| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-22页 |
| ·钝吻黄盖鲽研究综述 | 第10-13页 |
| ·钝吻黄盖鲽形态特征 | 第10页 |
| ·钝吻黄盖鲽生活习性 | 第10-11页 |
| ·钝吻黄盖鲽分布概况 | 第11页 |
| ·钝吻黄盖鲽繁殖和养殖概况 | 第11-12页 |
| ·钝吻黄盖鲽研究进展 | 第12-13页 |
| ·新一代测序技术发展状况 | 第13-17页 |
| ·新一代测序技术的特点 | 第13-14页 |
| ·新一代高通量测序技术 | 第14-15页 |
| ·新一代测序技术动植物研究中的应用 | 第15-17页 |
| ·分子标记 | 第17-19页 |
| ·分子标记的定义、分类及应用 | 第17页 |
| ·微卫星（SSR）分子标记 | 第17页 |
| ·微卫星（SSR）分子标记的应用 | 第17-19页 |
| ·基因组连锁图构建 | 第17-18页 |
| ·系谱认证 | 第18页 |
| ·遗传多样性分析 | 第18-19页 |
| ·微卫星的开发方法 | 第19-21页 |
| ·构建小片段基因组文库 | 第19-20页 |
| ·通过数据库检索微卫星序列 | 第20页 |
| ·利用近缘种的微卫星序列 | 第20页 |
| ·构建微卫星 DNA 富集文库筛选微卫星标记 | 第20-21页 |
| ·Roche 454 开发方法 | 第21页 |
| ·研究的目的及意义 | 第21-22页 |
| 第二章 基于 Roche 454 GS FLX 的钝吻黄盖鲽微卫星标记的开发 | 第22-31页 |
| ·材料与方法 | 第23-25页 |
| ·样品来源 | 第23页 |
| ·主要试剂和耗材 | 第23页 |
| ·钝吻黄盖鲽基于 Roche454 GS FLX 微卫星富集文库的构建 | 第23-25页 |
| ·DNA 的提取，片段化和连接 | 第23-24页 |
| ·SSR 探针的合成，文库变性 | 第24页 |
| ·SSR 文库磁珠富集、清洗及洗脱 | 第24页 |
| ·SSR 富集及纯化 | 第24页 |
| ·Roche 上机 | 第24-25页 |
| ·数据分析 | 第25页 |
| ·多态性检测 | 第25页 |
| ·结果 | 第25-28页 |
| ·高通量测序结果 | 第25-26页 |
| ·微卫星位点片段分布大小的总体情况 | 第26页 |
| ·毛细管电泳荧光标记检测 | 第26-27页 |
| ·位点多态性检测 | 第27-28页 |
| ·讨论 | 第28-31页 |
| ·探针的选择 | 第28页 |
| ·聚类分析 | 第28-29页 |
| ·Roche454 开发微卫星位点的优势 | 第29-31页 |
| 第三章 钝吻黄盖鲽野生和养殖群体的遗传多样性分析 | 第31-40页 |
| ·材料与方法 | 第31-33页 |
| ·样品来源 | 第31页 |
| ·主要试剂和耗材 | 第31-32页 |
| ·钝吻黄盖鲽微卫星位点的合成与扩增 | 第32页 |
| ·数据分析 | 第32-33页 |
| ·结果 | 第33-36页 |
| ·DNA 的提取纯化及浓度测定 | 第33-34页 |
| ·微卫星位点基因分型 | 第34页 |
| ·野生和养殖群体的遗传多样性 | 第34-36页 |
| ·讨论 | 第36-40页 |
| ·钝吻黄盖鲽野生和养殖群体的遗传多样性 | 第36-38页 |
| ·哈温平衡 | 第38页 |
| ·群体遗传结构 | 第38-39页 |
| ·荧光标记毛细管电泳技术 | 第39-40页 |
| 第四章 钝吻黄盖鲽微卫星位点在近缘物种的通用性研究 | 第40-45页 |
| ·材料与方法 | 第40-41页 |
| ·样品来源及 DNA 提取 | 第40-41页 |
| ·试验方法 | 第41页 |
| ·钝吻黄盖鲽微卫星位点的跨种筛选与多样性检测 | 第41页 |
| ·数据分析 | 第41页 |
| ·结果 | 第41-44页 |
| ·DNA 的提取纯化及浓度测定 | 第41-42页 |
| ·钝吻黄盖鲽微卫星位点对其它物种的通用性 | 第42页 |
| ·群体遗传多样性 | 第42-44页 |
| ·讨论 | 第44-45页 |
| 第五章 结论 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-55页 |
| 附录 | 第55-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 发表学术论文 | 第59页 |
