| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略语表 | 第14-15页 |
| 1 引言 | 第15-32页 |
| 1.1 绒山羊(Capra Hircus)概况 | 第15页 |
| 1.2 绒山羊育种研究现状 | 第15-16页 |
| 1.3 绒山羊皮肤毛囊的生物学概述 | 第16-17页 |
| 1.3.1 绒山羊皮肤毛囊的基本结构 | 第16页 |
| 1.3.2 绒山羊毛囊形态发生 | 第16-17页 |
| 1.3.3 绒山羊毛囊周期性生长 | 第17页 |
| 1.4 绒山羊毛囊生长、发育调控机理的研究 | 第17-20页 |
| 1.4.1 WNT传导信号通路 | 第17-18页 |
| 1.4.2 转化生长因子β(TGFβ)家族 | 第18-19页 |
| 1.4.3 细胞外基质(Extracellular matrix,ECM)与受体的相互作用(ECMRinteraction) | 第19页 |
| 1.4.4 Hedgehog信号通路 | 第19-20页 |
| 1.5 转录组学及转录组测序技术(RNA-seq) | 第20-25页 |
| 1.5.1 转录组学研究概要 | 第20-21页 |
| 1.5.2 转录组测序技术(RNA-seq) | 第21-22页 |
| 1.5.3 转录组测序在常见畜禽上的应用进展 | 第22-24页 |
| 1.5.4 转录组测序在绒山羊毛囊研究中的应用进展 | 第24-25页 |
| 1.6 蛋白质组学和蛋白质组学技术 | 第25-31页 |
| 1.6.1 蛋白质组学研究概要 | 第25-26页 |
| 1.6.2 蛋白质组学技术 | 第26-30页 |
| 1.6.3 蛋白质组学技术在绒山羊毛囊研究中的应用进展 | 第30-31页 |
| 1.7 本研究的目的、意义及主要研究内容 | 第31-32页 |
| 2 研究一 内蒙古绒山羊45d,55d,65d胎儿皮肤的转录组研究 | 第32-56页 |
| 2.1 试验材料 | 第32-33页 |
| 2.1.1 试验样品 | 第32页 |
| 2.1.2 主要试剂和仪器 | 第32-33页 |
| 2.2 试验方法 | 第33-39页 |
| 2.2.1 RNA的提取 | 第33-34页 |
| 2.2.2 RNA质量的检测 | 第34页 |
| 2.2.3 mRNA捕获 | 第34页 |
| 2.2.4 mRNA片段化 | 第34-35页 |
| 2.2.5 cDNA合成 | 第35-36页 |
| 2.2.6 PCR扩增 | 第36页 |
| 2.2.7 RNA-Seq | 第36页 |
| 2.2.8 数据质控和Map到基因组 | 第36-37页 |
| 2.2.9 差异表达基因(DEG)筛选 | 第37页 |
| 2.2.10 荧光定量PCR验证转录组测序 | 第37-38页 |
| 2.2.11 差异表达基因的生物信息学分析及功能预测 | 第38-39页 |
| 2.2.12 可变剪接分析 | 第39页 |
| 2.3 结果与分析 | 第39-52页 |
| 2.3.1 总RNA的提取 | 第39页 |
| 2.3.2 测序数据质控 | 第39-41页 |
| 2.3.3 差异基因筛选 | 第41-42页 |
| 2.3.4 荧光定量PCR验证转录组测序结果 | 第42-43页 |
| 2.3.5 差异表达基因的生物信息学分析及功能预测 | 第43-50页 |
| 2.3.6 可变剪接分析结果 | 第50-52页 |
| 2.4 讨论 | 第52-55页 |
| 2.5 小结 | 第55-56页 |
| 3 研究二 毛囊发生发育关键候选基因在不同时期胎儿皮肤中的表达谱分析 | 第56-64页 |
| 3.1 试验材料 | 第56-57页 |
| 3.1.1 试验样品 | 第56页 |
| 3.1.2 主要试剂和仪器 | 第56-57页 |
| 3.2 试验方法 | 第57-59页 |
| 3.2.1 RNA的提取 | 第57页 |
| 3.2.2 RNA质量的检测 | 第57页 |
