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细菌漆酶基因挖掘、酶学特性及其结构研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
英文缩略词表第14-15页
第一章 绪论第15-34页
    1.1 漆酶的概述第15-27页
        1.1.1 漆酶的来源与分布第15-17页
        1.1.2 细菌漆酶的序列与结构特征第17-22页
        1.1.3 细菌漆酶的催化氧化和电子传递第22-26页
        1.1.4 细菌漆酶的应用第26-27页
    1.2 新酶基因挖掘技术的研究进展第27-30页
        1.2.1 利用基因组数据库挖掘技术挖掘新酶基因第28-29页
        1.2.2 宏基因组文库挖掘新酶基因第29-30页
    1.3 分子模拟技术在酶蛋白质结构与功能研究的应用第30-32页
        1.3.1 同源建模第30-31页
        1.3.2 分子对接第31-32页
    1.4 本课题的研究意义及主要内容第32-34页
        1.4.1 本课题的研究意义第32-33页
        1.4.2 主要研究内容第33-34页
第二章 新型细菌漆酶的挖掘第34-50页
    2.1 引言第34页
    2.2 材料与设备第34-38页
        2.2.1 菌株、载体和引物第34-35页
        2.2.2 主要仪器和设备第35-36页
        2.2.3 主要试剂和试剂盒第36页
        2.2.4 培养基与溶液配制第36-38页
    2.3 实验方法第38-44页
        2.3.1 细菌漆酶序列的筛选和生物信息学分析第38页
        2.3.2 重组细菌漆酶表达载体的构建第38-41页
        2.3.3 大肠杆菌重组表达菌株的构建及重组蛋白的诱导表达第41-42页
        2.3.4 重组漆酶的活性检测第42页
        2.3.5 重组蛋白的提取与纯化第42-43页
        2.3.6 SDS-PAGE分析第43-44页
        2.3.7 pH值对重组漆酶酶活的影响第44页
        2.3.8 温度对重组漆酶酶活的影响第44页
    2.4 结果与讨论第44-49页
        2.4.1 细菌漆酶的预测和生物信息学分析第44-45页
        2.4.2 重组表达载体的构建及鉴定第45-46页
        2.4.3 重组蛋白的诱导表达、漆酶活性检测及纯化第46-48页
        2.4.4 三个重组细菌漆酶的最适温度比较第48页
        2.4.5 三个重组细菌漆酶的最适pH比较第48-49页
    2.5 小结第49-50页
第三章 新型细菌漆酶LacTT在毕赤酵母的表达及其酶特性研究第50-69页
    3.1 引言第50页
    3.2 材料与设备第50-52页
        3.2.1 菌株、载体和引物第50-51页
        3.2.2 主要仪器和设备第51页
        3.2.3 主要试剂和试剂盒第51页
        3.2.4 培养基与溶液配制第51-52页
    3.3 实验方法第52-60页
        3.3.1 毕赤酵母重组表达载体pHKFA-LacTT的构建第52-53页
        3.3.2 通过串联表达盒体外构建LacTT多拷贝重组载体第53-55页
        3.3.3 重组毕赤酵母表达体系的构建第55-56页
        3.3.4 荧光定量PCR检测重组酵母LacTT基因数量第56-57页
        3.3.5 重组LacTT的诱导表达及纯化第57-58页
        3.3.6 SDS-PAGE、酶谱分析和蛋白质浓度测定第58页
        3.3.7 重组漆酶的酶学性质分析第58-59页
        3.3.8 重组LacTT对工业染料的脱色性能研究第59-60页
    3.4 结果与讨论第60-68页
        3.4.1 LacTT单拷贝重组表达载体的构建和鉴定第60-61页
        3.4.2 LacTT的多拷贝重组表达载体的构建及鉴定第61页
        3.4.3 毕赤酵母重组菌株的构建及鉴定第61-63页
        3.4.4 重组LacTT的诱导表达及纯化第63-64页
