基于基因表达谱的癌症干细胞调控基因的识别研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 本文研究背景 | 第8-9页 |
| 1.2 癌症基因表达谱的研究现状 | 第9-11页 |
| 1.3 本文的主要研究工作 | 第11-12页 |
| 第二章 辨别与癌症干细胞相关的基因 | 第12-31页 |
| 2.1 数据来源 | 第12页 |
| 2.2 数据预处理 | 第12-15页 |
| 2.3 生物信息学方法 | 第15-22页 |
| 2.3.1 WGCNA算法 | 第16-18页 |
| 2.3.2 基因集富集分析 | 第18-20页 |
| 2.3.3 MEGENA算法 | 第20-22页 |
| 2.4 与癌症干细胞相关的基因的辨别 | 第22-30页 |
| 2.4.1 BRCA数据分析结果 | 第22-27页 |
| 2.4.2 另外三组癌症数据分析结果 | 第27-28页 |
| 2.4.3 辨别与癌症干细胞相关的基因 | 第28-30页 |
| 2.5 小结 | 第30-31页 |
| 第三章 验证与癌症干细胞相关的基因 | 第31-39页 |
| 3.1 与癌症干细胞相关基因的表达方式 | 第31-36页 |
| 3.1.1 数据来源 | 第31-32页 |
| 3.1.2 数据预处理 | 第32-34页 |
| 3.1.3 分析结果 | 第34-36页 |
| 3.2 与癌症干细胞相关基因的TFs分析 | 第36-38页 |
| 3.3 小结 | 第38-39页 |
| 第四章 辨别与癌症干细胞相关的关键调控基因 | 第39-53页 |
| 4.1 数据 | 第39页 |
| 4.2 构建基因调控网络的方法 | 第39-42页 |
| 4.2.1 随机森林算法 | 第39-40页 |
| 4.2.2 Graphical Lasso算法 | 第40-41页 |
| 4.2.3 秩和检验 | 第41-42页 |
| 4.3 关键调控基因的辨别 | 第42-49页 |
| 4.3.1 BRCA中关键调控基因的辨别 | 第42-46页 |
| 4.3.2 另外三种癌症的调控网络的构建 | 第46-49页 |
| 4.4 关键调控基因的分析 | 第49-52页 |
| 4.5 小结 | 第52-53页 |
| 第五章 总结与展望 | 第53-55页 |
| 5.1 总结 | 第53页 |
| 5.2 展望 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
