 | 第32-33页 |
| 3.1 苎麻种质资源的采集 | 第32页 |
| 3.2 采集种质资源的原始记录 | 第32-33页 |
| 3.3 苎麻种质资源的保存 | 第33页 |
| 4.考察结果 | 第33-35页 |
| 5.野生苎麻收集种介绍 | 第35-39页 |
| 第三章 基于trn L-F和ITS序列探讨中国野生苎麻种质资源亲缘关系 | 第39-52页 |
| 1.引言 | 第39-40页 |
| 2.材料和方法 | 第40-47页 |
| 2.1 材料 | 第40-42页 |
| 2.2 仪器和设备 | 第42-43页 |
| 2.3 试剂 | 第43页 |
| 2.4 基因组DNA的提取 | 第43-44页 |
| 2.5 PCR反应与产物检测 | 第44页 |
| 2.6 PCR反应体系的建立 | 第44页 |
| 2.7 测序 | 第44-47页 |
| 2.8 序列数据分析 | 第47页 |
| 3.结果与分析 | 第47-49页 |
| 3.1 trn L-F序列分析 | 第47-48页 |
| 3.2 ITS序列分析 | 第48页 |
| 3.3 ITS和trn L-F序列联合分析 | 第48-49页 |
| 4.讨论 | 第49-51页 |
| 5.结论 | 第51-52页 |
| 第四章 基于苎麻转录组测序开发SSR分子标记 | 第52-68页 |
| 1.引言 | 第52-53页 |
| 2.实验材料和方法 | 第53-58页 |
| 2.1 实验材料 | 第53页 |
| 2.2 仪器和设备 | 第53-54页 |
| 2.3 试剂 | 第54页 |
| 2.4 EST-SSR的发掘 | 第54页 |
| 2.5 EST-SSR引物设计 | 第54-55页 |
| 2.6 基因组DNA的提取 | 第55页 |
| 2.7 基因组DNA检测 | 第55-56页 |
| 2.8 SSR标记技术 | 第56-58页 |
| 2.8.1 PCR反应体系 | 第56页 |
| 2.8.2 PCR反应程序 | 第56页 |
| 2.8.3 SSR标记检测 | 第56-58页 |
| 2.9 数据处理 | 第58页 |
| 3.结果与分析 | 第58-65页 |
| 3.1 EST-SSR发生频率 | 第58-59页 |
| 3.2 EST-SSR位点的特征分布 | 第59-60页 |
| 3.3 EST-SSR位点功能注释 | 第60-61页 |
| 3.4 EST-SSR新标记开发及多态性检测 | 第61-64页 |
| 3.5 EST-SSR引物的多态性信息含量和聚类分析 | 第64页 |
| 3.6 开发的EST-SSR引物与前期研究相似度比较 | 第64-65页 |
| 4.讨论 | 第65-68页 |
| 4.1 关于EST-SSR的特征 | 第65-66页 |
| 4.2 关于SSR标记的相似度比较 | 第66-67页 |
| 4.3 SSRs与苎麻纤维品质之间相关性 | 第67-68页 |
| 第五章 基于EST-SSR分子标记检测苎麻属野生种质资源 遗传多样性 | 第68-75页 |
| 1.引言 | 第68页 |
| 2.材料和方法 | 第68-70页 |
| 2.1 实验材料 | 第68页 |
| 2.2 实验仪器和试剂 | 第68-69页 |
| 2.3 实验方法 | 第69页 |
| 2.3.1 基因组DNA提取 | 第69页 |
| 2.3.2 SSR引物选择 | 第69页 |
| 2.3.3 SSR引物PCR | 第69页 |
| 2.3.4 PCR产物检测 | 第69页 |
| 2.4 数据统计与分析 | 第69-70页 |
| 3.结果与分析 | 第70-73页 |
| 3.1 不同SSR引物的多态性 | 第70-71页 |
| 3.2 EST-SSR扩增产物的多态性分析 | 第71页 |
| 3.3 相似性系数与聚类分析 | 第71-73页 |
| 4.讨论 | 第73-75页 |
| 第六章 主要结论及研究展望 | 第75-77页 |
| 1.主要结论 | 第75-76页 |
| 1.1 研究了苎麻属28个种3个变种亲缘关系 | 第75页 |
| 1.2 利用转录组测序数据开发960对EST-SSR引物 | 第75-76页 |
| 1.3 基于EST-SSR分子标记检测苎麻属野生种质资源遗传多样性 | 第76页 |
| 2.研究展望 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-87页 |
| 附录 攻读博士期间投稿论文 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88-90页 |
