| 致谢 | 第1-5页 |
| 中文摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-16页 |
| 第一章 绪论 | 第16-35页 |
| ·植物在不同温度条件下的生理生态响应 | 第16-22页 |
| ·温度对植物细胞膜系统的影响 | 第16-18页 |
| ·温度对基因表达和蛋白合成的影响 | 第18-20页 |
| ·温度对光合和呼吸作用的影响 | 第20-22页 |
| ·藻类基因组和转录组学研究现状 | 第22-29页 |
| ·基因组及转录组学简介 | 第22-24页 |
| ·微型藻类基因组学与转录组学相关研究进展 | 第24-27页 |
| ·大型藻类基因组学与转录组学相关研究进展 | 第27-29页 |
| ·长心卡帕藻地理分布、生长特点及研究现状 | 第29-31页 |
| ·橘色藻地理分布、生长特点及研究现状 | 第31-34页 |
| ·本课题研究目的、内容及意义 | 第34-35页 |
| 第二章 长心卡帕藻转录组序列测定及拼接 | 第35-60页 |
| ·实验材料 | 第35-37页 |
| ·长心卡帕藻样品培养及处理 | 第35-36页 |
| ·主要化学试剂和仪器 | 第36页 |
| ·主要仪器设备 | 第36-37页 |
| ·实验方法 | 第37-43页 |
| ·长心卡帕藻总RNA的提取及检测 | 第37-38页 |
| ·长心卡帕藻测序文库的制备 | 第38-39页 |
| ·长心卡帕藻基础生物信息分析 | 第39-43页 |
| ·结果与讨论 | 第43-59页 |
| ·长心卡帕藻RNA质量检测 | 第43-46页 |
| ·长心卡帕藻原始数据整理、过滤及质量评估 | 第46-51页 |
| ·长心卡帕藻转录组序列拼接 | 第51-54页 |
| ·长心卡帕藻编码蛋白框的预测 | 第54-55页 |
| ·长心卡帕藻unigene功能分类及代谢通路分析 | 第55-59页 |
| ·小结 | 第59-60页 |
| 第三章 长心卡帕藻高温/低温胁迫下基因差异表达特征分析 | 第60-79页 |
| ·实验材料 | 第60页 |
| ·实验方法 | 第60-62页 |
| ·长心卡帕藻Unigene的表达量及表达差异分析 | 第60-61页 |
| ·长心卡帕藻差异表达的Unigene的富集分析 | 第61页 |
| ·叶绿素荧光诱导动力学在长心卡帕藻温度胁迫研究中应用 | 第61-62页 |
| ·结果与讨论 | 第62-77页 |
| ·长心卡帕藻差异基因的筛选 | 第62-69页 |
| ·长心卡帕藻Unigene序列表达丰度分析 | 第62-64页 |
| ·长心卡帕藻不同温度条件下差异表达基因筛选 | 第64-65页 |
| ·长心卡帕藻差异表达基因聚类分析 | 第65-67页 |
| ·温度胁迫对叶绿素荧光光合电子传递的影响 | 第67-69页 |
| ·长心卡帕藻光合作用分析 | 第69-77页 |
| ·光合作用 | 第69-76页 |
| ·光合作用天线蛋白 | 第76-77页 |
| ·小结 | 第77-79页 |
| 第四章 乔利橘色藻碳固定和类胡萝卜素生物合成路径分析 | 第79-98页 |
| ·实验材料 | 第79-81页 |
| ·样品采集 | 第79-81页 |
| ·RNA提取与文库测序 | 第81页 |
| ·实验方法 | 第81页 |
| ·数据过滤与分析 | 第81页 |
| ·色素含量测定及显微观察 | 第81页 |
| ·结果与讨论 | 第81-97页 |
| ·乔利橘色藻转录组序列拼接及注释 | 第81-87页 |
| ·Illumina测序及序列拼接 | 第81-83页 |
| ·Unigene功能注释与分类 | 第83页 |
| ·NR注释 | 第83-84页 |
| ·GO功能注释与途径分析 | 第84-85页 |
| ·COG功能注释与途径分析 | 第85-86页 |
| ·KEGG功能注释与途径分析 | 第86-87页 |
| ·乔利橘色藻SSR与SNP发掘 | 第87-90页 |
| ·EST-SSR的发掘及其分布 | 第87-88页 |
| ·T.jolithus生理特性及18S测定 | 第88-90页 |
| ·乔利橘色藻重要代谢通路分析 | 第90-97页 |
| ·碳固定 | 第91-93页 |
| ·脂肪酸生物合成 | 第93-94页 |
| ·类胡萝卜素生物合成 | 第94-97页 |
| ·小结 | 第97-98页 |
| 第五章 结论与展望 | 第98-101页 |
| ·长心卡帕藻不同温度条件下光合作用分析 | 第98-99页 |
| ·乔利橘色藻碳固定和类胡萝卜素的合成分析 | 第99页 |
| ·研究展望 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-111页 |
| 附录 | 第111-131页 |
| 作者简介及博士期间发表文章 | 第131页 |
