| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-17页 |
| 第一章 CHAPTER Ⅰ INTRODUCTION | 第17-40页 |
| ·Biological nitrogen fixation | 第17-26页 |
| ·Symbiotic nitrogen fixation | 第19页 |
| ·Associative nitrogen fixation | 第19-21页 |
| ·Free living nitrogen fixation | 第21-22页 |
| ·The nitrogen fixation process | 第22-23页 |
| ·Background of nitrogen fixation | 第23-24页 |
| ·Nitrogen fixation and sustainability | 第24-25页 |
| ·Nitrogen fixation and crop productivity | 第25-26页 |
| ·Nitrogen fixation genes | 第26页 |
| ·rpoB gene mutatbn | 第26-27页 |
| ·Plant-bacteria interactions | 第27-31页 |
| ·The rhizosphere and the diazotrophs | 第28-29页 |
| ·Interaction of bacteria with crops | 第29-31页 |
| ·Root colonization by bacteria | 第31-32页 |
| ·Root exudates | 第32-34页 |
| ·The rhizosphere effect and root exudates | 第33页 |
| ·Plant-bacteria interaction mediated by root exudates | 第33-34页 |
| ·Bacterial genes expression during bacteria-plant interactions | 第34页 |
| ·Genomics in nitrogen fixing bacteria | 第34-39页 |
| ·Klebsiella pneumoniae 342 | 第34-36页 |
| ·Azoarcus sp. strain BH72 | 第36页 |
| ·Azospirillum | 第36-37页 |
| ·Pseudomonas stutzeri | 第37-39页 |
| ·Hypothesis | 第39页 |
| ·Objectives of the study | 第39-40页 |
| 第二章 CHAPTER Ⅱ ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF NITROGEN-FIXING ISOLATES FROM THE SUGARCANE RHIZOSPHERE | 第40-55页 |
| Summary | 第40页 |
| ·Introduction | 第40-41页 |
| ·Materials and Methods | 第41-45页 |
| ·DNA extraction | 第41-42页 |
| ·Isolation ofbacteria | 第42页 |
| ·Morphology of the strains | 第42页 |
| ·Physiological and biochemical tests | 第42-43页 |
| ·Acetylene reduction assay and colorimetric estimation of indoleacetic acid production | 第43页 |
| ·PCR amplification and sequencing of 16S rRNA genes | 第43-44页 |
| ·PCR amplification and sequencing of the nifH genes | 第44-45页 |
| ·DNA sequencing and phylogenetic analysis | 第45页 |
| ·Statistical analyses | 第45页 |
| ·Nucleotide sequence accession numbers | 第45页 |
| ·Results | 第45-51页 |
| ·Phylogenetic position of the isolates | 第45-46页 |
| ·Morphological characteristics | 第46页 |
| ·Physiological and biochemical characteristics | 第46-49页 |
| ·Nitrogenase activity and plant growth promoting trait | 第49-50页 |
| ·nifH gene characterization and phylogenetic analysis | 第50-51页 |
| ·Discussion | 第51-54页 |
| ·Phylogenetic position of the isolates | 第51页 |
| ·Isolation and morphological characteristics of strains | 第51-52页 |
| ·Physiological and biochemical characteristics | 第52页 |
| ·Nitrogenase activity | 第52-53页 |
| ·Phylogenetic analysis of nifH gene | 第53-54页 |
| ·Conclusion | 第54-55页 |
| 第三章 CHAPTER Ⅲ INSIGHT METABOLIC CAPABILITIES OF PSEUDOMONASSTUTZERI USING PHENOTYPE PROFILING OF RIF AMPIN-RESISTANTrpoB MUTANTS | 第55-73页 |
| Summary | 第55页 |
| ·Introduction | 第55-56页 |
| ·Materials and Methods | 第56-62页 |
| ·Isolation of rifampicin-resistant (Rif) A1501 mutants | 第56页 |
| ·Polymerase chain reaction (PCR) amplification of rpoB mutations | 第56-57页 |
| ·Cloning of rpoB mutants | 第57-62页 |
| ·Biolog phenotype profiling | 第62页 |
| ·Nitrogenase activity | 第62页 |
| ·Statistical analyses | 第62页 |
| ·Results | 第62-69页 |
| ·Identification of Rif mutants | 第62-66页 |
| ·Utilization patterns of GN2 MicroPlate substrates by the wt and Rif mutants of P. stutzeri | 第66-68页 |
| ·Nirogenase activity | 第68-69页 |
| ·Discussion | 第69-72页 |
| ·Rif rpoB mutants of P. stutzeri | 第69页 |
| ·Utilization patterns of GN2 MicroPlate substrates for phenotype scoring of wt and Rif mutants ofP. stutzeri | 第69-71页 |
| ·Utilization of carboxylic acid and amino acids | 第71-72页 |
| ·Nitrogenase activity | 第72页 |
| ·Conclusion | 第72-73页 |
| 第四章 CHAPTER Ⅳ TRANSCIPTIONAL ANALYSIS OF PSEUDOMONASSTUTZERI A1501 ASSOCIATED WITH HOST RICE | 第73-89页 |
| Summary | 第73页 |
| ·Introduction | 第73-75页 |
| ·Materials and methods | 第75-82页 |
| ·Bacterial strains and media | 第75页 |
| ·Sterilization and germination of rice seeds, and cultivation of rice seedlings | 第75-76页 |
| ·Root exudates collection | 第76-77页 |
| ·Determination of low molecular weight organic acid from root exudates by HPLC | 第77页 |
| ·Selection of genes responsible for bacteria-rice interactions | 第77-80页 |
| ·Establishment ofbacterium in to root exudates | 第80页 |
| ·Colonization of rice roots by Pseudomonas stutzeri strain | 第80页 |
| ·Scanning Electron Microscopic study | 第80-81页 |
| ·Iso lation of total RNA | 第81页 |
| ·Conversion to cDNA | 第81-82页 |
| ·Reverse transcription (RT)-PCR | 第82页 |
| ·Results | 第82-85页 |
| ·Organic acids of root exudates | 第82-83页 |
| ·Colonization of rice roots by P. stutzeri A1501 | 第83-84页 |
| ·Gene expressions | 第84-85页 |
| ·Discussion | 第85-88页 |
| ·Organic acids of root exudates | 第85-86页 |
| ·Colonization of rice roots by P. stutzeri A1501 | 第86-87页 |
| ·The regulation of gene expression by root expression | 第87-88页 |
| ·Conclusion | 第88-89页 |
| GENERAL CONCLUSION | 第89-90页 |
| REFERENCES | 第90-108页 |
| ACKNOWLEDGEMENT | 第108-110页 |
| RESUME | 第110-114页 |
