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玉米全基因组CCCH锌指蛋白基因家族进化分析

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
1 文献综述第7-23页
   ·锌指蛋白的研究进展第7页
   ·锌指蛋白的结构、分类、作用方式第7-9页
     ·锌指蛋白的结构第7页
     ·锌指蛋白的分类第7-8页
     ·锌指蛋白的作用方式第8-9页
   ·CCCH型锌指蛋白的研究进展第9-10页
   ·植物基因家族分子进化机制第10-13页
     ·基因家族的物种特异性扩张及其扩张模式第10-11页
     ·适应性进化第11-12页
     ·基因转换第12-13页
   ·生物信息学数据库服务系统及软件应用第13-22页
     ·数据库服务系统第13-19页
     ·生物信息学常用序列分析软件第19-22页
   ·生物信息学的展望第22-23页
2 引言第23-24页
3 材料与方法第24-27页
   ·基因组数据库序列来源第24页
   ·实验方法第24-25页
     ·玉米全基因组CCCH锌指蛋白基因的鉴定第24页
     ·玉米CCCH锌指蛋白基因进化树的构建及分类第24页
     ·玉米CCCH锌指蛋白基因编码的氨基酸序列属性分析第24页
     ·玉米CCCH锌指蛋白基因的复制第24页
     ·玉米CCCH锌指蛋白基因染色体物理位置定位第24-25页
     ·玉米CCCH锌指蛋白基因外显子和内含子结构分析第25页
     ·玉米CCCH锌指蛋白基因保守基序的分析第25页
     ·玉米CCCH锌指蛋白基因顺式作用元件的预测第25页
     ·Ka和Ks的计算第25页
   ·基因的表达模式分析第25-27页
     ·玉米CCCH基因的qRT-PCR分析第25-26页
     ·引物设计第26-27页
4 结果与分析第27-43页
   ·CCCH候选基因的确定与命名第27-29页
   ·玉米CCCH蛋白结构的分析第29-30页
   ·玉米CCCH基因的系统发生学分析及分类第30-31页
   ·玉米中CCCH基因染色体物理位置定位第31-32页
   ·玉米中CCCH基因的复制第32-33页
   ·玉米、水稻、拟南芥CCCH基序比较分析第33-34页
   ·玉米和拟南芥中CCCH基因家族的比较分析第34-36页
   ·玉米中可能参与逆境胁迫反应的CCCH基因启动子分析第36-37页
   ·Ka和Ks的计算及重复事件发生时间的估计第37-39页
   ·玉米CCCH基因的表达模式第39-43页
5 讨论第43-45页
6 结论第45-46页
参考文献第46-50页
致谢第50-51页
作者简介第51页

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