| 3.2.3 反转录 | 第57页 |
| 3.2.4 荧光定量PCR引物设计 | 第57-58页 |
| 3.2.5 荧光定量PCR反应操作步骤 | 第58-59页 |
| 3.2.6 数据处理 | 第59页 |
| 3.3 结果分析 | 第59-62页 |
| 3.3.1 RNA质量的检测 | 第59页 |
| 3.3.2 cDNA质量及引物特异性检测 | 第59-60页 |
| 3.3.3 SFRP4,WNT3,WNT10a和APC2基因在不同胎儿时期皮肤中的表达谱的研究 | 第60-62页 |
| 3.4 讨论 | 第62-63页 |
| 3.5 小结 | 第63-64页 |
| 4 研究三 内蒙古绒山羊45 d,55 d,65 d胎儿皮肤的蛋白组研究 | 第64-86页 |
| 4.1 试验材料 | 第64-65页 |
| 4.1.1 试验样品 | 第64页 |
| 4.1.2 主要试剂和仪器 | 第64-65页 |
| 4.2 试验方法 | 第65-69页 |
| 4.2.1 样品制备 | 第65-66页 |
| 4.2.2 SDS-PAGE电泳 | 第66页 |
| 4.2.3 FASP酶切总蛋白和肽段定量 | 第66页 |
| 4.2.4 肽段标记 | 第66-67页 |
| 4.2.5 质谱分析 | 第67页 |
| 4.2.6 数据分析 | 第67-69页 |
| 4.2.7 差异蛋白质筛选 | 第69页 |
| 4.2.8 WB验证ITRAQ测序 | 第69页 |
| 4.2.9 差异蛋白质的生物信息学分析 | 第69页 |
| 4.3 试验结果 | 第69-82页 |
| 4.3.1 定量结果 | 第69页 |
| 4.3.2 SDS-PAGE电泳 | 第69-70页 |
| 4.3.3 酶解肽段浓度测定 | 第70页 |
| 4.3.4 蛋白质鉴定结果 | 第70页 |
| 4.3.5 蛋白质定量及显著性检验 | 第70-72页 |
| 4.3.6 Western blot(WB)对ITRAQ验证结果 | 第72页 |
| 4.3.7 Gene Ontology(GO)功能注释结果 | 第72-74页 |
| 4.3.8 KEGG通路注释结果 | 第74-79页 |
| 4.3.9 差异蛋白质聚类分析结果 | 第79-81页 |
| 4.3.10 蛋白质与蛋白质的相互作用(PPI) | 第81-82页 |
| 4.4 讨论 | 第82-84页 |
| 4.5 小结 | 第84-86页 |
| 5 研究四 转录组学和蛋白组学数据联合分析、验证毛囊发生发育关键基因 | 第86-99页 |
| 5.1 试验材料 | 第86-87页 |
| 5.1.1 基础数据和试验样品 | 第86页 |
| 5.1.2 主要试剂和仪器 | 第86-87页 |
| 5.2 试验方法 | 第87-90页 |
| 5.2.1 整合两组学数据生物信息学分析 | 第87-88页 |
| 5.2.2 关键靶点DCN在绒山羊不同胎儿时期皮肤中的表达谱 | 第88页 |
| 5.2.3 绒山羊皮肤毛囊WB验证关键靶点 | 第88页 |
| 5.2.4 绒山羊的DCN基因过表达载体的构建 | 第88-90页 |
| 5.3 试验结果 | 第90-95页 |
| 5.3.1 毛囊发生发育关键基因的筛选 | 第90-92页 |
| 5.3.2 DCN基因在不同时期胎儿皮肤中的表达谱 | 第92页 |
| 5.3.3 Decorin在不同时期胎儿皮肤中的表达谱 | 第92-94页 |
| 5.3.4 过表达载体pEGFP-CI/DCN的构建 | 第94-95页 |
| 5.4 讨论 | 第95-97页 |
| 5.5 小结 | 第97-99页 |
| 6 全文结论、创新点及进一步研究的问题 | 第99-101页 |
| 6.1 结论 | 第99-100页 |
| 6.2 创新点 | 第100页 |
| 6.3 进一步研究的问题 | 第100-101页 |
| 致谢 | 第101-103页 |
| 参考文献 | 第103-112页 |
| 附录 | 第112-141页 |
| 作者简介 | 第141页 |
