| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| Abbreviation | 第13-14页 |
| 第1章 绪论 | 第14-36页 |
| ·秸秆及畜禽粪便的堆肥综合利用 | 第15-19页 |
| ·堆肥的概念 | 第15页 |
| ·秸秆类木质纤维素的组成 | 第15-17页 |
| ·纤维素 | 第17-18页 |
| ·半纤维素和木质素 | 第18页 |
| ·堆肥中的氮源 | 第18-19页 |
| ·堆肥生境中多种微生物协同介导生物质转化 | 第19-23页 |
| ·秸秆堆肥固态发酵与微生物菌群 | 第19-21页 |
| ·秸秆堆肥固态发酵中的纤维素酶系 | 第21-23页 |
| ·宏基因组学研究堆肥生境中的功能微生物菌群 | 第23-34页 |
| ·宏基因组学 | 第23-25页 |
| ·宏基因组学的研究策略 | 第25-30页 |
| ·高通量测序技术 | 第30-34页 |
| ·立题依据 | 第34-36页 |
| 第2章 基于菌落形态的取样方法及其评价 | 第36-48页 |
| ·材料与方法 | 第36-40页 |
| ·样品来源 | 第36页 |
| ·主要实验仪器设备 | 第36-37页 |
| ·主要实验试剂 | 第37页 |
| ·样品的处理及总DNA的提取 | 第37-38页 |
| ·总DNA产物检测 | 第38页 |
| ·18S rDNA基因克隆及引物序列 | 第38-39页 |
| ·腐烂树皮生境中真菌18S rDNA文库的构建 | 第39页 |
| ·基因文库RFLP分析和测序 | 第39-40页 |
| ·微生物多样性分析 | 第40页 |
| ·结果与分析 | 第40-46页 |
| ·树皮腐烂斑样品总DNA的提取 | 第40页 |
| ·真菌通用引物18S rDNA PCR | 第40-41页 |
| ·18S rDNA基因文库的构建和筛选(RFLP) | 第41-42页 |
| ·测序结果比对 | 第42-46页 |
| ·讨论 | 第46-48页 |
| 第3章 测序通量对同一生境中微生物区系分析的影响 | 第48-71页 |
| ·材料与方法 | 第48-52页 |
| ·样品来源 | 第48-49页 |
| ·主要实验仪器设备 | 第49页 |
| ·主要实验试剂 | 第49页 |
| ·样品的处理及总DNA的提取 | 第49页 |
| ·总DNA提取结果检测 | 第49页 |
| ·高通量测序 | 第49-51页 |
| ·16S rDNA基因克隆及引物序列 | 第51页 |
| ·18S rDNA基因克隆及引物序列 | 第51-52页 |
| ·玉米秸秆堆肥生境中细菌及真菌16S/18S rDNA文库的构建 | 第52页 |
| ·基因文库RFLP分析和测序 | 第52页 |
| ·微生物多样性分析 | 第52页 |
| ·PCR-RFLP结果与分析 | 第52-60页 |
| ·玉米秸秆堆肥生境中样品总DNA的提取 | 第52-53页 |
| ·通用引物PCR扩增16S/18S rDNA序列 | 第53-54页 |
| ·16S/18S rDNA基因文库的构建和筛选(RFLP) | 第54-55页 |
| ·PCR-RFLP测序结果比对 | 第55-60页 |
| ·高通量测序结果与分析 | 第60-67页 |
| ·有效序列数据统计 | 第60-61页 |
| ·优化序列数据统计 | 第61-62页 |
| ·16S/18S rDNA序列数据统计 | 第62-63页 |
| ·16S/18S rDNA序列比对结果 | 第63-67页 |
| ·讨论 | 第67-71页 |
| ·PCR-RFLP结果讨论 | 第67-68页 |
| ·Roche 454高通量测序结果讨论 | 第68-69页 |
| ·PCR-RFLP和Roche 454两种测序方法的比较 | 第69-71页 |
| 第4章 玉米秸秆堆肥固态发酵不同区位微生物区系的变化 | 第71-98页 |
| ·材料与方法 | 第71-75页 |
| ·样品来源 | 第71-73页 |
| ·主要实验仪器设备 | 第73页 |
| ·主要实验试剂 | 第73页 |
| ·样品的处理及总DNA的提取 | 第73-74页 |
| ·总DNA提取产物检测 | 第74页 |
| ·送样高通量测序 | 第74页 |
| ·纤维含量的测定 | 第74-75页 |
| ·结果与分析 | 第75-86页 |
| ·堆肥和青贮样品总DNA的提取 | 第75-76页 |
| ·高通量测序有效序列数据统计 | 第76-78页 |
| ·优化序列数据统计 | 第78-80页 |
| ·16S/18S rDNA序列数据统计 | 第80-82页 |
| ·16S/18S rDNA序列比对结果 | 第82-85页 |
| ·未分类序列在不同分类层次上的含量 | 第85-86页 |
| ·纤维含量分析结果 | 第86页 |
| ·讨论 | 第86-98页 |
| ·16S rDNA序列分析 | 第86-92页 |
| ·18S rDNA序列分析 | 第92-98页 |
| 第5章 小麦秸秆堆肥生境中不同发酵阶段微生物区系的变化 | 第98-119页 |
| ·材料与方法 | 第98-101页 |
| ·样品来源 | 第98-100页 |
| ·主要实验仪器 | 第100页 |
| ·主要实验试剂 | 第100页 |
| ·样品的处理及总DNA的提取 | 第100页 |
| ·送样高通量测序 | 第100页 |
| ·纤维含量的测定 | 第100-101页 |
| ·结果与分析 | 第101-115页 |
| ·样品物化性质分析 | 第101-104页 |
| ·样品总DNA的提取 | 第104页 |
| ·高通量测序有效序列数据统计 | 第104-106页 |
| ·优化序列数据统计 | 第106-108页 |
| ·16S/18S rDNA序列数据统计 | 第108-110页 |
| ·16S/18S rDNA序列比对结果 | 第110-114页 |
| ·纤维含量分析结果 | 第114-115页 |
| ·讨论 | 第115-119页 |
| ·物化性质分析结果讨论 | 第115页 |
| ·序列分析 | 第115-119页 |
| 全文总结与展望 | 第119-122页 |
| 全文总结 | 第119-120页 |
| 展望 | 第120-122页 |
| 参考文献 | 第122-127页 |
| 致谢 | 第127-129页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第129页 |
