| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 肿瘤的生物学背景 | 第12-35页 |
| 1.1 肿瘤是什么? | 第12-14页 |
| 1.2 两个实例 | 第14-19页 |
| 1.2.1 结肠癌 | 第14-16页 |
| 1.2.2 乳腺癌 | 第16-19页 |
| 1.3 肿瘤的异质性 | 第19页 |
| 1.4 肿瘤的干细胞假说 | 第19-21页 |
| 1.4.1 干细胞(SC) | 第19-20页 |
| 1.4.2 癌干细胞(CSC) | 第20-21页 |
| 1.5 数学模型 | 第21-32页 |
| 1.5.1 单向转换模型 | 第21-27页 |
| 1.5.2 双向转换模型 | 第27-32页 |
| 1.6 本文的主要内容及安排 | 第32-35页 |
| 第二章 非线性系统随机动力学理论及数值方法 | 第35-54页 |
| 2.1 随机动力学的理论研究方法 | 第35-47页 |
| 2.1.1 稳定性分析及分岔理论 | 第35-40页 |
| 2.1.2 主方程 | 第40-42页 |
| 2.1.3 Langevin方程和Fokker-Planck方程 | 第42-44页 |
| 2.1.4 Langevin理论 | 第44-47页 |
| 2.2 随机动力学的数值模拟方法 | 第47-54页 |
| 2.2.1 差分算法 | 第47-48页 |
| 2.2.2 Gillespie精确随机模拟算法 | 第48-50页 |
| 2.2.3 τ跳跃算法 | 第50-54页 |
| 第三章 不同反馈机制下结肠细胞表型间的随机涨落 | 第54-80页 |
| 3.1 引言 | 第54-57页 |
| 3.2 结肠隐窝内含有四种反馈机制的一般模型 | 第57-62页 |
| 3.3 稳态附近细胞种群的相对涨落公式 | 第62-67页 |
| 3.4 四种反馈机制下各细胞种群性质随净增长速率变化的不同 | 第67-76页 |
| 3.4.1 突变过程及肿瘤的产生 | 第67-69页 |
| 3.4.2 各细胞表型稳态值随净增长速率的变化 | 第69-70页 |
| 3.4.3 Fano因子上类似的范德瓦尔斯相变 | 第70-73页 |
| 3.4.4 协方差随净增长速率变化的不同 | 第73-75页 |
| 3.4.5 敏感性随净增长速率变化的不同 | 第75-76页 |
| 3.5 不同方法之间的比较 | 第76-77页 |
| 3.6 总结与讨论 | 第77-80页 |
| 第四章 噪声诱导的乳腺癌内多细胞表型及表型转换的分子机制 | 第80-100页 |
| 4.1 引言 | 第80-82页 |
| 4.2 计算模型 | 第82-83页 |
| 4.3 表型转换之间的理论 | 第83-85页 |
| 4.4 相空间的确定性轨迹、概率分布以及势能景观图 | 第85-86页 |
| 4.5 多细胞表型态的相图 | 第86-87页 |
| 4.6 肿瘤治疗中的TGF-β悖论 | 第87-88页 |
| 4.7 TGF-β在肿瘤扩散中的作用 | 第88-89页 |
| 4.8 乳腺癌的五种临床分型 | 第89-90页 |
| 4.9 乳腺癌SUM159细胞系 | 第90-93页 |
| 4.9.1 三种细胞表型的平衡分布 | 第90-92页 |
| 4.9.2 LBS相的亚相图 | 第92-93页 |
| 4.10 干细胞型和基底型细胞之间的转换 | 第93-98页 |
| 4.10.1 D导致的转换 | 第94-95页 |
| 4.10.2 a_1导致的转换 | 第95-96页 |
| 4.10.3 a_2导致的转换 | 第96-97页 |
| 4.10.4 b_2导致的转换 | 第97-98页 |
| 4.11 总结和讨论 | 第98-100页 |
| 第五章 总结和展望 | 第100-102页 |
| 参考文献 | 第102-117页 |
| 博士期间发表的论文 | 第117-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