        3.4.5 重组LacTT的酶学性质分析第64-67页
        3.4.6 重组LacTT在工业染料脱色中的应用初探第67-68页
    3.5 本章小结第68-69页
第四章 漆酶LacTT底物结合关键氨基酸及其功能研究第69-86页
    4.1 引言第69页
    4.2 材料与设备第69-71页
        4.2.1 菌株、载体和引物第69-70页
        4.2.2 主要仪器和设备第70-71页
        4.2.3 主要试剂和试剂盒第71页
        4.2.4 培养基与溶液配制第71页
    4.3 实验方法第71-73页
        4.3.1 LacTT的同源建模和关于底物结合关键氨基酸的选择第71页
        4.3.2 LacTT定点突变及其表达载体的构建第71-72页
        4.3.3 突变体蛋白在大肠杆菌的表达、纯化及SDS-PAGE分析第72页
        4.3.4 突变体蛋白的酶学性质分析第72-73页
        4.3.5 突变体蛋白的紫外可见吸收光谱分析第73页
        4.3.6 LacTT关于底物结合关键氨基酸的虚拟突变第73页
    4.4 结果与讨论第73-84页
        4.4.1 LacTT的同源建模第73-75页
        4.4.2 LacTT关于底物结合关键氨基酸的预测第75-77页
        4.4.3 关于底物结合关键氨基酸的突变及其原核表达载体的构建第77-78页
        4.4.4 底物结合关键氨基酸突变体蛋白的诱导表达和纯化第78页
        4.4.5 底物结合关键氨基酸突变体蛋白的最适反应温度和热稳定性第78-79页
        4.4.6 底物结合关键氨基酸突变体蛋白的最适反应pH第79-80页
        4.4.7 底物结合关键氨基酸突变体蛋白的紫外可见吸收光谱分析第80-81页
        4.4.8 突变体蛋白的反应动力学参数、空间结构及关键位点的功能研究第81-84页
    4.5 本章小结第84-86页
第五章 漆酶LacTT电子传递机制及关键氨基酸功能研究第86-105页
    5.1 引言第86页
    5.2 材料与设备第86-87页
        5.2.1 菌株、载体和引物第86-87页
        5.2.2 主要仪器和设备第87页
        5.2.3 主要试剂和试剂盒第87页
        5.2.4 培养基与溶液配制第87页
    5.3 实验方法第87-89页
        5.3.1 LacTT电子传递关键氨基酸的选择第87-88页
        5.3.2 LacTT的定点突变及其突变体表达载体构建第88-89页
        5.3.3 LacTT突变体蛋白的诱导表达、纯化及SDS-PAGE分析第89页
        5.3.4 LacTT和LacTT突变体蛋白的酶学性质分析与比较第89页
        5.3.5 LacTT和LacTT突变体蛋白的紫外可见吸收光谱比较分析第89页
        5.3.6 LacTT的虚拟氨基酸突变第89页
    5.4 结果与讨论第89-103页
        5.4.1 LacTT关于电子传递关键氨基酸的预测第89-92页
        5.4.2 电子传递关键位点突变基因及其重组突变体表达载体的构建第92页
        5.4.3 LacTT及其电子传递关键位点突变体蛋白的诱导表达和纯化第92-93页
        5.4.4 LacTT及其突变体的最适反应温度和热稳定性比较第93-95页
        5.4.5 LacTT及其突变体蛋白的最适反应pH比较第95页
        5.4.6 LacTT及其突变体蛋白的紫外可见吸收光谱分析第95-97页
        5.4.7 LacTT突变体的动力学参数、空间结构及关键位点的功能研究第97-102页
        5.4.8 漆酶LacTT的电子传递机制第102-103页
    5.5 本章小结第103-105页
结论与展望第105-108页
    结论第105-106页
    本论文创新点第106-107页
    展望第107-108页
参考文献第108-119页
攻读博士学位期间取得的研究成果第119-120页
致谢第120-121页
附件第121页

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