| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-16页 |
| ·鲤鱼全基因组研究进展 | 第8页 |
| ·cDNA 文库构建的研究进展 | 第8-13页 |
| ·cDNA 文库简介 | 第8-9页 |
| ·全长 cDNA 文库的构建方法 | 第9-11页 |
| ·均一化全长 cDNA 文库构建原理及方法 | 第11-12页 |
| ·均一化全长 cDNA 文库的应用 | 第12-13页 |
| ·表达序列标签（EST）及应用 | 第13-14页 |
| ·EST 概念和特点 | 第13页 |
| ·应用 | 第13-14页 |
| ·生物信息学技术及分析方法 | 第14-16页 |
| ·生物信息学简介 | 第14页 |
| ·生物信息学 EST 分析方法 | 第14-16页 |
| 第二章 鲤鱼均一化全长 cDNA 文库的构建以及大规模测序 | 第16-32页 |
| ·实验材料 | 第16-18页 |
| ·样品 | 第16页 |
| ·主要试剂及配制 | 第16-17页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第17-18页 |
| ·实验方法 | 第18-27页 |
| ·鲤鱼 Total RNA 的提取 | 第18页 |
| ·mRNA 的分离 | 第18-19页 |
| ·全长 cDNA 文库的构建 | 第19-24页 |
| ·全长 cDNA 文库的构建文库质量鉴定 | 第24页 |
| ·均一化文库构建 | 第24-26页 |
| ·鲤鱼均一化全长 cDNA 文库测序 | 第26-27页 |
| ·结果与讨论 | 第27-32页 |
| ·鲤鱼总 RNA 的提取 | 第27-28页 |
| ·mRNA 的分离 | 第28页 |
| ·全长 cDNA 文库滴度检测及库容量计算 | 第28-29页 |
| ·全长 cDNA 文库的构建文库质量鉴定 | 第29-30页 |
| ·均一化文库构建 | 第30-31页 |
| ·鲤鱼均一化全长 cDNA 文库大规模测序 | 第31-32页 |
| 第三章 鲤鱼均一化全长 cDNA 文库 ESTs 序列生物信息学分析 | 第32-36页 |
| ·软件及使用方法 | 第32-33页 |
| ·文库测序数据预处理 | 第32页 |
| ·EST 功能注释 | 第32-33页 |
| ·结果与讨论 | 第33-36页 |
| ·ESTs 数据分析 | 第33页 |
| ·基于鲤鱼大规模 ESTs 数据长度分布及 GC 含量分析 | 第33页 |
| ·Unigene 的 GO 注释 | 第33-34页 |
| ·讨论 | 第34-36页 |
| 第四章 两个感兴趣基因的结构和功能生物信息学预测 | 第36-44页 |
| ·Rab 蛋白简述 | 第36页 |
| ·材料与方法 | 第36-38页 |
| ·实验材料 | 第36-37页 |
| ·RNA 提取及 cDNA 合成 | 第37页 |
| ·rab1a 基因的获取 | 第37页 |
| ·进化树分析 | 第37页 |
| ·基因表达 qRT-PCR 分析 | 第37-38页 |
| ·结果与讨论 | 第38-44页 |
| ·Rab1a 基因进化树分析 | 第38-40页 |
| ·Rab1a 基因序列分析 | 第40页 |
| ·Rab1a 蛋白分析 | 第40-42页 |
| ·Rab1a 差异表达分析 | 第42-43页 |
| ·讨论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-50页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第50-53页 |
| 致谢 | 第53页 |
