| 目录 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-11页 |
| ABSTRACT | 第11-16页 |
| 符号说明及缩写词 | 第16-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-45页 |
| ·粘细菌简介 | 第19-26页 |
| ·粘细菌的分类地位 | 第19-20页 |
| ·粘细菌的典型特征 | 第20-21页 |
| ·粘细菌的生理学活性及其次级代谢产物 | 第21-24页 |
| ·纤维堆囊菌属及其次级代谢产物 | 第24-26页 |
| ·聚酮类天然产物及其生物合成特征 | 第26-31页 |
| ·聚酮类天然产物 | 第26页 |
| ·聚酮化合物的生物合成酶系与类型 | 第26-29页 |
| ·模块聚酮合酶及其相关基因簇特征 | 第29-31页 |
| ·粘细菌模块类聚酮化合物研究现状与新颖特征 | 第31-39页 |
| ·粘细菌模块类聚酮化合物研究现状 | 第31-32页 |
| ·粘细菌模块类聚酮化合物的新颖特征 | 第32-39页 |
| ·纤维堆囊菌模块类聚酮化合物研究现状 | 第39页 |
| ·埃博霉素的价值及其生物学研究现状 | 第39-44页 |
| ·埃博霉素的价值与研究进展 | 第39-41页 |
| ·埃博霉素的研究现状 | 第41-44页 |
| ·本文工作开展思路及研究内容 | 第44-45页 |
| 第二章 纤维堆囊菌基因组粘粒文库的构建与保藏 | 第45-73页 |
| ·引言 | 第45页 |
| ·材料与仪器试剂 | 第45-50页 |
| ·菌株及质粒 | 第45-46页 |
| ·培养基及试剂 | 第46-48页 |
| ·主要仪器设备与耗材 | 第48-50页 |
| ·实验方法 | 第50-61页 |
| ·纤维堆囊菌So0157-2菌体培养与收集 | 第50页 |
| ·宿主细胞 XL1-Blue MR的活化与粘粒载体的扩增 | 第50-52页 |
| ·粘粒载体的处理 | 第52-53页 |
| ·高分子量基因组 DNA的制备和脉冲场凝胶电泳检测 | 第53-55页 |
| ·高分子量基因组 DNA的后续处理 | 第55-56页 |
| ·连接与包装 | 第56-57页 |
| ·效价测定与文库阳性率检测 | 第57-58页 |
| ·粘粒文库的扩增与保存 | 第58-61页 |
| ·实验结果与讨论 | 第61-72页 |
| ·So0157-2菌株的特征 | 第61-62页 |
| ·基因组粘粒文库的构建与质量检测 | 第62-69页 |
| ·文库的保存与杂交膜的制备 | 第69-72页 |
| ·本章小结 | 第72-73页 |
| 第三章 埃博霉素生物合成基因簇的杂交筛选及其粘粒克隆的初步定位 | 第73-108页 |
| ·引言 | 第73页 |
| ·材料与仪器试剂 | 第73-77页 |
| ·菌株及质粒 | 第74页 |
| ·培养基及试剂 | 第74-76页 |
| ·主要仪器与设备 | 第76页 |
| ·分析软件及数据库 | 第76-77页 |
| ·实验方法 | 第77-93页 |
| ·探针的设计 | 第77页 |
| ·目的探针片段的克隆与测序鉴定 | 第77-85页 |
| ·探针的标记及检测 | 第85-86页 |
| ·杂交筛选条件的确立及大规模文库筛选 | 第86-89页 |
| ·阳性克隆的鉴定及定位分布 | 第89-93页 |
| ·实验结果与讨论 | 第93-107页 |
| ·探针的设计与克隆 | 第93-94页 |
| ·探针的标记检测与杂交筛选 | 第94-101页 |
| ·埃博霉素相关粘粒克隆的末端测序 | 第101-107页 |
| ·本章小结 | 第107-108页 |
| 第四章 埃博霉素生物合成全基因簇的序列测定与装配 | 第108-131页 |
| ·引言 | 第108页 |
