| 中文摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第1章 课题背景和研究目的 | 第8-11页 |
| ·基因表达调控网络研究背景 | 第8页 |
| ·ChIP‐Seq 技术发展背景 | 第8-9页 |
| ·本文的研究 | 第9-10页 |
| ·本课题研究的目的和意义 | 第10-11页 |
| 第2章 国内外研究现状 | 第11-17页 |
| ·多组学数据分析方法在癌症数据分析中的应用 | 第11-12页 |
| ·ChIP‐Seq 中 peak calling 算法软件的发展现状 | 第12-17页 |
| 第3章 ChIP-Seq 及多组学数据搜集 | 第17-20页 |
| ·ChIP‐Seq 数据搜集 | 第17页 |
| ·前列腺癌多组学数据搜集 | 第17-20页 |
| 第4章 Peak Calling 算法软件比较及整合 | 第20-28页 |
| ·富集位点数 | 第20-22页 |
| ·灵敏度 | 第22-25页 |
| ·一致性 | 第25页 |
| ·精确度 | 第25-26页 |
| ·peak calling 算法软件的整合 | 第26-28页 |
| 第5章 多组学数据分析及整合 | 第28-35页 |
| ·多组学数据分析 | 第28-31页 |
| ·DNA 甲基化数据分析 | 第28-29页 |
| ·转录因子与 DNA 结合数据分析 | 第29-30页 |
| ·microRNA 数据的分析筛选 | 第30页 |
| ·基因表达数据分析筛选 | 第30-31页 |
| ·多组学数据整合分析 | 第31-35页 |
| ·作用基因的筛选 | 第31-32页 |
| ·调控基因的配对重叠分析 | 第32-33页 |
| ·差异基因的功能富集分析 | 第33-34页 |
| ·富集通路的配对重叠分析 | 第34-35页 |
| ·富集通路的信息挖掘 | 第35页 |
| ·富集通路结果验证 | 第35-38页 |
| 第6章 结论与展望 | 第38-40页 |
| 参考文献 | 第40-47页 |
| 附录一 | 第47-49页 |
| 附录二 | 第49-52页 |
| 附录三 | 第52-53页 |
| 附录四 | 第53-58页 |
| 附录五 | 第58-61页 |
| 攻读硕士学位期间公开发表的论文 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |