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玉米Dwarf8基因早开花功能性位点初步关联性分析

摘要第1-4页
Abstract第4-8页
插图和附表清单第8-9页
文献综述第9-24页
 1 玉米早熟的研究意义第9页
 2 玉米等禾本科植物开花期的调控第9-11页
   ·光周期途径(The Photoperiod Pathway)第10页
   ·春化途径(The Vernalization Pathway)第10页
   ·自主途径(The Autonomous Pathway)第10-11页
   ·赤霉素途径(The Gibberellin Pathway)第11页
 3 Dwarf8基因第11-14页
 4 SCAR、SNP等分子标记第14-22页
   ·SCAR标记第14-15页
   ·SNPs标记第15-22页
     ·SNP的检测方法第16-20页
     ·SNP在植物分子生物学中的应用第20页
     ·植物SNP的基因型分型第20-21页
     ·连锁不平衡与关联性分析第21页
     ·基于SNP等标记的关联分析第21-22页
 5 本论文的研究目的与意义、主要研究内容及拟解决的关键问题第22-24页
   ·本论文的研究目的与意义第22-23页
   ·本试验主要研究内容第23页
   ·本试验拟解决的关键性问题第23-24页
材料与方法第24-30页
 1 试验材料第24页
   ·玉米材料第24页
   ·设备、仪器和试剂第24页
     ·设备和仪器第24页
     ·试剂第24页
   ·主要分子生物学软件和统计学软件第24页
 2 实验室试验操作方法第24-28页
   ·基因组DNA提取第24-25页
   ·SCAR试验操作部分第25-26页
     ·SCAR引物的设计第25页
     ·SCAR引物的合成和稀释第25页
     ·SCAR标记的反应体系和条件第25-26页
     ·电泳分析与记录第26页
     ·DNA产物条带的纯化第26页
   ·SNP检测第26-28页
     ·等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)第26-28页
     ·直接测序法第28页
 3 田间鉴定试验第28-29页
   ·试验材料第28页
   ·播种方法第28页
   ·田间设计第28页
   ·调查记载与数据记录第28-29页
 4 群体结构模型与分析方法第29页
 5 关联性分析方法第29页
 6 LD分析第29-30页
结果与分析第30-44页
 1 根据生育期等表型分析自交系表型多样性第30-31页
 2 SSR数据群体结构分析第31-37页
   ·供试材料的群体结构分析第31-32页
   ·亚群之间的Kullback-Leibler距离第32页
   ·供试自交系来源于不同种质类群的遗传构成第32-37页
 3 Dwarf8基因型分析第37-43页
   ·MITE185位点第37-39页
   ·SNP标记试验第39-43页
     ·等位基因特异性PCR电泳图(1664位点)第39-42页
     ·直接测序法3473(G/T)、3491(G/A)位点第42-43页
 5 初步关联性分析第43-44页
讨论第44-47页
 1 等位基因特异性PCR技术的可行性第44页
 2 富含GC碱基的DNA片断的PCR扩增第44-45页
 3 玉米候选基因功能性SNP的发掘和与表型性状关联性分析第45-47页
参考文献第47-55页
附录第55-68页
 1.Dwarf8基因全序列第55-58页
 2.北京、哈尔滨、三亚三地开花期田间调查表第58-68页
致谢第68-69页
作者简介第69页

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