| ·材料与仪器试剂 | 第108-109页 |
| ·菌株及质粒 | 第108页 |
| ·培养基及试剂 | 第108-109页 |
| ·主要仪器设备与耗材 | 第109页 |
| ·软件工具及数据库 | 第109页 |
| ·实验方法 | 第109-118页 |
| ·基因簇主体部分的亚克隆测序及装配拼接 | 第109-115页 |
| ·基因簇上游序列的克隆与测序 | 第115-116页 |
| ·基因簇下游序列的亚克隆测定与装配 | 第116-117页 |
| ·埃博霉素相关序列完全装配与粘粒克隆定位 | 第117-118页 |
| ·实验结果与讨论 | 第118-129页 |
| ·埃博霉素阳性粘粒克隆的大量制备 | 第118-120页 |
| ·基因簇主体部分的亚克隆测序及装配 | 第120-126页 |
| ·基因簇上游序列的克隆与测序 | 第126-127页 |
| ·基因簇下游序列的测定与装配 | 第127-129页 |
| ·基因簇及其上下游序列的完全装配 | 第129页 |
| ·本章小结 | 第129-131页 |
| 第五章 埃博霉素生物合成基因簇及其上下游序列的注释与分析 | 第131-154页 |
| ·引言 | 第131页 |
| ·材料与仪器试剂 | 第131-133页 |
| ·菌株及质粒 | 第131-132页 |
| ·培养基及试剂 | 第132页 |
| ·主要仪器与设备 | 第132页 |
| ·软件工具及数据库 | 第132-133页 |
| ·实验方法 | 第133-139页 |
| ·全序列 ORFs注释分析与埃博霉素阳性粘粒物理图谱绘制 | 第133-134页 |
| ·全序列启动子预测 | 第134页 |
| ·多个埃博霉素生物合成基因簇上游序列的克隆比对 | 第134-135页 |
| ·启动子预测与基因簇前端启动子区的功能验证 | 第135-139页 |
| ·实验结果与讨论 | 第139-153页 |
| ·全序列ORFs注释结果与埃博霉素粘粒物理图谱 | 第139-141页 |
| ·基因簇下游预测注释的调控蛋白ORFs分析 | 第141-144页 |
| ·三个埃博霉素生物合成基因簇及其两端序列的比较分析 | 第144-146页 |
| ·三个埃博霉素生物合成基因簇全序列启动子预测比较分析 | 第146-147页 |
| ·多个埃博霉素生物合成基因簇前端非编码区序列分析 | 第147-149页 |
| ·基因簇前端启动子的功能验证 | 第149-153页 |
| ·本章小结 | 第153-154页 |
| 第六章 纤维堆囊菌酮基合酶基因进化多样性分析 | 第154-173页 |
| ·引言 | 第154页 |
| ·材料与仪器试剂 | 第154-157页 |
| ·菌株及质粒 | 第154-155页 |
| ·培养基及试剂 | 第155页 |
| ·主要仪器与设备 | 第155-156页 |
| ·数据库及分析软件 | 第156-157页 |
| ·实验方法 | 第157-164页 |
| ·染色体 DNA提取、PCR扩增及 TA连接 | 第157页 |
| ·电转化 | 第157-158页 |
| ·大量转化子的分析及测序 | 第158-161页 |
| ·数据检索和序列分析 | 第161-164页 |
| ·实验结果与讨论 | 第164-172页 |
| ·实验结果 | 第164-171页 |
| ·讨论 | 第171-172页 |
| ·本章小结 | 第172-173页 |
| 总结与展望 | 第173-175页 |
| 附录 | 第175-211页 |
| 参考文献 | 第211-221页 |
| 致谢 | 第221-222页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第222-223页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第223页 |
