| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-16页 |
| 英文缩略语 | 第16-17页 |
| 文献综述 模块识别方法研究进展及其在疾病或药物祀点网络中的应用 | 第17-26页 |
| 1 模块的概念与定义 | 第18-19页 |
| 2 模块识别方法的分类 | 第19-23页 |
| 3 识别出的模块的特点 | 第23页 |
| 4 模块化分析方法在疾病或药物範点网络中的应用 | 第23-25页 |
| 5 小结 | 第25-26页 |
| 第一部分 信号通路和网络水平不同组分治疗脑缺血的药理机制比较 | 第26-44页 |
| 前言 | 第26-27页 |
| 材料和方法 | 第27-30页 |
| 1 动物模型 | 第27页 |
| 2 分组与给药 | 第27页 |
| 3 脑梗死体积的计算 | 第27-28页 |
| 4 RNA提取 | 第28页 |
| 5 基因芯片制备 | 第28页 |
| 6 芯片数据分析 | 第28-30页 |
| 结果 | 第30-40页 |
| 1 IPA网络及功能分析结果 | 第30-38页 |
| 2 IPA通路分析结果(canonical pathways) | 第38-40页 |
| 讨论 | 第40-43页 |
| 小结 | 第43-44页 |
| 第二部分 功能模块水平不同组分治疗脑缺血的药理机制比较 | 第44-98页 |
| 前言 | 第44-45页 |
| 材料和方法 | 第45-55页 |
| 1 数据来源 | 第45-46页 |
| 2 蛋白质相互作用网络的构建和拓扑分析 | 第46-47页 |
| 3 功能模块识别 | 第47-50页 |
| 4 计算最小网络结构熵 | 第50-51页 |
| 5 模块的功能富集分析 | 第51-52页 |
| 6 计算模块拓扑结构与GO功能的关联 | 第52-54页 |
| 7 流程图 | 第54-55页 |
| 结果 | 第55-89页 |
| 1 蛋白质相互作用网络构建和拓扑属性分析 | 第55-56页 |
| 2 功能模块识别 | 第56-66页 |
| 3 模块的功能富集分析 | 第66-79页 |
| ·各组模块对应的GO功能和通路 | 第66-77页 |
| ·各组之间重叠的与不同的GO功能 | 第77-79页 |
| 4 模块拓扑结构与GO功能的关联 | 第79-81页 |
| 5 文献验证的结果 | 第81-89页 |
| 讨论 | 第89-97页 |
| 小结 | 第97-98页 |
| 第三部分 生物学实验验证 | 第98-119页 |
| 前言 | 第98-99页 |
| 材料和方法 | 第99-108页 |
| 结果 | 第108-113页 |
| 1 脑组织中Guk1、Hrsp12、Mrm1 mRNA表达水平 | 第108-112页 |
| 2 脑组织中Atf2、Fos、Cebpg蛋白表达水平 | 第112-113页 |
| 讨论 | 第113-118页 |
| 小结 | 第118-119页 |
| 结论 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-140页 |
| 致谢 | 第140-142页 |
| 个人简历 | 第142-144页 |
| 附件 | 第144-147页 |
