| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第11-12页 |
| 目录 | 第12-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-26页 |
| ·研究背景与国内外研究现状 | 第14-23页 |
| ·小蛋白研究 | 第14-18页 |
| ·植物基因组研究 | 第18-23页 |
| ·研究目的和意义 | 第23页 |
| ·本文主要工作内容 | 第23-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-36页 |
| ·数据获取 | 第26-28页 |
| ·所用软件和数据库介绍 | 第28-31页 |
| ·Blast和Blat | 第28-29页 |
| ·Inparanoid和Multiparanoid | 第29页 |
| ·InterProScan和WEGO | 第29-30页 |
| ·DAVID和KEGG | 第30页 |
| ·Pfam和InterPro | 第30-31页 |
| ·MEGA | 第31页 |
| ·CD-HIT | 第31页 |
| ·数据分析流程 | 第31-36页 |
| ·数据预处理 | 第31-32页 |
| ·基本特征分析 | 第32-33页 |
| ·同源聚类和功能分析 | 第33-34页 |
| ·演化分析 | 第34-36页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第36-60页 |
| ·植物小蛋白的基本特征分析 | 第36-41页 |
| ·小蛋白长度分布和所占比例的统计分析 | 第36-38页 |
| ·氨基酸使用频率的统计分析 | 第38-40页 |
| ·小蛋白外显子数量的统计分析 | 第40-41页 |
| ·植物小蛋白的同源聚类和功能分析 | 第41-48页 |
| ·小蛋白保守性分析 | 第41-44页 |
| ·不同保守度小蛋白的功能分析 | 第44-48页 |
| ·植物小蛋白的演化特征分析 | 第48-60页 |
| ·小蛋白结构域模式分析 | 第48-50页 |
| ·不同物种小蛋白拷贝数的变化分析 | 第50-52页 |
| ·小蛋白的系统发生树分析 | 第52-60页 |
| 第四章 总结 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-70页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第70页 |