| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一章 绪论 | 第19-36页 |
| 1.1 引言 | 第19-21页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第20-21页 |
| 1.1.2 研究目的和意义 | 第21页 |
| 1.1.3 项目来源与经费支持 | 第21页 |
| 1.2 国内外研究现状与评述 | 第21-34页 |
| 1.2.1 虫瘿的研究现状 | 第21-24页 |
| 1.2.2 角倍研究概况 | 第24-29页 |
| 1.2.3 植物激素研究概况 | 第29-32页 |
| 1.2.4 转录组在植物上的应用 | 第32-34页 |
| 1.3 研究目标和主要研究内容 | 第34-35页 |
| 1.3.1 研究目标 | 第34页 |
| 1.3.2 主要研究内容 | 第34-35页 |
| 1.4 技术路线 | 第35-36页 |
| 第二章 角倍形成过程中的内源激素响应 | 第36-58页 |
| 2.1 材料与方法 | 第37-41页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第37-39页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第39-41页 |
| 2.2 结果与分析 | 第41-53页 |
| 2.2.1 角倍表型性状和单宁含量变化 | 第41页 |
| 2.2.2 GA在激素变化中的独特作用 | 第41-47页 |
| 2.2.3 激素浓度与角倍性状的关联分析 | 第47-51页 |
| 2.2.4 外源赤霉素促进角倍生长 | 第51-52页 |
| 2.2.5 GA生物合成与信号转导相关基因的分析 | 第52-53页 |
| 2.3 讨论 | 第53-57页 |
| 2.4 小结 | 第57-58页 |
| 第三章 角倍发育过程的转录组分析 | 第58-71页 |
| 3.1 材料与方法 | 第59-61页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第59页 |
| 3.1.2 RNA提取和文库构建 | 第59页 |
| 3.1.3 反转录第一链和第二链的合成 | 第59页 |
| 3.1.4 末端修复、末端加A和加接头 | 第59-60页 |
| 3.1.5 连接产物的回收纯化和测序 | 第60页 |
| 3.1.6 数据组装和分析 | 第60页 |
| 3.1.7 功能注释和分析 | 第60-61页 |
| 3.2 结果与分析 | 第61-67页 |
| 3.2.1 转录组测序和装配 | 第61-63页 |
| 3.2.2 基因注释和功能分类 | 第63-65页 |
| 3.2.3 SSR和SNP标记检测 | 第65-67页 |
| 3.3 讨论 | 第67-70页 |
| 3.3.1 盐肤木转录组特性 | 第67-69页 |
| 3.3.2 盐肤木鉴定到的特异转录本 | 第69-70页 |
| 3.4 小结 | 第70-71页 |
| 第四章 角倍形成过程中的基因表达谱分析 | 第71-91页 |
| 4.1 材料与方法 | 第71-72页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第71页 |
| 4.1.2 差异表达基因（DEGs）的鉴定 | 第71页 |
| 4.1.3 RNA提取、反转录和基因表达分析 | 第71-72页 |
| 4.2 结果与分析 | 第72-78页 |
| 4.2.1 基因表达数据的处理和质量控制 | 第72-73页 |
| 4.2.2 不同组织间差异基因表达比较 | 第73-74页 |
| 4.2.3 差异表达基因的功能分类和代谢通路分类 | 第74-76页 |
| 4.2.4 与植物激素信号转导相关的差异表达基因 | 第76页 |
| 4.2.5 次生代谢、植物病原菌互作和蔗糖代谢差异表达基因 | 第76-78页 |
| 4.3 讨论 | 第78-89页 |
| 4.3.1 参与植物病原菌互作的差异表达基因 | 第78-85页 |
| 4.3.2 次生代谢相关的差异表达基因 | 第85-87页 |
| 4.3.3 淀粉和蔗糖代谢相关差异表达基因 | 第87-89页 |
| 4.3.4 内源激素协调角倍的初生与次生代谢 | 第89页 |
| 4.4 小结 | 第89-91页 |
| 第五章 RCGAI和RCPP2C基因的克隆与表达分析 | 第91-111页 |
| 5.1 实验材料与方法 | 第91-95页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第91页 |
| 5.1.2 试剂和耗材 | 第91-92页 |
| 5.1.3 RNA提取 | 第92页 |
| 5.1.4 反转录PCR | 第92-93页 |
| 5.1.5 引物设计 | 第93页 |
| 5.1.6 PCR扩增 | 第93页 |
| 5.1.7 片段补齐 | 第93-94页 |
| 5.1.8 T-A克隆和测序 | 第94-95页 |
| 5.2 结果与分析 | 第95-105页 |
| 5.2.1 RNA提取结果 | 第95页 |
| 5.2.2 角倍RcGAI基因的克隆 | 第95-99页 |
| 5.2.3 角倍RcGAI蛋白同源性分析 | 第99页 |
| 5.2.4 RcGAI三维模型预测 | 第99-101页 |
| 5.2.5 RcGAI基因表达模式分析 | 第101-102页 |
| 5.2.6 RcPP2C基因的克隆与分析 | 第102页 |
| 5.2.7 角倍RcPP2C基因克隆 | 第102-104页 |
| 5.2.8 角倍RcPP2C蛋白同源性分析 | 第104页 |
| 5.2.9 RcPP2C三维模型预测 | 第104-105页 |
| 5.2.10 RcPP2C基因表达模式分析 | 第105页 |
| 5.3 讨论 | 第105-110页 |
| 5.3.1 DELLA相关基因的功能研究 | 第105-108页 |
| 5.3.2 RcGAI基因负向调控GA反应 | 第108-109页 |
| 5.3.3 蛋白磷酸酶基因研究概况 | 第109页 |
| 5.3.4 RcPP2C通过负调控ABA反应影响角倍发育 | 第109-110页 |
| 5.4 小结 | 第110-111页 |
| 第六章 主要结论和创新点 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-136页 |
| 附录 | 第136-140页 |
| 在读期间的学术研究 | 第140-141页 |
| 致谢 | 第141页 |
