| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略语/符号说明 | 第11-12页 |
| 一、前言 | 第12-19页 |
| 1.1 研究背景 | 第12-16页 |
| 1.1.1 吸烟影响 | 第12页 |
| 1.1.2 尼古丁成瘾 | 第12-14页 |
| 1.1.3 信号通路分析 | 第14-15页 |
| 1.1.4 蛋白质相互作用网络分析 | 第15-16页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第16-17页 |
| 1.3 研究内容及方法 | 第17-18页 |
| 1.4 论文创新点 | 第18页 |
| 1.5 论文结构安排 | 第18-19页 |
| 二、原理与方法 | 第19-25页 |
| 2.1 数据 | 第19-20页 |
| 2.1.1 候选基因集 | 第19页 |
| 2.1.2 其他基因集 | 第19页 |
| 2.1.3 蛋白质相互作用数据 | 第19-20页 |
| 2.2 分析方法 | 第20-25页 |
| 2.2.1 GO富集分析 | 第20-21页 |
| 2.2.2 pathway富集分析 | 第21页 |
| 2.2.3 pathway crosstalk分析 | 第21-22页 |
| 2.2.4 PPIN拓扑特性分析 | 第22-23页 |
| 2.2.5 PPIN的聚类分析 | 第23页 |
| 2.2.6 构建尼古丁成瘾特定子网络 | 第23-25页 |
| 三、结果与分析 | 第25-45页 |
| 3.1 GO富集分析 | 第25-30页 |
| 3.2 pathway富集分析 | 第30-34页 |
| 3.3 pathway crosstalk分析 | 第34页 |
| 3.4 PPIN分析 | 第34-40页 |
| 3.4.1 拓扑特性分析 | 第34-37页 |
| 3.4.2 聚类分析 | 第37-40页 |
| 3.5 尼古丁成瘾特定的子网络 | 第40-43页 |
| 3.5.1 提取特定子网络 | 第40-43页 |
| 3.5.2 验证网络的非随机性 | 第43页 |
| 3.6 尼古丁成瘾的分子网络 | 第43-45页 |
| 四、结论与讨论 | 第45-50页 |
| 4.1 结论 | 第45-46页 |
| 4.2 讨论 | 第46-50页 |
| 4.2.1 功能富集分析 | 第46-48页 |
| 4.2.2 PPIN分析 | 第48-49页 |
| 4.2.3 不足之处 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-58页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第58-59页 |
| 附录 1 220个NAGenes | 第59-67页 |
| 附录 2 pathway crosstalk (top 10%, top 40%) | 第67-68页 |
| 附录 3 NAGenes中显著性富集的通路 (PBH<=0.01) | 第68-72页 |
| 综述 信号通路及蛋白质相互作用网络的分析研究 | 第72-88页 |
| 综述参考文献 | 第84-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
