利用cDNA-AFLP技术分离木薯干旱胁迫响应相关基因
摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-11页 |
1 引言 | 第11-20页 |
·干旱胁迫与植物抗旱 | 第11-16页 |
·干旱胁迫对植物的影响 | 第11-13页 |
·生长抑制 | 第11页 |
·生物量的积累与分配 | 第11-12页 |
·气孔行为和光合作用 | 第12页 |
·活性氧氧化伤害 | 第12页 |
·呼吸作用异常 | 第12页 |
·物质代谢失调 | 第12页 |
·能量代谢失调 | 第12-13页 |
·植物干旱胁迫适应相关研究 | 第13-16页 |
·抗旱相关转录因子 | 第13页 |
·胁迫信号转导相关蛋白激酶 | 第13-14页 |
·功能蛋白和渗透调节因子 | 第14-16页 |
·木薯概述 | 第16-17页 |
·木薯概况 | 第16页 |
·木薯抗旱研究进展 | 第16-17页 |
·cDNA-AFLP技术 | 第17-19页 |
·cDNA-AFLP技术简介 | 第17-18页 |
·cDNA-AFLP技术的应用 | 第18-19页 |
·主要研究内容 | 第19页 |
·目的与意义 | 第19页 |
·技术路线 | 第19-20页 |
2 材料与方法 | 第20-36页 |
·仪器设备 | 第20页 |
·实验材料培养与处理 | 第20-21页 |
·cDNA-AFLP分析 | 第21-28页 |
·总RNA的提取与检测 | 第21页 |
·器皿处理 | 第21页 |
·木薯叶片总RNA提取 | 第21页 |
·DNA酶消化 | 第21-23页 |
·DNA酶消化 | 第21-22页 |
·RNA质量检测 | 第22-23页 |
·双链cDNA的合成 | 第23-25页 |
·第一链cDNA的合成 | 第23页 |
·双链cDNA的合成 | 第23-24页 |
·双链cDNA的纯化 | 第24-25页 |
·双链cDNA的限制性双酶切 | 第25页 |
·双链cDNA的限制性双酶切产物与接头连接 | 第25-26页 |
·接头的退火 | 第25页 |
·接头的连接 | 第25-26页 |
·cDNA-AFLP预扩增 | 第26-27页 |
·cDNA-AFLP选择性扩增 | 第27-28页 |
·聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显色 | 第28-29页 |
·聚丙烯酰胺凝胶的制备 | 第28页 |
·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第28-29页 |
·凝胶银染显色 | 第29页 |
·多态性片段的回收、纯化、测序 | 第29-32页 |
·聚丙烯酰胺凝胶差异条带DNA回收 | 第29-30页 |
·煮沸法 | 第29-30页 |
·直取法 | 第30页 |
·回收条带的二次PCR扩增 | 第30页 |
·二次扩增产物的纯化 | 第30页 |
·DNA的克隆 | 第30-31页 |
·转化 | 第31页 |
·阳性克隆鉴定 | 第31-32页 |
·测序 | 第32页 |
·差异表达序列的生物信息学分析 | 第32-33页 |
·两步法RT-PCR反应 | 第33-34页 |
·荧光定量PCR验证 | 第34-36页 |
·标准曲线的制作 | 第34-35页 |
·相对定量PCR反应 | 第35-36页 |
3 结果与分析 | 第36-53页 |
·木薯干旱胁迫处理结果 | 第36-37页 |
·干旱胁迫处理方法 | 第36页 |
·各采样时间点的植株表型 | 第36-37页 |
·总RNA的提取 | 第37-39页 |
·双链cDNA的合成 | 第39页 |
·cDNA-AFLP结果 | 第39-41页 |
·预扩增结果检测 | 第39页 |
·选择性扩增结果检测 | 第39-41页 |
·特异表达基因片段的回收及二次PCR扩增 | 第41-42页 |
·特异表达基因片段的克隆 | 第42页 |
·测序结果分析 | 第42-47页 |
·应答干旱胁迫逆境特异表达基因的功能分组 | 第47-50页 |
·RT-PCR结果分析 | 第50页 |
·荧光定量PCR结果分析 | 第50-53页 |
4 讨论 | 第53-63页 |
·干旱胁迫样品的处理和材料的选择 | 第53-54页 |
·关于cDNA-AFLP实验体系 | 第54-58页 |
·木薯RNA的提取 | 第54-55页 |
·关于酶切 | 第55页 |
·关于DNA片段分析 | 第55-56页 |
·聚丙烯酰胺凝胶DNA回收 | 第56-57页 |
·DNA片段克隆方法比较 | 第57-58页 |
·荧光定量PCR引物的设计 | 第58页 |
·木薯干旱胁迫响应差异表达条带的分析 | 第58-59页 |
·木薯干旱胁迫响应相关基因的生物学意义 | 第59-62页 |
·Ⅰ型表达的TDFs | 第59-60页 |
·Ⅱ型表达的TDFs | 第60页 |
·Ⅲ型表达的TDFs | 第60-61页 |
·Ⅳ型表达的TDFs | 第61-62页 |
·下一步工作 | 第62-63页 |
5 结论 | 第63-64页 |
参考文献 | 第64-71页 |
附录 | 第71-78页 |
附录一:缩略词表(Abbreviation) | 第71-72页 |
附录二:相关试剂的配制 | 第72-74页 |
附录三:18对TDFs的荧光定量引物 | 第74-75页 |
附录四:18个TDFs的荧光定量PCR分析结果 | 第75-78页 |
在读期间发表的学术论文 | 第78-79页 |
致谢 | 第79页 |