| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-22页 |
| §1.1 味觉的生理基础 | 第9-10页 |
| §1.2 苦味化合物 | 第10-11页 |
| §1.3 苦味受体基因的鉴定 | 第11-12页 |
| §1.4 苦味信号的传导 | 第12-13页 |
| §1.5 GPCR家族简介 | 第13-14页 |
| §1.6 人类苦味受体家族 | 第14-15页 |
| §1.7 人类苦味受体的脱孤研究 | 第15-18页 |
| §1.8 本论文的主要研究内容 | 第18-19页 |
| 参考文献 | 第19-22页 |
| 第二章 理论基础和计算方法简介 | 第22-39页 |
| §2.1 蛋白质三级结构预测 | 第23-26页 |
| §2.1.1 比较建模法 | 第23-24页 |
| §2.1.2 反向折叠法 | 第24页 |
| §2.1.3 从头预测法 | 第24-26页 |
| §2.2 GPCR的三级结构预测 | 第26-28页 |
| §2.2.1 GPCR三级结构的比较建模 | 第26页 |
| §2.2.2 GPCR三级结构的从头预测 | 第26-28页 |
| §2.3 分子对接 | 第28-31页 |
| §2.3.1 受体的选择和准备 | 第29页 |
| §2.3.2 配体的选择与准备 | 第29-30页 |
| §2.3.3 对接 | 第30页 |
| §2.3.4 对接结果的评估 | 第30-31页 |
| §2.4 分子动力学模拟 | 第31-35页 |
| §2.4.1 初始位置及速度 | 第31-33页 |
| §2.4.2 受力计算 | 第33页 |
| §2.4.3 积分方法 | 第33-34页 |
| §2.4.4 周期性边界条件 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-39页 |
| 第三章 人类38号苦味受体的三级结构预测、分子对接及分子动力学模拟研究 | 第39-67页 |
| §3.1 引言 | 第39-40页 |
| §3.2 方法和步骤 | 第40-45页 |
| §3.2.1 hTAS2R38三级结构的比较建模 | 第40-41页 |
| §3.2.2 分子对接 | 第41-43页 |
| §3.2.3 分子动力学模拟 | 第43-45页 |
| §3.3 结果与讨论 | 第45-60页 |
| §3.3.1 hTAS2R38的三级结构的模建 | 第45-51页 |
| §3.3.2 分子对接 | 第51-52页 |
| §3.3.3 hTAS2R38的分子动力学模拟 | 第52-56页 |
| §3.3.4 不同模拟体系中hTAS2R38模型的二级结构变化比较 | 第56-60页 |
| §3.4 本章小结 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-67页 |
| 第四章 人类1号苦味受体的三级结构预测、分子对接及分子动力学模拟研究 | 第67-106页 |
| §4.1 引言 | 第67-68页 |
| §4.2 方法和步骤 | 第68-71页 |
| §4.2.1 hTAS2R1三级结构的模建 | 第69页 |
| §4.2.2 分子对接 | 第69-70页 |
| §4.2.3 分子动力学模拟 | 第70-71页 |
| §4.3 结果与讨论 | 第71-98页 |
| §4.3.1 hTAS2R1的三级结构的模建 | 第71-72页 |
| §4.3.2 具有正确序列比对的hTAS2T1三级结构模型的评估 | 第72-76页 |
| §4.3.3 分子动力学模拟过程中hTAS2R1模型的结构稳定性 | 第76-82页 |
| §4.3.4 hTAS2R1的结合位点分析 | 第82-84页 |
| §4.3.5 跨膜螺旋区域的构象变化 | 第84-87页 |
| §4.3.6 胞内外环区的构象变化 | 第87-93页 |
| §4.3.7 hTAS2R1激活的构象开关 | 第93-98页 |
| §4.4 本章小结 | 第98-100页 |
| 参考文献 | 第100-106页 |
| 第五章 论文总结 | 第106-109页 |
| §5.1 论文主要结论 | 第106-107页 |
| §5.2 论文创新点 | 第107页 |
| §5.3 展望 | 第107-109页 |
| 附录 | 第109-113页 |
| 致谢 | 第113-114页 |
